More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_08766 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0248  adenylosuccinate synthetase  77.54 
 
 		 423 aa  699    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08766  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 423 aa  869    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0287341  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2221  adenylosuccinate synthetase  79.91 
 
 		 423 aa  717    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44855  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1202  adenylosuccinate synthetase  64.85 
 
 		 425 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.609737  normal  0.550164 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1608  adenylosuccinate synthetase  61.61 
 
 		 428 aa  537  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.395219  normal  0.555835 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4579  adenylosuccinate synthetase  59.67 
 
 		 431 aa  522  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.730826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1701  adenylosuccinate synthetase  59.1 
 
 		 431 aa  520  1e-146  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.401877  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0464  adenylosuccinate synthetase  58.91 
 
 		 423 aa  516  1.0000000000000001e-145  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7050  adenylosuccinate synthetase  55.14 
 
 		 432 aa  500  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5638  adenylosuccinate synthetase  51.89 
 
 		 424 aa  428  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0744769  normal  0.421988 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1816  adenylosuccinate synthetase  48.94 
 
 		 434 aa  418  1e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2196  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 		 434 aa  420  1e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0213  adenylosuccinate synthetase  49.07 
 
 		 434 aa  412  1e-114  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.816026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2262  adenylosuccinate synthetase  48.34 
 
 		 429 aa  409  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0914846 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0322  adenylosuccinate synthetase  47.66 
 
 		 434 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  48.24 
 
 		 433 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2390  adenylosuccinate synthetase  47.63 
 
 		 434 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2031  adenylosuccinate synthetase  49.65 
 
 		 435 aa  403  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1271  adenylosuccinate synthetase  47.53 
 
 		 429 aa  396  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231459  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  46.46 
 
 		 433 aa  391  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  47.76 
 
 		 430 aa  391  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  48.11 
 
 		 430 aa  389  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  47.2 
 
 		 451 aa  385  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0360  adenylosuccinate synthetase  46.56 
 
 		 432 aa  385  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.655854  hitchhiker  0.00425653 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  45.99 
 
 		 430 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  46.95 
 
 		 427 aa  387  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1282  adenylosuccinate synthetase  47.02 
 
 		 431 aa  388  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0524  adenylosuccinate synthetase  46.1 
 
 		 432 aa  385  1e-106  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2764  adenylosuccinate synthase  48.33 
 
 		 431 aa  382  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0330  adenylosuccinate synthetase  46.92 
 
 		 431 aa  383  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0607  adenylosuccinate synthetase  48.1 
 
 		 432 aa  384  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.272974 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0540  adenylosuccinate synthetase  46.32 
 
 		 432 aa  384  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311763  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  46.35 
 
 		 432 aa  382  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  46.24 
 
 		 427 aa  382  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  47.39 
 
 		 432 aa  382  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2029  adenylosuccinate synthetase  46.73 
 
 		 429 aa  382  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00381049  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  46.37 
 
 		 428 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  46.84 
 
 		 431 aa  382  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0941  adenylosuccinate synthetase  46.32 
 
 		 435 aa  379  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0436  adenylosuccinate synthetase  46.08 
 
 		 432 aa  381  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000472279 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  45.82 
 
 		 430 aa  381  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3716  adenylosuccinate synthetase  44.89 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316289  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3648  adenylosuccinate synthetase  45.71 
 
 		 432 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  45.88 
 
 		 432 aa  379  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3793  adenylosuccinate synthetase  45.71 
 
 		 432 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1328  adenylosuccinate synthetase  46.43 
 
 		 432 aa  379  1e-104  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0694  adenylosuccinate synthetase  45.71 
 
 		 432 aa  379  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0330  adenylosuccinate synthetase  45.84 
 
 		 428 aa  381  1e-104  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04044  adenylosuccinate synthetase  45.37 
 
 		 432 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3816  Adenylosuccinate synthase  45.37 
 
 		 432 aa  377  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4708  adenylosuccinate synthetase  45.37 
 
 		 432 aa  377  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  45.75 
 
 		 427 aa  376  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3937  adenylosuccinate synthetase  47.51 
 
