More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0368 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1784  adenylosuccinate synthetase  73.73 
 
 		 416 aa  636    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0153593  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1671  adenylosuccinate synthetase  82.93 
 
 		 416 aa  730    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1490  adenylosuccinate synthetase  82.93 
 
 		 416 aa  730    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1370  adenylosuccinate synthetase  71.39 
 
 		 416 aa  647    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1846  adenylosuccinate synthetase  82.93 
 
 		 416 aa  730    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2131  adenylosuccinate synthetase  73.73 
 
 		 416 aa  647    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0368  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 416 aa  847    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.361154  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0370  adenylosuccinate synthetase  74.7 
 
 		 416 aa  671    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0409344  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0075  adenylosuccinate synthetase  69.16 
 
 		 419 aa  608  1e-173  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1927  adenylosuccinate synthetase  64.98 
 
 		 415 aa  569  1e-161  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  48.58 
 
 		 430 aa  412  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1816  adenylosuccinate synthetase  49.29 
 
 		 434 aa  402  1e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0322  adenylosuccinate synthetase  48.69 
 
 		 434 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2262  adenylosuccinate synthetase  49.3 
 
 		 429 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0914846 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0213  adenylosuccinate synthetase  48.36 
 
 		 434 aa  396  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.816026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2390  adenylosuccinate synthetase  48.48 
 
 		 434 aa  395  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0540  adenylosuccinate synthetase  47.21 
 
 		 432 aa  392  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311763  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2196  adenylosuccinate synthetase  48.1 
 
 		 434 aa  392  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2958  adenylosuccinate synthetase  47.62 
 
 		 428 aa  392  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2641  adenylosuccinate synthetase  47.62 
 
 		 428 aa  393  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  47.55 
 
 		 432 aa  391  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1978  adenylosuccinate synthetase  48.95 
 
 		 432 aa  390  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  48.57 
 
 		 430 aa  390  1e-107  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  46.92 
 
 		 430 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  48.1 
 
 		 430 aa  390  1e-107  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2031  adenylosuccinate synthetase  47.18 
 
 		 435 aa  387  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  48.45 
 
 		 427 aa  385  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  46.92 
 
 		 431 aa  385  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  46.46 
 
 		 433 aa  385  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0017  adenylosuccinate synthetase  47.26 
 
 		 427 aa  382  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000177457  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3716  adenylosuccinate synthetase  46.28 
 
 		 432 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316289  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3914  adenylosuccinate synthetase  46.39 
 
 		 432 aa  383  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.923104  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0215  adenylosuccinate synthetase  47.67 
 
 		 432 aa  384  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2772  adenylosuccinate synthetase  47 
 
 		 438 aa  382  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0017  adenylosuccinate synthetase  47.26 
 
 		 427 aa  382  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0497  adenylosuccinate synthetase  46.87 
 
 		 432 aa  383  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4736  adenylosuccinate synthetase  46.15 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04044  adenylosuccinate synthetase  46.15 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3816  Adenylosuccinate synthase  46.15 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4708  adenylosuccinate synthetase  46.15 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00089  adenylosuccinate synthetase  47.94 
 
 		 438 aa  380  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5693  adenylosuccinate synthetase  46.15 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.580203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4420  adenylosuccinate synthetase  46.15 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2029  adenylosuccinate synthetase  46.21 
 
 		 429 aa  380  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00381049  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4644  adenylosuccinate synthetase  46.39 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002264  adenylosuccinate synthetase  48.03 
 
 		 438 aa  380  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.151372  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3836  adenylosuccinate synthetase  46.15 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.930032  hitchhiker  0.00000195768 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5638  adenylosuccinate synthase  47.88 
 
 		 430 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.171619  normal  0.25149 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04006  hypothetical protein  46.15 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4086  adenylosuccinate synthetase  47.65 
 
 		 430 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0852587 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4634  adenylosuccinate synthetase  46.39 
 
 		 432 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  46.56 
 
 		 427 aa  381  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4727  adenylosuccinate synthetase  46.15 
 
 		 432 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4763  adenylosuccinate synthetase  46.39 
 
 		 432 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.707154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4648  adenylosuccinate synthetase  46.15 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.378806 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4784  adenylosuccinate synthetase  46.15 
 
 		 432 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2536  adenylosuccinate synthetase  47.14 
 
 		 427 aa  377  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1683  adenylosuccinate synthetase  48.01 
 
 		 429 aa  377  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.469628  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1939  adenylosuccinate synthetase  46.4 
 
 		 431 aa  378  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  46.78 
 
 		 428 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  46.32 
 
 		 432 aa  375  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0248  adenylosuccinate synthetase  46.95 
 
 		 423 aa  378  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2965  adenylosuccinate synthetase  46.79 
 
 		 430 aa  375  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.125391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3793  adenylosuccinate synthetase  45.58 
 
 		 432 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0046  adenylosuccinate synthetase  46.12 
 
 		 426 aa  377  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.268676  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  46.32 
 
 		 432 aa  375  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00585  adenylosuccinate synthetase  46.51 
 
 		 432 aa  376  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3648  adenylosuccinate synthetase  45.58 
 
 		 432 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1627  adenylosuccinate synthetase  47.78 
 
 		 533 aa  378  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35160  Adenylosuccinate synthetase  46.67 
 
 		 429 aa  376  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4774  adenylosuccinate synthetase  48.36 
 
 		 430 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1123  adenylosuccinate synthetase  46.67 
 
 		 457 aa  377  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  47.27 
 
 		 427 aa  377  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  46.45 
 
 		 426 aa  375  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0694  adenylosuccinate synthetase  45.58 
 
 		 432 aa  375  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0330  adenylosuccinate synthetase  46.03 
 
 		 431 aa  372  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7581  adenylosuccinate synthetase  47.88 
 
 		 430 aa  373  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6845  adenylosuccinate synthase  48.11 
 
 		 430 aa  372  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1231  adenylosuccinate synthetase  47.78 
 
 		 429 aa  372  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  45.82 
 
 		 427 aa  372  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  46.41 
 
 		 433 aa  373  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0999  adenylosuccinate synthase  47.17 
 
 		 448 aa  372  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.595096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08920  adenylosuccinate synthetase  45.73 
 
 		 432 aa  372  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3234  adenylosuccinate synthase  45.75 
 
 		 437 aa  375  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000199193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0436  adenylosuccinate synthetase  46.05 
 
 		 432 aa  372  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000472279 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  45.82 
 
 		 429 aa  372  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  47.99 
 
 		 427 aa  374  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  46.9 
 
 		 428 aa  373  1e-102  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1523  adenylosuccinate synthetase  48.48 
 
 		 442 aa  373  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000140547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  45.99 
 
 		 430 aa  374  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0037  adenylosuccinate synthetase  47.98 
 
 		 448 aa  373  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.505248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0607  adenylosuccinate synthetase  45.2 
 
 		 432 aa  371  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.272974 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  46.85 
 
 		 427 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1330  adenylosuccinate synthetase  46.93 
 
 		 430 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.396862  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1850  adenylosuccinate synthetase  46.19 
 
 		 430 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  44.87 
 
 		 428 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0228  adenylosuccinate synthetase  46.56 
 
 		 431 aa  369  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.043517  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  46.19 
 
 		 444 aa  369  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  45.58 
 
 		 428 aa  371  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0603  adenylosuccinate synthetase  47.88 
 
 		 430 aa  369  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>