More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0999 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0262  adenylosuccinate synthase  76.33 
 
 
431 aa  666    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2616  adenylosuccinate synthetase  75.93 
 
 
432 aa  680    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199466  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1683  adenylosuccinate synthetase  75.58 
 
 
429 aa  676    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.469628  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1231  adenylosuccinate synthetase  74.65 
 
 
429 aa  669    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2965  adenylosuccinate synthetase  75.29 
 
 
430 aa  667    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.125391  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0037  adenylosuccinate synthetase  72.85 
 
 
448 aa  651    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.505248  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4774  adenylosuccinate synthetase  73.89 
 
 
430 aa  654    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3544  adenylosuccinate synthetase  74.54 
 
 
432 aa  672    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7581  adenylosuccinate synthetase  78.37 
 
 
430 aa  679    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2144  adenylosuccinate synthase  72.79 
 
 
430 aa  650    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0940  Adenylosuccinate synthase  97.44 
 
 
430 aa  850    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1330  adenylosuccinate synthetase  75.29 
 
 
430 aa  666    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.396862  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4086  adenylosuccinate synthetase  74.36 
 
 
430 aa  664    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0852587 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3894  adenylosuccinate synthetase  75.06 
 
 
430 aa  668    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.108834  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1123  adenylosuccinate synthetase  73.39 
 
 
457 aa  667    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0999  adenylosuccinate synthase  100 
 
 
448 aa  904    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.595096  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5638  adenylosuccinate synthase  80 
 
 
430 aa  699    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.171619  normal  0.25149 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1007  Adenylosuccinate synthase  77.96 
 
 
431 aa  687    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0196756 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6845  adenylosuccinate synthase  78.37 
 
 
430 aa  679    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3159  adenylosuccinate synthetase  73.84 
 
 
432 aa  665    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3346  adenylosuccinate synthetase  76.16 
 
 
432 aa  686    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.474516  hitchhiker  0.00582802 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3089  adenylosuccinate synthetase  75.23 
 
 
432 aa  680    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126084  normal  0.070043 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1627  adenylosuccinate synthetase  75.12 
 
 
533 aa  681    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0962  Adenylosuccinate synthase  99.77 
 
 
430 aa  866    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.470264  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1850  adenylosuccinate synthetase  74.59 
 
 
430 aa  658    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0558  adenylosuccinate synthetase  69.63 
 
 
429 aa  629  1e-179  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00595695 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0603  adenylosuccinate synthetase  68.84 
 
 
430 aa  621  1e-177  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0875  adenylosuccinate synthetase  70 
 
 
430 aa  623  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2010  adenylosuccinate synthetase  69.07 
 
 
430 aa  617  1e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.34638  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0366  adenylosuccinate synthetase  68.84 
 
 
430 aa  616  1e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4682  adenylosuccinate synthetase  67.67 
 
 
429 aa  607  9.999999999999999e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2683  adenylosuccinate synthetase  68.37 
 
 
429 aa  605  9.999999999999999e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1106  adenylosuccinate synthetase  68.6 
 
 
429 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3179  adenylosuccinate synthetase  68.21 
 
 
431 aa  601  1.0000000000000001e-171  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0285  adenylosuccinate synthetase  67.91 
 
 
429 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0510  adenylosuccinate synthetase  67.91 
 
 
429 aa  597  1e-169  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.37093  normal  0.446838 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2742  adenylosuccinate synthetase  67.29 
 
 
431 aa  593  1e-168  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0436902 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1969  adenylosuccinate synthetase  65.9 
 
 
437 aa  593  1e-168  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.769944  normal  0.0974254 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0475  adenylosuccinate synthetase  69.77 
 
 
429 aa  588  1e-167  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.636476  hitchhiker  0.00197029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0658  adenylosuccinate synthetase  68.53 
 
 
428 aa  585  1e-166  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.163412  normal  0.505489 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2784  adenylosuccinate synthetase  66.74 
 
 
429 aa  566  1e-160  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.436445  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0337  adenylosuccinate synthetase  56.34 
 
 
425 aa  515  1.0000000000000001e-145  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.112659  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0564  adenylosuccinate synthetase  52.21 
 
 
431 aa  494  9.999999999999999e-139  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0461  adenylosuccinate synthetase  52.21 
 
