More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0248 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2221  adenylosuccinate synthetase  79.2 
 
 		 423 aa  706    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44855  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08766  adenylosuccinate synthetase  77.54 
 
 		 423 aa  699    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0287341  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0248  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 423 aa  867    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1202  adenylosuccinate synthetase  64.69 
 
 		 425 aa  570  1e-161  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.609737  normal  0.550164 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1608  adenylosuccinate synthetase  63.03 
 
 		 428 aa  550  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.395219  normal  0.555835 
 
 
-
 
NC_002950  PG0464  adenylosuccinate synthetase  62.65 
 
 		 423 aa  547  1e-154  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4579  adenylosuccinate synthetase  61.08 
 
 		 431 aa  536  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.730826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1701  adenylosuccinate synthetase  60 
 
 		 431 aa  526  1e-148  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.401877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7050  adenylosuccinate synthetase  57.75 
 
 		 432 aa  522  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5638  adenylosuccinate synthetase  54.82 
 
 		 424 aa  450  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0744769  normal  0.421988 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1816  adenylosuccinate synthetase  48.38 
 
 		 434 aa  428  1e-118  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2196  adenylosuccinate synthetase  48.93 
 
 		 434 aa  426  1e-118  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0213  adenylosuccinate synthetase  49.53 
 
 		 434 aa  423  1e-117  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.816026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2390  adenylosuccinate synthetase  48.34 
 
 		 434 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0322  adenylosuccinate synthetase  46.9 
 
 		 434 aa  412  1e-114  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 		 433 aa  410  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2262  adenylosuccinate synthetase  47.74 
 
 		 429 aa  410  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0914846 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  48.71 
 
 		 433 aa  410  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  49.53 
 
 		 430 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2031  adenylosuccinate synthetase  47.03 
 
 		 435 aa  402  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  48 
 
 		 432 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  48 
 
 		 431 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  47.17 
 
 		 430 aa  398  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0540  adenylosuccinate synthetase  48 
 
 		 432 aa  396  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311763  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1370  adenylosuccinate synthetase  48.46 
 
 		 416 aa  396  1e-109  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  47.29 
 
 		 432 aa  397  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  49.42 
 
 		 430 aa  395  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  46.93 
 
 		 427 aa  394  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  47.32 
 
 		 427 aa  392  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0370  adenylosuccinate synthetase  47.99 
 
 		 416 aa  394  1e-108  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0409344  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0330  adenylosuccinate synthetase  48.1 
 
 		 431 aa  390  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  47.04 
 
 		 428 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  47.6 
 
 		 451 aa  390  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  46.57 
 
 		 428 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1271  adenylosuccinate synthetase  47.43 
 
 		 429 aa  391  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231459  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  46.9 
 
 		 430 aa  385  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0607  adenylosuccinate synthetase  49.05 
 
 		 432 aa  388  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.272974 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2144  adenylosuccinate synthase  48.02 
 
 		 430 aa  385  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  46.4 
 
 		 427 aa  385  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2131  adenylosuccinate synthetase  48.93 
 
 		 416 aa  387  1e-106  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0360  adenylosuccinate synthetase  46.68 
 
 		 432 aa  385  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.655854  hitchhiker  0.00425653 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1282  adenylosuccinate synthetase  47.86 
 
 		 431 aa  386  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1671  adenylosuccinate synthetase  46.79 
 
 		 416 aa  383  1e-105  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1490  adenylosuccinate synthetase  46.79 
 
 		 416 aa  383  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  46.74 
 
 		 427 aa  385  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0497  adenylosuccinate synthetase  46.12 
 
 		 432 aa  382  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  44.63 
 
 		 424 aa  383  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3716  adenylosuccinate synthetase  46.32 
 
 		 432 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316289  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1846  adenylosuccinate synthetase  46.79 
 
 		 416 aa  383  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  47.1 
 
 		 449 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1927  adenylosuccinate synthetase  46.93 
 
 		 415 aa  382  1e-105  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  46.95 
 
 		 432 aa  384  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3914  adenylosuccinate synthetase  46.92 
 
 		 432 aa  382  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.923104  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3019  adenylosuccinate synthetase  47.13 
 
 		 424 aa  384  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0330  adenylosuccinate synthetase  47.06 
 
 		 428 aa  384  1e-105  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  45.18 
 
 		 429 aa  382  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04044  adenylosuccinate synthetase  45.84 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3816  Adenylosuccinate synthase  45.84 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4736  adenylosuccinate synthetase  45.84 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4889  adenylosuccinate synthetase  46.93 
 
 		 430 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0250802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  47.8 
 
 		 447 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  43.87 
 
 		 426 aa  379  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2764  adenylosuccinate synthase  47.52 
 
 		 431 aa  381  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  46.17 
 
 		 444 aa  379  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  46.34 
 
 		 427 aa  379  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5693  adenylosuccinate synthetase  45.84 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.580203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4784  adenylosuccinate synthetase  45.61 
 
 		 432 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4648  adenylosuccinate synthetase  45.84 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.378806 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3836  adenylosuccinate synthetase  45.84 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.930032  hitchhiker  0.00000195768 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2029  adenylosuccinate synthetase  45.45 
 
 		 429 aa  381  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00381049  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  47.8 
 
 		 447 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0075  adenylosuccinate synthetase  47.39 
 
 		 419 aa  380  1e-104  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4420  adenylosuccinate synthetase  45.84 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4727  adenylosuccinate synthetase  45.61 
 
 		 432 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4708  adenylosuccinate synthetase  45.84 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4941  adenylosuccinate synthetase  46.93 
 
 		 430 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348011 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1784  adenylosuccinate synthetase  47.18 
 
 		 430 aa  378  1e-104  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04006  hypothetical protein  45.84 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1939  adenylosuccinate synthetase  46.44 
 
 		 428 aa  379  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4765  adenylosuccinate synthetase  46.93 
 
 		 430 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  45.03 
 
 		 428 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0524  adenylosuccinate synthetase  45.5 
 
 		 432 aa  377  1e-103  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3937  adenylosuccinate synthetase  48.34 
 
 		 431 aa  376  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1719  adenylosuccinate synthetase  46.95 
 
 		 430 aa  376  1e-103  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3592  adenylosuccinate synthetase  48.46 
 
 		 431 aa  376  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000897035  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4644  adenylosuccinate synthetase  45.61 
 
 		 432 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  46.3 
 
 		 444 aa  377  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  46.23 
 
 		 427 aa  377  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0747  adenylosuccinate synthetase  48.22 
 
 		 431 aa  376  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000703533  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2626  adenylosuccinate synthase  47.03 
 
 		 437 aa  375  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000737689 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3291  adenylosuccinate synthetase  48.24 
 
 		 431 aa  377  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000376094  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0215  adenylosuccinate synthetase  47.03 
 
 		 432 aa  376  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1328  adenylosuccinate synthetase  47.27 
 
 		 432 aa  376  1e-103  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3266  adenylosuccinate synthetase  48.34 
 
 		 431 aa  378  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000110825  hitchhiker  0.0000153755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0681  adenylosuccinate synthetase  48.34 
 
 		 431 aa  378  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00011524  hitchhiker  0.00031126 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02633  adenylosuccinate synthetase  47.17 
 
 		 430 aa  377  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  44.92 
 
 		 430 aa  375  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11510  Adenylosuccinate synthetase  43.93 
 
 		 434 aa  376  1e-103  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  46.12 
 
 		 430 aa  378  1e-103  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0695  adenylosuccinate synthetase  48.34 
 
 		 431 aa  377  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000192259  hitchhiker  0.0000489804 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>