More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4579 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4579  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 431 aa  882    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.730826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1608  adenylosuccinate synthetase  77.99 
 
 		 428 aa  701    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.395219  normal  0.555835 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1701  adenylosuccinate synthetase  65.96 
 
 		 431 aa  590  1e-167  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.401877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0248  adenylosuccinate synthetase  61.08 
 
 		 423 aa  536  1e-151  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2221  adenylosuccinate synthetase  59.91 
 
 		 423 aa  532  1e-150  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44855  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1202  adenylosuccinate synthetase  61.81 
 
 		 425 aa  530  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.609737  normal  0.550164 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08766  adenylosuccinate synthetase  59.67 
 
 		 423 aa  522  1e-147  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0287341  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0464  adenylosuccinate synthetase  59.15 
 
 		 423 aa  502  1e-141  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7050  adenylosuccinate synthetase  55.09 
 
 		 432 aa  501  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5638  adenylosuccinate synthetase  55.16 
 
 		 424 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0744769  normal  0.421988 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2262  adenylosuccinate synthetase  48.84 
 
 		 429 aa  404  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0914846 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0213  adenylosuccinate synthetase  48.71 
 
 		 434 aa  394  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.816026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1816  adenylosuccinate synthetase  48.86 
 
 		 434 aa  394  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0322  adenylosuccinate synthetase  47.49 
 
 		 434 aa  389  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2031  adenylosuccinate synthetase  48.39 
 
 		 435 aa  388  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2390  adenylosuccinate synthetase  48.37 
 
 		 434 aa  389  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2196  adenylosuccinate synthetase  48.13 
 
 		 434 aa  390  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0540  adenylosuccinate synthetase  48.46 
 
 		 432 aa  385  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311763  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1282  adenylosuccinate synthetase  48.46 
 
 		 431 aa  385  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3868  adenylosuccinate synthetase  45.2 
 
 		 442 aa  387  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.838486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1370  adenylosuccinate synthetase  47.16 
 
 		 416 aa  380  1e-104  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3648  adenylosuccinate synthetase  46.71 
 
 		 432 aa  378  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0694  adenylosuccinate synthetase  46.71 
 
 		 432 aa  378  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1049  adenylosuccinate synthetase  46.51 
 
 		 435 aa  376  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3793  adenylosuccinate synthetase  46.71 
 
 		 432 aa  378  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  47.03 
 
 		 430 aa  378  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3914  adenylosuccinate synthetase  47.29 
 
 		 432 aa  375  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.923104  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0497  adenylosuccinate synthetase  47.04 
 
 		 432 aa  377  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  46.65 
 
 		 433 aa  377  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04044  adenylosuccinate synthetase  46.96 
 
 		 432 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3816  Adenylosuccinate synthase  46.96 
 
 		 432 aa  374  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4420  adenylosuccinate synthetase  46.96 
 
 		 432 aa  374  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3836  adenylosuccinate synthetase  46.96 
 
 		 432 aa  374  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.930032  hitchhiker  0.00000195768 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4644  adenylosuccinate synthetase  46.73 
 
 		 432 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0436  adenylosuccinate synthetase  46.5 
 
 		 432 aa  374  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000472279 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5693  adenylosuccinate synthetase  46.96 
 
 		 432 aa  374  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.580203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4784  adenylosuccinate synthetase  46.73 
 
 		 432 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0941  adenylosuccinate synthetase  46.28 
 
 		 435 aa  374  1e-102  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00585  adenylosuccinate synthetase  46.73 
 
 		 432 aa  372  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  46.92 
 
 		 430 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5667  adenylosuccinate synthetase  47.92 
 
 		 430 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4736  adenylosuccinate synthetase  46.96 
 
 		 432 aa  374  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4648  adenylosuccinate synthetase  46.96 
 
 		 432 aa  374  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.378806 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4727  adenylosuccinate synthetase  46.73 
 
 		 432 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4708  adenylosuccinate synthetase  46.96 
 
 		 432 aa  374  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04006  hypothetical protein  46.96 
 
 		 432 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0524  adenylosuccinate synthetase  44.73 
 
 		 432 aa  374  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0215  adenylosuccinate synthetase  46.7 
 
 		 432 aa  373  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1328  adenylosuccinate synthetase  46.67 
 
 		 432 aa  372  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3716  adenylosuccinate synthetase  47.43 
 
 		 432 aa  375  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316289  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3069  adenylosuccinate synthetase  47.21 
 