 		 431 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04006  hypothetical protein  45.37 
 
 		 432 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3291  adenylosuccinate synthetase  47.62 
 
 		 431 aa  378  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000376094  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3019  adenylosuccinate synthetase  47.1 
 
 		 424 aa  377  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4763  adenylosuccinate synthetase  45.37 
 
 		 432 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.707154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4644  adenylosuccinate synthetase  45.37 
 
 		 432 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4727  adenylosuccinate synthetase  45.13 
 
 		 432 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2909  Adenylosuccinate synthetase  45.54 
 
 		 429 aa  377  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2772  adenylosuccinate synthetase  46.6 
 
 		 438 aa  376  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1939  adenylosuccinate synthetase  46.78 
 
 		 431 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4784  adenylosuccinate synthetase  45.13 
 
 		 432 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0747  adenylosuccinate synthetase  47.62 
 
 		 431 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000703533  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4634  adenylosuccinate synthetase  45.37 
 
 		 432 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5693  adenylosuccinate synthetase  45.37 
 
 		 432 aa  377  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.580203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  46.28 
 
 		 427 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0497  adenylosuccinate synthetase  44.18 
 
 		 432 aa  375  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3914  adenylosuccinate synthetase  44.89 
 
 		 432 aa  377  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.923104  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4219  adenylosuccinate synthetase  47.14 
 
 		 431 aa  378  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000317238  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4648  adenylosuccinate synthetase  45.37 
 
 		 432 aa  377  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.378806 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02633  adenylosuccinate synthetase  48 
 
 		 430 aa  378  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3649  adenylosuccinate synthetase  47.62 
 
 		 431 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000709559  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3592  adenylosuccinate synthetase  47.86 
 
 		 431 aa  378  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000897035  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1784  adenylosuccinate synthetase  47.38 
 
 		 430 aa  376  1e-103  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0735  adenylosuccinate synthetase  47.86 
 
 		 431 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000671232  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3266  adenylosuccinate synthetase  47.51 
 
 		 431 aa  378  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000110825  hitchhiker  0.0000153755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0681  adenylosuccinate synthetase  47.51 
 
 		 431 aa  378  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00011524  hitchhiker  0.00031126 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4736  adenylosuccinate synthetase  45.37 
 
 		 432 aa  377  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3836  adenylosuccinate synthetase  45.37 
 
 		 432 aa  377  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.930032  hitchhiker  0.00000195768 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0705  adenylosuccinate synthetase  47.62 
 
 		 431 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00343177  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4420  adenylosuccinate synthetase  45.37 
 
 		 432 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0695  adenylosuccinate synthetase  47.51 
 
 		 431 aa  377  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000192259  hitchhiker  0.0000489804 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002264  adenylosuccinate synthetase  46.73 
 
 		 438 aa  378  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.151372  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1049  adenylosuccinate synthetase  46.08 
 
 		 435 aa  378  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4889  adenylosuccinate synthetase  46.67 
 
 		 430 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0250802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0750  adenylosuccinate synthetase  47.38 
 
 		 431 aa  374  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000682785  hitchhiker  0.00737735 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4941  adenylosuccinate synthetase  46.67 
 
 		 430 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348011 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0641  adenylosuccinate synthetase  47.51 
 
 		 431 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143682 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1719  adenylosuccinate synthetase  47.14 
 
 		 430 aa  374  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  44.92 
 
 		 428 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  45.75 
 
 		 427 aa  372  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2266  adenylosuccinate synthetase  46.6 
 
 		 425 aa  374  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2661  adenylosuccinate synthetase  47.41 
 
 		 431 aa  373  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5667  adenylosuccinate synthetase  46.78 
 
 		 430 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1370  adenylosuccinate synthetase  45.58 
 
 		 416 aa  374  1e-102  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3069  adenylosuccinate synthetase  46.92 
 
 		 431 aa  374  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00455582  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3357  adenylosuccinate synthetase  47.38 
 
 		 431 aa  374  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0113184  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65230  adenylosuccinate synthetase  47.02 
 
 		 430 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4765  adenylosuccinate synthetase  46.67 
 
 		 430 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>