More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1927 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1927  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 415 aa  850    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0075  adenylosuccinate synthetase  69.88 
 
 		 419 aa  615  1e-175  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2131  adenylosuccinate synthetase  67.07 
 
 		 416 aa  583  1.0000000000000001e-165  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0370  adenylosuccinate synthetase  64.89 
 
 		 416 aa  573  1.0000000000000001e-162  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0409344  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0368  adenylosuccinate synthetase  64.98 
 
 		 416 aa  569  1e-161  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.361154  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1846  adenylosuccinate synthetase  64.01 
 
 		 416 aa  563  1.0000000000000001e-159  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1671  adenylosuccinate synthetase  64.01 
 
 		 416 aa  563  1.0000000000000001e-159  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1490  adenylosuccinate synthetase  64.01 
 
 		 416 aa  563  1.0000000000000001e-159  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1784  adenylosuccinate synthetase  65.62 
 
 		 416 aa  560  1e-158  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0153593  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1370  adenylosuccinate synthetase  60.14 
 
 		 416 aa  542  1e-153  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  50.95 
 
 		 432 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  51.64 
 
 		 433 aa  414  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  51.07 
 
 		 430 aa  413  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  47.75 
 
 		 430 aa  410  1e-113  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  47.88 
 
 		 430 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1939  adenylosuccinate synthetase  50.48 
 
 		 431 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4680  adenylosuccinate synthetase  49.52 
 
 		 430 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4889  adenylosuccinate synthetase  49.05 
 
 		 430 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0250802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0133  adenylosuccinate synthase  49.41 
 
 		 807 aa  404  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0139  adenylosuccinate synthetase  48.94 
 
 		 429 aa  402  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000561019 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  49.53 
 
 		 430 aa  403  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4765  adenylosuccinate synthetase  49.05 
 
 		 430 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  48.94 
 
 		 430 aa  402  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4941  adenylosuccinate synthetase  49.05 
 
 		 430 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348011 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 		 431 aa  404  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002264  adenylosuccinate synthetase  50.94 
 
 		 438 aa  402  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.151372  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  48.46 
 
 		 427 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  47.63 
 
 		 427 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4777  adenylosuccinate synthetase  49.76 
 
 		 429 aa  400  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.545109  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  48.46 
 
 		 426 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07600  Adenylosuccinate synthetase  49.29 
 
 		 430 aa  401  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  48.93 
 
 		 427 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2958  adenylosuccinate synthetase  48.1 
 
 		 428 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2641  adenylosuccinate synthetase  48.34 
 
 		 428 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4937  adenylosuccinate synthetase  48.81 
 
 		 430 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5667  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 		 430 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0577  adenylosuccinate synthetase  48.81 
 
 		 430 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2007  adenylosuccinate synthetase  49.65 
 
 		 431 aa  397  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00017376  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0641  adenylosuccinate synthetase  48.46 
 
 		 431 aa  396  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143682 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 		 444 aa  395  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2772  adenylosuccinate synthetase  48.83 
 
 		 438 aa  395  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65230  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 		 430 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1978  adenylosuccinate synthetase  48.94 
 
 		 432 aa  394  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3716  adenylosuccinate synthetase  48.22 
 
 		 432 aa  393  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316289  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11510  Adenylosuccinate synthetase  49.3 
 
 		 434 aa  392  1e-108  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0046  adenylosuccinate synthetase  48.56 
 
 		 426 aa  392  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.268676  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00089  adenylosuccinate synthetase  50.7 
 
 		 438 aa  394  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  48.7 
 
 		 447 aa  394  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0528  adenylosuccinate synthetase  48.57 
 
 		 429 aa  392  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650318  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0540  adenylosuccinate synthetase  47.27 
 
 		 432 aa  394  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311763  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3914  adenylosuccinate synthetase  48.46 
 
 		 432 aa  392  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.923104  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  48.48 
 
 		 427 aa  393  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1282  adenylosuccinate synthetase  48.81 
 
 		 431 aa  393  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07421  adenylosuccinate synthetase  48.81 
 
 		 439 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0660  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 		 431 aa  393  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  48.94 
 
 		 432 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  48.94 
 
 		 432 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0017  adenylosuccinate synthetase  46.34 
 
 		 427 aa  391  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000177457  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  46.79 
 
 		 428 aa  389  1e-107  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  47.04 
 
 		 428 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3282  adenylosuccinate synthetase  47.75 
 
 		 437 aa  391  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00809393  normal  0.019729 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0578  adenylosuccinate synthetase  47.86 
 
 		 432 aa  390  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000001206 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0017  adenylosuccinate synthetase  46.34 
 
 		 427 aa  391  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0497  adenylosuccinate synthetase  47.98 
 
 		 432 aa  389  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02633  adenylosuccinate synthetase  49.05 
 
 		 430 aa  390  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  48.7 
 
 		 430 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2909  Adenylosuccinate synthetase  46.59 
 
 		 429 aa  389  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270112  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04044  adenylosuccinate synthetase  48.24 
 
 		 432 aa  386  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3816  Adenylosuccinate synthase  48.24 
 
 		 432 aa  386  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2536  adenylosuccinate synthetase  45.63 
 
 		 427 aa  388  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  47.75 
 
 		 449 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4648  adenylosuccinate synthetase  48.24 
 
 		 432 aa  386  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.378806 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1784  adenylosuccinate synthetase  49.05 
 
 		 430 aa  386  1e-106  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4420  adenylosuccinate synthetase  48.24 
 
 		 432 aa  386  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4634  adenylosuccinate synthetase  48 
 
 		 432 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4644  adenylosuccinate synthetase  48 
 
 		 432 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0691  adenylosuccinate synthetase  48.1 
 
 		 439 aa  386  1e-106  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  48.23 
 
 		 444 aa  388  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2661  adenylosuccinate synthetase  48.7 
 
 		 431 aa  388  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3138  adenylosuccinate synthetase  47.03 
 
 		 430 aa  388  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32892  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4736  adenylosuccinate synthetase  48.24 
 
 		 432 aa  386  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05071  adenylosuccinate synthetase  48.35 
 
 		 437 aa  388  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.22054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4763  adenylosuccinate synthetase  48 
 
 		 432 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.707154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04006  hypothetical protein  48.24 
 
 		 432 aa  386  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5693  adenylosuccinate synthetase  48.24 
 
 		 432 aa  386  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.580203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4708  adenylosuccinate synthetase  48.24 
 
 		 432 aa  386  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2126  adenylosuccinate synthetase  47.41 
 
 		 428 aa  385  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3836  adenylosuccinate synthetase  48.24 
 
 		 432 aa  386  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.930032  hitchhiker  0.00000195768 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1841  Adenylosuccinate synthase  48.84 
 
 		 430 aa  385  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.842522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  47.39 
 
 		 433 aa  387  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0248  adenylosuccinate synthetase  46.93 
 
 		 423 aa  382  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0607  adenylosuccinate synthetase  47.74 
 
 		 432 aa  385  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.272974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  47.04 
 
 		 427 aa  382  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0694  adenylosuccinate synthetase  47.03 
 
 		 432 aa  383  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4727  adenylosuccinate synthetase  48 
 
 		 432 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0509  adenylosuccinate synthetase  47.98 
 
 		 431 aa  383  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00567032  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00585  adenylosuccinate synthetase  48.82 
 
 		 432 aa  382  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1939  adenylosuccinate synthetase  47.29 
 
 		 428 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2207  adenylosuccinate synthetase  48.11 
 
 		 430 aa  383  1e-105  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2626  adenylosuccinate synthase  48.94 
 
 		 437 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000737689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>