 		 431 aa  374  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00455582  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  47.74 
 
 		 433 aa  371  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0360  adenylosuccinate synthetase  46.5 
 
 		 432 aa  370  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.655854  hitchhiker  0.00425653 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4763  adenylosuccinate synthetase  46.73 
 
 		 432 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.707154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0641  adenylosuccinate synthetase  47.29 
 
 		 431 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143682 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3649  adenylosuccinate synthetase  47.38 
 
 		 431 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000709559  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0735  adenylosuccinate synthetase  47.62 
 
 		 431 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000671232  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  47.31 
 
 		 431 aa  369  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2626  adenylosuccinate synthase  47.02 
 
 		 437 aa  371  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000737689 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3592  adenylosuccinate synthetase  48.1 
 
 		 431 aa  372  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000897035  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2764  adenylosuccinate synthase  46.21 
 
 		 431 aa  370  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4634  adenylosuccinate synthetase  46.73 
 
 		 432 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  45.99 
 
 		 432 aa  370  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3266  adenylosuccinate synthetase  46.81 
 
 		 431 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000110825  hitchhiker  0.0000153755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0681  adenylosuccinate synthetase  46.81 
 
 		 431 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00011524  hitchhiker  0.00031126 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3357  adenylosuccinate synthetase  47.17 
 
 		 431 aa  370  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0113184  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65230  adenylosuccinate synthetase  47.69 
 
 		 430 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0695  adenylosuccinate synthetase  46.81 
 
 		 431 aa  369  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000192259  hitchhiker  0.0000489804 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0330  adenylosuccinate synthetase  46.93 
 
 		 431 aa  366  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0705  adenylosuccinate synthetase  47.14 
 
 		 431 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00343177  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3937  adenylosuccinate synthetase  46.81 
 
 		 431 aa  367  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00089  adenylosuccinate synthetase  46.3 
 
 		 438 aa  365  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0607  adenylosuccinate synthetase  48 
 
 		 432 aa  367  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.272974 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0528  adenylosuccinate synthetase  47.78 
 
 		 429 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650318  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0075  adenylosuccinate synthetase  46.46 
 
 		 419 aa  367  1e-100  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  46.77 
 
 		 427 aa  366  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02633  adenylosuccinate synthetase  47.03 
 
 		 430 aa  365  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2661  adenylosuccinate synthetase  46.51 
 
 		 431 aa  365  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  45.09 
 
 		 426 aa  365  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0726  adenylosuccinate synthetase  46.93 
 
 		 431 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0654832  hitchhiker  0.0000471969 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  46.56 
 
 		 431 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0747  adenylosuccinate synthetase  47.38 
 
 		 431 aa  368  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000703533  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1784  adenylosuccinate synthetase  47.2 
 
 		 430 aa  366  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3291  adenylosuccinate synthetase  46.9 
 
 		 431 aa  368  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000376094  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4219  adenylosuccinate synthetase  47.14 
 
 		 431 aa  368  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000317238  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0509  adenylosuccinate synthetase  46.67 
 
 		 431 aa  365  1e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00567032  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0750  adenylosuccinate synthetase  47.26 
 
 		 431 aa  363  2e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000682785  hitchhiker  0.00737735 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0578  adenylosuccinate synthetase  46.24 
 
 		 432 aa  363  2e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000001206 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4680  adenylosuccinate synthetase  46.14 
 
 		 430 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1719  adenylosuccinate synthetase  46.96 
 
 		 430 aa  363  3e-99  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1939  adenylosuccinate synthetase  46.62 
 
 		 431 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07600  Adenylosuccinate synthetase  46.35 
 
 		 430 aa  362  6e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3013  adenylosuccinate synthetase  47.66 
 
 		 430 aa  362  6e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.220071  normal  0.0269955 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0370  adenylosuccinate synthetase  44.84 
 
 		 416 aa  362  7.0000000000000005e-99  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0409344  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0330  adenylosuccinate synthetase  45.18 
 
 		 428 aa  362  8e-99  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2585  adenylosuccinate synthase  45.86 
 
 		 431 aa  362  9e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4889  adenylosuccinate synthetase  45.9 
 
 		 430 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0250802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4941  adenylosuccinate synthetase  45.9 
 
 		 430 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348011 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4765  adenylosuccinate synthetase  45.9 
 
 		 430 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002264  adenylosuccinate synthetase  44.68 
 
 		 438 aa  360  2e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.151372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>