More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2196 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0213  adenylosuccinate synthetase  84.33 
 
 		 434 aa  775    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.816026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1816  adenylosuccinate synthetase  83.18 
 
 		 434 aa  769    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2196  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 434 aa  894    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2031  adenylosuccinate synthetase  78.98 
 
 		 435 aa  728    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0322  adenylosuccinate synthetase  87.33 
 
 		 434 aa  802    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2262  adenylosuccinate synthetase  79.25 
 
 		 429 aa  720    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0914846 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2390  adenylosuccinate synthetase  88.02 
 
 		 434 aa  810    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  60 
 
 		 433 aa  535  1e-151  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  52.98 
 
 		 433 aa  463  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0492  adenylosuccinate synthetase  54.82 
 
 		 428 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  50.59 
 
 		 427 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  51.54 
 
 		 426 aa  448  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  50.36 
 
 		 430 aa  450  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  51.2 
 
 		 447 aa  450  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  51.2 
 
 		 447 aa  450  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05071  adenylosuccinate synthetase  50.24 
 
 		 437 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.22054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  50.71 
 
 		 427 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  50.84 
 
 		 430 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  48.33 
 
 		 444 aa  441  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  51.43 
 
 		 427 aa  441  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10362  adenylosuccinate synthetase  51.77 
 
 		 432 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698825  normal  0.94506 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3282  adenylosuccinate synthetase  49.52 
 
 		 437 aa  440  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00809393  normal  0.019729 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2598  adenylosuccinate synthetase  51.79 
 
 		 432 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0051551  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  50.24 
 
 		 430 aa  437  1e-121  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05641  adenylosuccinate synthetase  49.04 
 
 		 437 aa  438  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.622975 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1839  adenylosuccinate synthetase  49.04 
 
 		 437 aa  438  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  50.24 
 
 		 427 aa  436  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  49.28 
 
 		 447 aa  437  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  50.95 
 
 		 431 aa  436  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1265  adenylosuccinate synthetase  52.03 
 
 		 432 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0163864  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  50.6 
 
 		 431 aa  437  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2691  adenylosuccinate synthetase  51.79 
 
 		 432 aa  435  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321196  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  50.48 
 
 		 427 aa  437  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07421  adenylosuccinate synthetase  49.52 
 
 		 439 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  49.05 
 
 		 430 aa  435  1e-121  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  49.64 
 
 		 430 aa  435  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  50.84 
 
 		 432 aa  433  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  48.33 
 
 		 449 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  50.6 
 
 		 432 aa  434  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  49.64 
 
 		 427 aa  434  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  50.71 
 
 		 427 aa  433  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11510  Adenylosuccinate synthetase  48.94 
 
 		 434 aa  429  1e-119  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0133  adenylosuccinate synthase  50.59 
 
 		 807 aa  428  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  49.76 
 
 		 427 aa  430  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  47.85 
 
 		 444 aa  429  1e-119  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  48.46 
 
 		 427 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0139  adenylosuccinate synthetase  51.31 
 
 		 429 aa  431  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000561019 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0176  adenylosuccinate synthetase  50.48 
 
 		 427 aa  425  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0504  adenylosuccinate synthetase  50.59 
 
 		 431 aa  428  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0367  adenylosuccinate synthetase  49.65 
 
 		 428 aa  426  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0228  adenylosuccinate synthetase  50.59 
 
 		 431 aa  426  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.043517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05701  adenylosuccinate synthetase  49.76 
 
 		 436 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0248  adenylosuccinate synthetase  48.93 
 
 		 423 aa  426  1e-118  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0515  adenylosuccinate synthetase  50.59 
 
 		 431 aa  428  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  50 
 
 		 427 aa  427  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0526  adenylosuccinate synthetase  50.59 
 
 		 431 aa  428  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0677  adenylosuccinate synthetase  50.35 
 
 		 431 aa  427  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05631  adenylosuccinate synthetase  49.28 
 
 		 436 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4680  adenylosuccinate synthetase  49.52 
 
 		 430 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0528  adenylosuccinate synthetase  49.76 
 
 		 429 aa  422  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650318  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  49.76 
 
 		 430 aa  423  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0641  adenylosuccinate synthetase  49.64 
 
 		 431 aa  422  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143682 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05331  adenylosuccinate synthetase  49.04 
 
 		 436 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2909  Adenylosuccinate synthetase  46.81 
 
 		 429 aa  423  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  47.62 
 
 		 428 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2504  adenylosuccinate synthetase  50.36 
 
 		 431 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000458788 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1523  adenylosuccinate synthetase  51.19 
 
 		 442 aa  424  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000140547  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4889  adenylosuccinate synthetase  49.28 
 
 		 430 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0250802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2221  adenylosuccinate synthetase  49.3 
 
 		 423 aa  421  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44855  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08766  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 		 423 aa  420  1e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0287341  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1667  adenylosuccinate synthetase  48.33 
 
 		 439 aa  421  1e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0691  adenylosuccinate synthetase  47.37 
 
 		 439 aa  418  1e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0507  adenylosuccinate synthetase  48.8 
 
 		 436 aa  420  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4765  adenylosuccinate synthetase  49.28 
 
 		 430 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1282  adenylosuccinate synthetase  49.28 
 
 		 431 aa  420  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2532  adenylosuccinate synthetase  48.8 
 
 		 445 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3868  adenylosuccinate synthetase  45.71 
 
 		 442 aa  419  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.838486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5667  adenylosuccinate synthetase  49.28 
 
 		 430 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65230  adenylosuccinate synthetase  49.28 
 
 		 430 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2029  adenylosuccinate synthetase  48.69 
 
 		 429 aa  419  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00381049  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4941  adenylosuccinate synthetase  49.28 
 
 		 430 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348011 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2126  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 		 428 aa  419  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1958  adenylosuccinate synthetase  48.69 
 
 		 425 aa  419  1e-116  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  49.17 
 
 		 432 aa  418  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  47.14 
 
 		 428 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23100  Adenylosuccinate synthase  52.86 
 
 		 428 aa  418  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  48.09 
 
 		 428 aa  416  9.999999999999999e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0941  adenylosuccinate synthetase  47.62 
 
 		 435 aa  417  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4937  adenylosuccinate synthetase  48.8 
 
 		 430 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0577  adenylosuccinate synthetase  48.8 
 
 		 430 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  45.61 
 
 		 428 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0025  adenylosuccinate synthetase  47.16 
 
 		 426 aa  418  9.999999999999999e-116  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.993316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  49.17 
 
 		 427 aa  416  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5638  adenylosuccinate synthase  48.93 
 
 		 430 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.171619  normal  0.25149 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  47.14 
 
 		 429 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2207  adenylosuccinate synthetase  49.29 
 
 		 430 aa  416  9.999999999999999e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1049  adenylosuccinate synthetase  47.62 
 
 		 435 aa  417  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0517  adenylosuccinate synthetase  48.94 
 
 		 428 aa  418  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4784  adenylosuccinate synthetase  48.45 
 
 		 432 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4420  adenylosuccinate synthetase  48.69 
 
 		 432 aa  413  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>