More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0213 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0213  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 
434 aa  897    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.816026  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1816  adenylosuccinate synthetase  82.26 
 
 
434 aa  756    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2196  adenylosuccinate synthetase  84.33 
 
 
434 aa  775    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2031  adenylosuccinate synthetase  78.72 
 
 
435 aa  708    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2262  adenylosuccinate synthetase  77.41 
 
 
429 aa  701    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0914846 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0322  adenylosuccinate synthetase  84.33 
 
 
434 aa  772    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2390  adenylosuccinate synthetase  82.49 
 
 
434 aa  765    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  60.24 
 
 
433 aa  533  1e-150  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  52.48 
 
 
427 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  51.06 
 
 
433 aa  448  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0492  adenylosuccinate synthetase  54.35 
 
 
428 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  53.1 
 
 
427 aa  445  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  51.07 
 
 
447 aa  441  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  51.07 
 
 
431 aa  442  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  52.86 
 
 
427 aa  442  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  51.9 
 
 
427 aa  438  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  52.14 
 
 
427 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  49.76 
 
 
430 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  51.07 
 
 
447 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  50.36 
 
 
426 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  50.95 
 
 
427 aa  436  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  48.93 
 
 
444 aa  434  1e-120  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 
430 aa  433  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0139  adenylosuccinate synthetase  52.26 
 
 
429 aa  431  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000561019 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  48.69 
 
 
447 aa  430  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07421  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 
439 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0133  adenylosuccinate synthase  51.9 
 
 
807 aa  430  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279104  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  49.76 
 
 
431 aa  431  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3282  adenylosuccinate synthetase  49.28 
 
 
437 aa  431  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00809393  normal  0.019729 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  48.45 
 
 
444 aa  429  1e-119  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  48.81 
 
 
430 aa  428  1e-119  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0176  adenylosuccinate synthetase  52.62 
 
 
427 aa  430  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386224  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  49.05 
 
 
430 aa  426  1e-118  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05071  adenylosuccinate synthetase  49.4 
 
 
437 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.22054  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1839  adenylosuccinate synthetase  49.17 
 
 
437 aa  425  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  49.16 
 
 
449 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3868  adenylosuccinate synthetase  47.49 
 
 
442 aa  426  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.838486  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05641  adenylosuccinate synthetase  49.17 
 
 
437 aa  425  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.622975 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  49.29 
 
 
430 aa  427  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  50.47 
 
 
430 aa  426  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 
432 aa  425  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 
432 aa  425  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0248  adenylosuccinate synthetase  49.53 
 
 
423 aa  423  1e-117  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0641  adenylosuccinate synthetase  51.31 
 
 
431 aa  424  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143682 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  49.29 
 
 
427 aa  423  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10362  adenylosuccinate synthetase  51.77 
 
 
432 aa  422  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698825  normal  0.94506 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  48.58 
 
 
427 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  48.94 
 
 
427 aa  421  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  49.17 
 
 
427 aa  421  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  47.62 
 
 
428 aa  420  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  47.62 
 
 
429 aa  421  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2207  adenylosuccinate synthetase  50 
 
 
430 aa  419  1e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11510  Adenylosuccinate synthetase  49.65 
 
 
434 aa  420  1e-116  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1523  adenylosuccinate synthetase  49.06 
 
 
442 aa  421  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000140547  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  48.46 
 
 
432 aa  419  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  46.68 
 
 
428 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0025  adenylosuccinate synthetase  48.1 
 
 
426 aa  416  9.999999999999999e-116  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.993316  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  48.93 
 
 
427 aa  417  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0691  adenylosuccinate synthetase  48.56 
 
 
439 aa  416  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2029  adenylosuccinate synthetase  48.69 
 
 
429 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00381049  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0330  adenylosuccinate synthetase  48.1 
 
 
428 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5667  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 
430 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1202  adenylosuccinate synthetase  52.12 
 
 
425 aa  417  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.609737  normal  0.550164 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3089  adenylosuccinate synthetase  49.29 
 
 
432 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126084  normal  0.070043 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65230  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 
430 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2126  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 
428 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  47.14 
 
 
428 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08766  adenylosuccinate synthetase  49.07 
 
 
423 aa  412  1e-114  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0287341  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05631  adenylosuccinate synthetase  49.52 
 
 
436 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23100  Adenylosuccinate synthase  51.67 
 
 
428 aa  413  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4937  adenylosuccinate synthetase  49.76 
 
 
430 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0577  adenylosuccinate synthetase  49.76 
 
 
430 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2965  adenylosuccinate synthetase  48.33 
 
 
430 aa  412  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.125391  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0528  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 
429 aa  413  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650318  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1667  adenylosuccinate synthetase  47.75 
 
 
439 aa  412  1e-114  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0075  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 
419 aa  414  1e-114  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1049  adenylosuccinate synthetase  47.62 
 
 
435 aa  414  1e-114  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2007  adenylosuccinate synthetase  48.1 
 
 
431 aa  412  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00017376  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1282  adenylosuccinate synthetase  49.04 
 
 
431 aa  412  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0367  adenylosuccinate synthetase  50.59 
 
 
428 aa  414  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3346  adenylosuccinate synthetase  48.82 
 
 
432 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.474516  hitchhiker  0.00582802 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  49.04 
 
 
428 aa  413  1e-114  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002264  adenylosuccinate synthetase  48.24 
 
 
438 aa  412  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.151372  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2772  adenylosuccinate synthetase  48.01 
 
 
438 aa  412  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5638  adenylosuccinate synthase  48.33 
 
 
430 aa  410  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.171619  normal  0.25149 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2909  Adenylosuccinate synthetase  45.63 
 
 
429 aa  410  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270112  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4941  adenylosuccinate synthetase  49.28 
 
 
430 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348011 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4680  adenylosuccinate synthetase  49.52 
 
 
430 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1265  adenylosuccinate synthetase  48.57 
 
 
432 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0163864  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4086  adenylosuccinate synthetase  48.57 
 
 
430 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0852587 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2626  adenylosuccinate synthase  50.12 
 
 
437 aa  409  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000737689 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07600  Adenylosuccinate synthetase  48.56 
 
 
430 aa  411  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05331  adenylosuccinate synthetase  48.8 
 
 
436 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05701  adenylosuccinate synthetase  49.04 
 
 
436 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4765  adenylosuccinate synthetase  49.28 
 
 
430 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2598  adenylosuccinate synthetase  48.57 
 
 
432 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0051551  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2221  adenylosuccinate synthetase  48 
 
 
423 aa  410  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44855  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2691  adenylosuccinate synthetase  48.57 
 
 
432 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321196  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0526  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 
431 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3234  adenylosuccinate synthase  49.18 
 
 
437 aa  410  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000199193  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>