More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2221 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_08766  adenylosuccinate synthetase  79.91 
 
 		 423 aa  717    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0287341  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2221  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 423 aa  868    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44855  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0248  adenylosuccinate synthetase  79.2 
 
 		 423 aa  706    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1202  adenylosuccinate synthetase  64.13 
 
 		 425 aa  567  1e-160  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.609737  normal  0.550164 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4579  adenylosuccinate synthetase  59.91 
 
 		 431 aa  532  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.730826  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0464  adenylosuccinate synthetase  59.86 
 
 		 423 aa  529  1e-149  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1608  adenylosuccinate synthetase  59.24 
 
 		 428 aa  527  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.395219  normal  0.555835 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1701  adenylosuccinate synthetase  58.59 
 
 		 431 aa  515  1.0000000000000001e-145  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.401877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7050  adenylosuccinate synthetase  55.87 
 
 		 432 aa  507  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5638  adenylosuccinate synthetase  54.01 
 
 		 424 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0744769  normal  0.421988 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2196  adenylosuccinate synthetase  49.3 
 
 		 434 aa  421  1e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1816  adenylosuccinate synthetase  48.46 
 
 		 434 aa  421  1e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2262  adenylosuccinate synthetase  48.94 
 
 		 429 aa  414  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0914846 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0213  adenylosuccinate synthetase  48 
 
 		 434 aa  410  1e-113  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.816026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2390  adenylosuccinate synthetase  47.99 
 
 		 434 aa  410  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2031  adenylosuccinate synthetase  48.24 
 
 		 435 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  47.41 
 
 		 433 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 		 430 aa  395  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0322  adenylosuccinate synthetase  46.1 
 
 		 434 aa  395  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1282  adenylosuccinate synthetase  47.97 
 
 		 431 aa  392  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  47.38 
 
 		 433 aa  389  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0330  adenylosuccinate synthetase  47.75 
 
 		 431 aa  388  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  47.86 
 
 		 432 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2764  adenylosuccinate synthase  47.65 
 
 		 431 aa  390  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  47.14 
 
 		 432 aa  386  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  46.23 
 
 		 427 aa  387  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  46.81 
 
 		 428 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  46.1 
 
 		 428 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4889  adenylosuccinate synthetase  47.26 
 
 		 430 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0250802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  47.02 
 
 		 430 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  45.9 
 
 		 427 aa  382  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0607  adenylosuccinate synthetase  46.92 
 
 		 432 aa  382  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.272974 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4765  adenylosuccinate synthetase  47.26 
 
 		 430 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0528  adenylosuccinate synthetase  47.52 
 
 		 429 aa  383  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650318  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4680  adenylosuccinate synthetase  47.26 
 
 		 430 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  47.03 
 
 		 430 aa  384  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02633  adenylosuccinate synthetase  47.17 
 
 		 430 aa  382  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  45.39 
 
 		 426 aa  382  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1271  adenylosuccinate synthetase  45.84 
 
 		 429 aa  382  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231459  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4941  adenylosuccinate synthetase  47.26 
 
 		 430 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348011 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  46.03 
 
 		 451 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  47.2 
 
 		 432 aa  379  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  46.92 
 
 		 431 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0524  adenylosuccinate synthetase  45.97 
 
 		 432 aa  379  1e-104  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0370  adenylosuccinate synthetase  46.34 
 
 		 416 aa  380  1e-104  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0409344  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0677  adenylosuccinate synthetase  47.62 
 
 		 429 aa  375  1e-103  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1370  adenylosuccinate synthetase  46.24 
 
 		 416 aa  375  1e-103  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0641  adenylosuccinate synthetase  47.28 
 
 		 431 aa  375  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143682 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1939  adenylosuccinate synthetase  45.33 
 
 		 428 aa  375  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0540  adenylosuccinate synthetase  45.52 
 
 		 432 aa  377  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311763  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  46.23 
 
 		 428 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  44.44 
 
 		 429 aa  375  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1328  adenylosuccinate synthetase  46.67 
 
