More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1608 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1608  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 428 aa  882    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.395219  normal  0.555835 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4579  adenylosuccinate synthetase  77.99 
 
 		 431 aa  701    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.730826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1701  adenylosuccinate synthetase  66.27 
 
 		 431 aa  584  1.0000000000000001e-165  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.401877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0248  adenylosuccinate synthetase  63.03 
 
 		 423 aa  550  1e-155  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1202  adenylosuccinate synthetase  61.72 
 
 		 425 aa  535  1e-151  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.609737  normal  0.550164 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08766  adenylosuccinate synthetase  61.61 
 
 		 423 aa  537  1e-151  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0287341  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2221  adenylosuccinate synthetase  59.24 
 
 		 423 aa  527  1e-148  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44855  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0464  adenylosuccinate synthetase  59.91 
 
 		 423 aa  517  1.0000000000000001e-145  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7050  adenylosuccinate synthetase  56.25 
 
 		 432 aa  501  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5638  adenylosuccinate synthetase  54.35 
 
 		 424 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0744769  normal  0.421988 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3868  adenylosuccinate synthetase  47.89 
 
 		 442 aa  398  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.838486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  48.11 
 
 		 432 aa  390  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2262  adenylosuccinate synthetase  47.29 
 
 		 429 aa  389  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0914846 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2196  adenylosuccinate synthetase  46.26 
 
 		 434 aa  387  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0213  adenylosuccinate synthetase  46.73 
 
 		 434 aa  382  1e-105  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.816026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1816  adenylosuccinate synthetase  46.81 
 
 		 434 aa  382  1e-105  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2390  adenylosuccinate synthetase  46.5 
 
 		 434 aa  383  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0322  adenylosuccinate synthetase  47.43 
 
 		 434 aa  383  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  47.64 
 
 		 427 aa  378  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1049  adenylosuccinate synthetase  46.4 
 
 		 435 aa  376  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  45.07 
 
 		 433 aa  378  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0524  adenylosuccinate synthetase  45.43 
 
 		 432 aa  375  1e-103  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  47.54 
 
 		 430 aa  375  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3592  adenylosuccinate synthetase  47.14 
 
 		 431 aa  372  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000897035  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0941  adenylosuccinate synthetase  46.17 
 
 		 435 aa  373  1e-102  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0330  adenylosuccinate synthetase  47.39 
 
 		 428 aa  375  1e-102  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3069  adenylosuccinate synthetase  46.05 
 
 		 431 aa  374  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00455582  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0735  adenylosuccinate synthetase  47.17 
 
 		 431 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000671232  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3937  adenylosuccinate synthetase  46.9 
 
 		 431 aa  369  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3793  adenylosuccinate synthetase  45.43 
 
 		 432 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  45.41 
 
 		 427 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1282  adenylosuccinate synthetase  46.6 
 
 		 431 aa  370  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0694  adenylosuccinate synthetase  45.43 
 
 		 432 aa  370  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1784  adenylosuccinate synthetase  47.18 
 
 		 430 aa  369  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3357  adenylosuccinate synthetase  47.14 
 
 		 431 aa  370  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0113184  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65230  adenylosuccinate synthetase  47.04 
 
 		 430 aa  368  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3648  adenylosuccinate synthetase  45.43 
 
 		 432 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1271  adenylosuccinate synthetase  45.88 
 
 		 429 aa  372  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231459  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0695  adenylosuccinate synthetase  47.14 
 
 		 431 aa  370  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000192259  hitchhiker  0.0000489804 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  46.79 
 
 		 433 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1719  adenylosuccinate synthetase  46.95 
 
 		 430 aa  367  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0705  adenylosuccinate synthetase  46.93 
 
 		 431 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00343177  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2031  adenylosuccinate synthetase  44.79 
 
 		 435 aa  367  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  47.42 
 
 		 431 aa  365  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  46.32 
 
 		 431 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00585  adenylosuccinate synthetase  46.01 
 
 		 432 aa  367  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3649  adenylosuccinate synthetase  46.93 
 
 		 431 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000709559  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0509  adenylosuccinate synthetase  46.43 
 
 		 431 aa  367  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00567032  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5667  adenylosuccinate synthetase  46.81 
 
 		 430 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0540  adenylosuccinate synthetase  45.37 
 
 		 432 aa  366  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311763  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3266  adenylosuccinate synthetase  46.9 
 
 		 431 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000110825  hitchhiker  0.0000153755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0681  adenylosuccinate synthetase  46.9 
 
