More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1784 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1671  adenylosuccinate synthetase  71.08 
 
 
416 aa  644    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1784  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 
416 aa  852    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0153593  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0368  adenylosuccinate synthetase  73.73 
 
 
416 aa  659    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.361154  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1846  adenylosuccinate synthetase  71.08 
 
 
416 aa  644    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2131  adenylosuccinate synthetase  88.46 
 
 
416 aa  757    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0370  adenylosuccinate synthetase  77.16 
 
 
416 aa  704    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0409344  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1370  adenylosuccinate synthetase  72.29 
 
 
416 aa  662    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1490  adenylosuccinate synthetase  71.08 
 
 
416 aa  644    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0075  adenylosuccinate synthetase  68.67 
 
 
419 aa  612  9.999999999999999e-175  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1927  adenylosuccinate synthetase  65.62 
 
 
415 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  50 
 
 
428 aa  412  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0046  adenylosuccinate synthetase  48.59 
 
 
426 aa  403  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.268676  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0248  adenylosuccinate synthetase  47.69 
 
 
423 aa  395  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2262  adenylosuccinate synthetase  48.47 
 
 
429 aa  397  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0914846 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1816  adenylosuccinate synthetase  47.39 
 
 
434 aa  395  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  48.1 
 
 
430 aa  396  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  47.97 
 
 
427 aa  396  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  48.1 
 
 
426 aa  394  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  47.49 
 
 
427 aa  392  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  47.97 
 
 
430 aa  389  1e-107  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  46.3 
 
 
430 aa  390  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  48.46 
 
 
432 aa  391  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2029  adenylosuccinate synthetase  47.38 
 
 
429 aa  388  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00381049  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2909  Adenylosuccinate synthetase  47.49 
 
 
429 aa  390  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270112  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11510  Adenylosuccinate synthetase  47.04 
 
 
434 aa  389  1e-107  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2196  adenylosuccinate synthetase  47.41 
 
 
434 aa  389  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  46.92 
 
 
427 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  46.65 
 
 
433 aa  386  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0540  adenylosuccinate synthetase  46.82 
 
 
432 aa  385  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311763  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0133  adenylosuccinate synthase  48.93 
 
 
807 aa  385  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279104  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05631  adenylosuccinate synthetase  48.45 
 
 
436 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  47.96 
 
 
428 aa  388  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  47.39 
 
 
429 aa  386  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002264  adenylosuccinate synthetase  48.95 
 
 
438 aa  387  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.151372  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  44.74 
 
 
424 aa  388  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0322  adenylosuccinate synthetase  46.96 
 
 
434 aa  386  1e-106  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  47.38 
 
 
431 aa  387  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0215  adenylosuccinate synthetase  47.76 
 
 
432 aa  385  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  47.02 
 
 
430 aa  385  1e-106  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  47.18 
 
 
427 aa  385  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2390  adenylosuccinate synthetase  45.88 
 
 
434 aa  385  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  47.48 
 
 
428 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  47.03 
 
 
433 aa  383  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  46.17 
 
 
449 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  47.26 
 
 
427 aa  384  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0330  adenylosuccinate synthetase  47.42 
 
 
431 aa  382  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0366  adenylosuccinate synthetase  48.94 
 
 
430 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  47.38 
 
 
432 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0507  adenylosuccinate synthetase  48.33 
 
 
436 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  48.24 
 
 
427 aa  385  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2772  adenylosuccinate synthetase  47.54 
 
 
438 aa  383  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  47.49 
 
 
427 aa  383  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2958  adenylosuccinate synthetase  46.34 
 
 
428 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2641  adenylosuccinate synthetase  46.34 
 
 
428 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05331  adenylosuccinate synthetase  48.21 
 
 
436 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  47.38 
 
 
432 aa  382  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2010  adenylosuccinate synthetase  48.94 
 
 
430 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.34638  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  46.23 
 
 
430 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3716  adenylosuccinate synthetase  46.59 
 
 
432 aa  379  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316289  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  46.3 
 
 
427 aa  380  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1839  adenylosuccinate synthetase  48.09 
 
 
437 aa  381  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0607  adenylosuccinate synthetase  47.62 
 
 
432 aa  380  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.272974 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  47.49 
 
 
447 aa  379  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0213  adenylosuccinate synthetase  46.59 
 
 
434 aa  380  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.816026  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3914  adenylosuccinate synthetase  47.06 
 
 
432 aa  379  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.923104  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07421  adenylosuccinate synthetase  47.14 
 
 
439 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0139  adenylosuccinate synthetase  48.22 
 
 
429 aa  379  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000561019 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2221  adenylosuccinate synthetase  47.41 
 
 
423 aa  380  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44855  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1282  adenylosuccinate synthetase  47.06 
 
 
431 aa  379  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0875  adenylosuccinate synthetase  48.71 
 
 
430 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0578  adenylosuccinate synthetase  45.9 
 
 
432 aa  378  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000001206 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05071  adenylosuccinate synthetase  46.17 
 
 
437 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.22054  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05641  adenylosuccinate synthetase  48.09 
 
 
437 aa  381  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.622975 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  47.28 
 
 
430 aa  378  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3234  adenylosuccinate synthase  47.78 
 
 
437 aa  381  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000199193  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2419  adenylosuccinate synthetase  46.08 
 
 
424 aa  378  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000351382  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  47.39 
 
 
451 aa  381  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04044  adenylosuccinate synthetase  47.14 
 
 
432 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3816  Adenylosuccinate synthase  47.14 
 
 
432 aa  377  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0464  adenylosuccinate synthetase  48.23 
 
 
423 aa  377  1e-103  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4763  adenylosuccinate synthetase  47.14 
 
 
432 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.707154  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2031  adenylosuccinate synthetase  46.45 
 
 
435 aa  377  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5693  adenylosuccinate synthetase  47.14 
 
 
432 aa  377  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.580203  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4708  adenylosuccinate synthetase  47.14 
 
 
432 aa  377  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4736  adenylosuccinate synthetase  47.14 
 
 
432 aa  377  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04006  hypothetical protein  47.14 
 
 
432 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0691  adenylosuccinate synthetase  47.13 
 
 
439 aa  375  1e-103  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4648  adenylosuccinate synthetase  47.14 
 
 
432 aa  377  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.378806 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0660  adenylosuccinate synthetase  47.04 
 
 
431 aa  378  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  46.41 
 
 
444 aa  375  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  46.43 
 
 
428 aa  377  1e-103  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4634  adenylosuccinate synthetase  47.14 
 
 
432 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4727  adenylosuccinate synthetase  46.9 
 
 
432 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  46.68 
 
 
427 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4784  adenylosuccinate synthetase  46.9 
 
 
432 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  47.02 
 
 
444 aa  377  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00585  adenylosuccinate synthetase  47.06 
 
 
432 aa  375  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3836  adenylosuccinate synthetase  47.14 
 
 
432 aa  377  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.930032  hitchhiker  0.00000195768 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0497  adenylosuccinate synthetase  46.82 
 
 
432 aa  377  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0641  adenylosuccinate synthetase  46.24 
 
 
431 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143682 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>