More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0075 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0075  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 419 aa  859    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1927  adenylosuccinate synthetase  69.88 
 
 		 415 aa  615  1e-175  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0368  adenylosuccinate synthetase  69.16 
 
 		 416 aa  608  1e-173  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.361154  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2131  adenylosuccinate synthetase  69.64 
 
 		 416 aa  600  1e-170  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1671  adenylosuccinate synthetase  66.51 
 
 		 416 aa  594  1e-169  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1490  adenylosuccinate synthetase  66.51 
 
 		 416 aa  594  1e-169  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1846  adenylosuccinate synthetase  66.51 
 
 		 416 aa  594  1e-169  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0370  adenylosuccinate synthetase  67.63 
 
 		 416 aa  596  1e-169  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0409344  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1784  adenylosuccinate synthetase  68.67 
 
 		 416 aa  591  1e-168  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0153593  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1370  adenylosuccinate synthetase  66.02 
 
 		 416 aa  590  1e-167  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1816  adenylosuccinate synthetase  50.59 
 
 		 434 aa  419  1e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  49.52 
 
 		 449 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0213  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 		 434 aa  414  1e-114  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.816026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  49.29 
 
 		 447 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  49.29 
 
 		 447 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 		 444 aa  410  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0322  adenylosuccinate synthetase  49.53 
 
 		 434 aa  409  1e-113  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  48.46 
 
 		 447 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  49.64 
 
 		 432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0691  adenylosuccinate synthetase  48.1 
 
 		 439 aa  402  1e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  48.81 
 
 		 444 aa  404  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  48.1 
 
 		 427 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  49.29 
 
 		 427 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3282  adenylosuccinate synthetase  48.57 
 
 		 437 aa  404  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00809393  normal  0.019729 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  46.3 
 
 		 427 aa  404  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2196  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 		 434 aa  403  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2390  adenylosuccinate synthetase  49.3 
 
 		 434 aa  403  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002264  adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 		 438 aa  402  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.151372  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07421  adenylosuccinate synthetase  48.46 
 
 		 439 aa  401  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1667  adenylosuccinate synthetase  49.29 
 
 		 439 aa  399  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  48.94 
 
 		 426 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0046  adenylosuccinate synthetase  50.95 
 
 		 426 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.268676  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2772  adenylosuccinate synthetase  48.71 
 
 		 438 aa  396  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00089  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 		 438 aa  398  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  47.27 
 
 		 430 aa  397  1e-109  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  47.97 
 
 		 433 aa  393  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  47.73 
 
 		 427 aa  392  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3544  adenylosuccinate synthetase  47.79 
 
 		 432 aa  394  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0999  adenylosuccinate synthase  47.67 
 
 		 448 aa  389  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.595096  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  47.52 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0176  adenylosuccinate synthetase  50.47 
 
 		 427 aa  390  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0139  adenylosuccinate synthetase  47.63 
 
 		 429 aa  389  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000561019 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0962  Adenylosuccinate synthase  47.91 
 
 		 430 aa  390  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.470264  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2031  adenylosuccinate synthetase  48.58 
 
 		 435 aa  390  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1839  adenylosuccinate synthetase  48.33 
 
 		 437 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0133  adenylosuccinate synthase  47.87 
 
 		 807 aa  391  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  47.04 
 
 		 430 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05641  adenylosuccinate synthetase  48.33 
 
 		 437 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.622975 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0540  adenylosuccinate synthetase  46.68 
 
 		 432 aa  388  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311763  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05071  adenylosuccinate synthetase  46.79 
 
 		 437 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.22054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2958  adenylosuccinate synthetase  46.08 
 
 		 428 aa  391  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2641  adenylosuccinate synthetase  46.08 
 
 		 428 aa  391  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  46.79 
 
 		 428 aa  390  1e-107  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2262  adenylosuccinate synthetase  48.71 
 
 		 429 aa  390  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0914846 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3346  adenylosuccinate synthetase  47.32 
 
 		 432 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.474516  hitchhiker  0.00582802 
 
 
-
 
NC_004310  BR1683  adenylosuccinate synthetase  48.14 
 
 		 429 aa  387  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.469628  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05631  adenylosuccinate synthetase  48.22 
 
 		 436 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2144  adenylosuccinate synthase  47.04 
 
 		 430 aa  386  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1850  adenylosuccinate synthetase  46.23 
 
 		 430 aa  386  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  47.52 
 
 		 431 aa  385  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  46.82 
 
 		 427 aa  385  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5638  adenylosuccinate synthase  47.41 
 
 		 430 aa  385  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.171619  normal  0.25149 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4086  adenylosuccinate synthetase  46.5 
 
 		 430 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0852587 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  48.58 
 
 		 427 aa  385  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2416  adenylosuccinate synthetase  47.41 
 
 		 428 aa  386  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  47.86 
 
 		 427 aa  386  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1627  adenylosuccinate synthetase  47.91 
 
 		 533 aa  387  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3159  adenylosuccinate synthetase  46.62 
 
 		 432 aa  385  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  47.41 
 
 		 430 aa  387  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  47.14 
 
 		 428 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0497  adenylosuccinate synthetase  46.45 
 
 		 432 aa  385  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04044  adenylosuccinate synthetase  47.53 
 
 		 432 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3816  Adenylosuccinate synthase  47.53 
 
 		 432 aa  382  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0641  adenylosuccinate synthetase  47.17 
 
 		 431 aa  384  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143682 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1841  Adenylosuccinate synthase  48.94 
 
 		 430 aa  384  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.842522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4680  adenylosuccinate synthetase  47.64 
 
 		 430 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  46.56 
 
 		 430 aa  384  1e-105  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0262  adenylosuccinate synthase  48.23 
 
 		 431 aa  383  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05331  adenylosuccinate synthetase  47.74 
 
 		 436 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0607  adenylosuccinate synthetase  46.21 
 
 		 432 aa  382  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.272974 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4763  adenylosuccinate synthetase  47.29 
 
 		 432 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.707154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4420  adenylosuccinate synthetase  47.53 
 
 		 432 aa  382  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3716  adenylosuccinate synthetase  46.45 
 
 		 432 aa  382  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316289  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0507  adenylosuccinate synthetase  47.86 
 
 		 436 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2010  adenylosuccinate synthetase  47.64 
 
 		 430 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.34638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1330  adenylosuccinate synthetase  46.5 
 
 		 430 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.396862  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4634  adenylosuccinate synthetase  47.29 
 
 		 432 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04006  hypothetical protein  47.53 
 
 		 432 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2661  adenylosuccinate synthetase  47.63 
 
 		 431 aa  382  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1282  adenylosuccinate synthetase  46.56 
 
 		 431 aa  384  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5693  adenylosuccinate synthetase  47.53 
 
 		 432 aa  382  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.580203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2742  adenylosuccinate synthetase  47.65 
 
 		 431 aa  382  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0436902 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4765  adenylosuccinate synthetase  47.41 
 
 		 430 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0940  Adenylosuccinate synthase  47.21 
 
 		 430 aa  384  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0524  adenylosuccinate synthetase  48.15 
 
 		 432 aa  382  1e-105  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0037  adenylosuccinate synthetase  47.76 
 
 		 448 aa  383  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.505248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4941  adenylosuccinate synthetase  47.41 
 
 		 430 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348011 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4736  adenylosuccinate synthetase  47.53 
 
 		 432 aa  382  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4648  adenylosuccinate synthetase  47.53 
 
 		 432 aa  382  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.378806 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  47.39 
 
 		 430 aa  382  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>