 		 431 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00011524  hitchhiker  0.00031126 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07600  Adenylosuccinate synthetase  46.48 
 
 		 430 aa  365  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4219  adenylosuccinate synthetase  46.19 
 
 		 431 aa  367  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000317238  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2126  adenylosuccinate synthetase  44.37 
 
 		 428 aa  365  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0747  adenylosuccinate synthetase  46.9 
 
 		 431 aa  365  1e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000703533  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3291  adenylosuccinate synthetase  45.95 
 
 		 431 aa  365  1e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000376094  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1328  adenylosuccinate synthetase  46.73 
 
 		 432 aa  365  1e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3716  adenylosuccinate synthetase  45.43 
 
 		 432 aa  364  2e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316289  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0497  adenylosuccinate synthetase  44.42 
 
 		 432 aa  364  2e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0726  adenylosuccinate synthetase  46.7 
 
 		 431 aa  364  2e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0654832  hitchhiker  0.0000471969 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3914  adenylosuccinate synthetase  45.67 
 
 		 432 aa  364  2e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.923104  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2144  adenylosuccinate synthase  44.84 
 
 		 430 aa  363  3e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  45.43 
 
 		 427 aa  363  4e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0360  adenylosuccinate synthetase  45.2 
 
 		 432 aa  362  6e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.655854  hitchhiker  0.00425653 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  43.84 
 
 		 427 aa  362  7.0000000000000005e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  45.13 
 
 		 430 aa  362  8e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0330  adenylosuccinate synthetase  46.84 
 
 		 431 aa  362  1e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  44.76 
 
 		 424 aa  361  1e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002264  adenylosuccinate synthetase  44.65 
 
 		 438 aa  361  1e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.151372  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  45.43 
 
 		 430 aa  362  1e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1810  adenylosuccinate synthetase  45.65 
 
 		 429 aa  360  2e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.2738  normal  0.518624 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4680  adenylosuccinate synthetase  46.1 
 
 		 430 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2419  adenylosuccinate synthetase  44 
 
 		 424 aa  361  2e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000351382  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02633  adenylosuccinate synthetase  46.92 
 
 		 430 aa  361  2e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2533  adenylosuccinate synthase  44.94 
 
 		 426 aa  361  2e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000265596  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  46.17 
 
 		 430 aa  361  2e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04044  adenylosuccinate synthetase  45.43 
 
 		 432 aa  360  3e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3816  Adenylosuccinate synthase  45.43 
 
 		 432 aa  360  3e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4889  adenylosuccinate synthetase  45.86 
 
 		 430 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0250802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4648  adenylosuccinate synthetase  45.43 
 
 		 432 aa  360  3e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.378806 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4420  adenylosuccinate synthetase  45.43 
 
 		 432 aa  360  3e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5693  adenylosuccinate synthetase  45.43 
 
 		 432 aa  360  3e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.580203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0750  adenylosuccinate synthetase  46.19 
 
 		 431 aa  360  3e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000682785  hitchhiker  0.00737735 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4708  adenylosuccinate synthetase  45.43 
 
 		 432 aa  360  3e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3836  adenylosuccinate synthetase  45.43 
 
 		 432 aa  360  3e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.930032  hitchhiker  0.00000195768 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0075  adenylosuccinate synthetase  47.18 
 
 		 419 aa  360  3e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4736  adenylosuccinate synthetase  45.43 
 
 		 432 aa  360  3e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0215  adenylosuccinate synthetase  45.22 
 
 		 432 aa  360  3e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4765  adenylosuccinate synthetase  45.86 
 
 		 430 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04006  hypothetical protein  45.43 
 
 		 432 aa  360  3e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4941  adenylosuccinate synthetase  45.86 
 
 		 430 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348011 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0641  adenylosuccinate synthetase  46.35 
 
 		 431 aa  359  4e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143682 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4784  adenylosuccinate synthetase  45.2 
 
 		 432 aa  359  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4727  adenylosuccinate synthetase  45.2 
 
 		 432 aa  359  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00089  adenylosuccinate synthetase  45.35 
 
 		 438 aa  359  5e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  44.65 
 
 		 427 aa  358  7e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  44.13 
 
 		 427 aa  358  7e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4644  adenylosuccinate synthetase  45.2 
 
 		 432 aa  358  8e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4763  adenylosuccinate synthetase  45.2 
 
 		 432 aa  358  9e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.707154  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>