 
430 aa  493  9.999999999999999e-139  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5753  adenylosuccinate synthase  59.21 
 
 
429 aa  477  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.590489 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6526  adenylosuccinate synthetase  59.21 
 
 
432 aa  475  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.768523 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5997  adenylosuccinate synthase  58.74 
 
 
429 aa  475  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140056  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0607  adenylosuccinate synthetase  54.67 
 
 
432 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.272974 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2007  adenylosuccinate synthetase  56.44 
 
 
431 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00017376  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1523  adenylosuccinate synthetase  54.23 
 
 
442 aa  471  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000140547  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6199  adenylosuccinate synthase  57.44 
 
 
453 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0247215 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6675  adenylosuccinate synthase  58.04 
 
 
432 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5832  adenylosuccinate synthase  58.04 
 
 
432 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0676  adenylosuccinate synthetase  51.58 
 
 
446 aa  463  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.678663  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1281  adenylosuccinate synthetase  51.36 
 
 
446 aa  460  9.999999999999999e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5326  adenylosuccinate synthase  58.28 
 
 
432 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0668634 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3379  adenylosuccinate synthetase  55.32 
 
 
436 aa  460  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2974  adenylosuccinate synthetase  53.35 
 
 
435 aa  455  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  53.27 
 
 
432 aa  456  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07600  Adenylosuccinate synthetase  53.4 
 
 
430 aa  451  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0641  adenylosuccinate synthetase  54.91 
 
 
431 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143682 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  52.31 
 
 
433 aa  448  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  52.79 
 
 
431 aa  451  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0578  adenylosuccinate synthetase  53.97 
 
 
432 aa  449  1e-125  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000001206 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0750  adenylosuccinate synthetase  53.04 
 
 
431 aa  449  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000682785  hitchhiker  0.00737735 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002264  adenylosuccinate synthetase  52.87 
 
 
438 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.151372  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  52.57 
 
 
430 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  51.4 
 
 
444 aa  446  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0509  adenylosuccinate synthetase  53.38 
 
 
431 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00567032  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5667  adenylosuccinate synthetase  53.97 
 
 
430 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3357  adenylosuccinate synthetase  52.91 
 
 
431 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0113184  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65230  adenylosuccinate synthetase  53.97 
 
 
430 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2772  adenylosuccinate synthetase  51.49 
 
 
438 aa  442  1e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4889  adenylosuccinate synthetase  53.4 
 
 
430 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0250802  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1939  adenylosuccinate synthetase  51.76 
 
 
431 aa  442  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3592  adenylosuccinate synthetase  52.34 
 
 
431 aa  441  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000897035  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0550  adenylosuccinate synthetase  53.97 
 
 
431 aa  442  1e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4765  adenylosuccinate synthetase  53.4 
 
 
430 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0528  adenylosuccinate synthetase  54.1 
 
 
429 aa  443  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650318  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  51.42 
 
 
427 aa  443  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4680  adenylosuccinate synthetase  53.86 
 
 
430 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1583  adenylosuccinate synthetase  52.52 
 
 
440 aa  444  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.147694  unclonable  0.000000227018 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4941  adenylosuccinate synthetase  53.4 
 
 
430 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348011 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02633  adenylosuccinate synthetase  52.22 
 
 
430 aa  438  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3291  adenylosuccinate synthetase  52.8 
 
 
431 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000376094  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0330  adenylosuccinate synthetase  51.4 
 
 
431 aa  439  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4937  adenylosuccinate synthetase  52.93 
 
 
430 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0694  adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 
432 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0526  adenylosuccinate synthetase  53.27 
 
 
431 aa  441  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0577  adenylosuccinate synthetase  52.93 
 
 
430 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  51.4 
 
 
432 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3648  adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 
432 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  51.16 
 
 
432 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1784  adenylosuccinate synthetase  52.22 
 
 
430 aa  439  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1719  adenylosuccinate synthetase  52.22 
 
 
430 aa  439  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2661  adenylosuccinate synthetase  51.17 
 
 
431 aa  438  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1282  adenylosuccinate synthetase  53.49 
 
 
431 aa  440  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3266  adenylosuccinate synthetase  51.75 
 
 
431 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000110825  hitchhiker  0.0000153755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0681  adenylosuccinate synthetase  51.75 
 
 
431 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00011524  hitchhiker  0.00031126 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 
430 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>