 		 432 aa  376  1e-103  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  46.46 
 
 		 427 aa  375  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1810  adenylosuccinate synthetase  47.04 
 
 		 429 aa  377  1e-103  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.2738  normal  0.518624 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  48.23 
 
 		 430 aa  377  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  45.05 
 
 		 427 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4937  adenylosuccinate synthetase  45.82 
 
 		 430 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5667  adenylosuccinate synthetase  46.79 
 
 		 430 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  45.52 
 
 		 427 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0069  adenylosuccinate synthetase  46.7 
 
 		 432 aa  373  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215485  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3013  adenylosuccinate synthetase  47.51 
 
 		 430 aa  372  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.220071  normal  0.0269955 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1939  adenylosuccinate synthetase  46.06 
 
 		 431 aa  375  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00585  adenylosuccinate synthetase  47.14 
 
 		 432 aa  374  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  45.75 
 
 		 427 aa  374  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3291  adenylosuccinate synthetase  47.86 
 
 		 431 aa  374  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000376094  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1784  adenylosuccinate synthetase  47.16 
 
 		 430 aa  373  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0645  adenylosuccinate synthetase  47.48 
 
 		 429 aa  374  1e-102  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1281  adenylosuccinate synthetase  45.94 
 
 		 446 aa  374  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4219  adenylosuccinate synthetase  47.14 
 
 		 431 aa  372  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000317238  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3266  adenylosuccinate synthetase  47.52 
 
 		 431 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000110825  hitchhiker  0.0000153755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0681  adenylosuccinate synthetase  47.52 
 
 		 431 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00011524  hitchhiker  0.00031126 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65230  adenylosuccinate synthetase  46.79 
 
 		 430 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0747  adenylosuccinate synthetase  47.75 
 
 		 431 aa  373  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000703533  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  44.92 
 
 		 430 aa  374  1e-102  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0695  adenylosuccinate synthetase  47.52 
 
 		 431 aa  372  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000192259  hitchhiker  0.0000489804 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3069  adenylosuccinate synthetase  47.42 
 
 		 431 aa  374  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00455582  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3592  adenylosuccinate synthetase  47.62 
 
 		 431 aa  371  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000897035  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0726  adenylosuccinate synthetase  47.75 
 
 		 431 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0654832  hitchhiker  0.0000471969 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2266  adenylosuccinate synthetase  44.73 
 
 		 425 aa  368  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  44.68 
 
 		 430 aa  371  1e-101  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3937  adenylosuccinate synthetase  47.52 
 
 		 431 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2029  adenylosuccinate synthetase  45.05 
 
 		 429 aa  370  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00381049  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0577  adenylosuccinate synthetase  45.58 
 
 		 430 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0750  adenylosuccinate synthetase  47.38 
 
 		 431 aa  371  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000682785  hitchhiker  0.00737735 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  46.08 
 
 		 431 aa  370  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3649  adenylosuccinate synthetase  47.75 
 
 		 431 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000709559  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  44.88 
 
 		 427 aa  369  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0705  adenylosuccinate synthetase  47.52 
 
 		 431 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00343177  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0330  adenylosuccinate synthetase  44.18 
 
 		 428 aa  371  1e-101  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0735  adenylosuccinate synthetase  47.99 
 
 		 431 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000671232  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1719  adenylosuccinate synthetase  46.92 
 
 		 430 aa  371  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  43.97 
 
 		 430 aa  369  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0941  adenylosuccinate synthetase  45.37 
 
 		 435 aa  370  1e-101  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3019  adenylosuccinate synthetase  45.2 
 
 		 424 aa  369  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0215  adenylosuccinate synthetase  46.7 
 
 		 432 aa  369  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1049  adenylosuccinate synthetase  45.13 
 
 		 435 aa  370  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2598  adenylosuccinate synthetase  46.19 
 
 		 432 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0051551  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2661  adenylosuccinate synthetase  46.54 
 
 		 431 aa  365  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0676  adenylosuccinate synthetase  44.96 
 
 		 446 aa  368  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.678663  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>