More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1202 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1202  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 425 aa  868    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.609737  normal  0.550164 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08766  adenylosuccinate synthetase  64.85 
 
 		 423 aa  572  1.0000000000000001e-162  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0287341  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0248  adenylosuccinate synthetase  64.69 
 
 		 423 aa  570  1e-161  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2221  adenylosuccinate synthetase  64.13 
 
 		 423 aa  567  1e-160  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44855  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1608  adenylosuccinate synthetase  61.72 
 
 		 428 aa  535  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.395219  normal  0.555835 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4579  adenylosuccinate synthetase  61.81 
 
 		 431 aa  530  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.730826  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0464  adenylosuccinate synthetase  60.61 
 
 		 423 aa  515  1.0000000000000001e-145  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1701  adenylosuccinate synthetase  58.87 
 
 		 431 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.401877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7050  adenylosuccinate synthetase  57.24 
 
 		 432 aa  502  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5638  adenylosuccinate synthetase  54.85 
 
 		 424 aa  474  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0744769  normal  0.421988 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0213  adenylosuccinate synthetase  52.12 
 
 		 434 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.816026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2390  adenylosuccinate synthetase  50.35 
 
 		 434 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  47.99 
 
 		 433 aa  404  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2196  adenylosuccinate synthetase  50.59 
 
 		 434 aa  404  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1816  adenylosuccinate synthetase  49.29 
 
 		 434 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2031  adenylosuccinate synthetase  50.23 
 
 		 435 aa  401  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2262  adenylosuccinate synthetase  50 
 
 		 429 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0914846 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0322  adenylosuccinate synthetase  49.17 
 
 		 434 aa  391  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0524  adenylosuccinate synthetase  46.68 
 
 		 432 aa  385  1e-106  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  46.03 
 
 		 427 aa  377  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0330  adenylosuccinate synthetase  45.02 
 
 		 428 aa  373  1e-102  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3868  adenylosuccinate synthetase  44.76 
 
 		 442 aa  369  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.838486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  46.95 
 
 		 427 aa  369  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  46.81 
 
 		 431 aa  365  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  45.86 
 
 		 427 aa  367  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0075  adenylosuccinate synthetase  46.51 
 
 		 419 aa  364  2e-99  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2029  adenylosuccinate synthetase  45.28 
 
 		 429 aa  362  6e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00381049  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2149  adenylosuccinate synthetase  45.39 
 
 		 425 aa  362  1e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.755328  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1370  adenylosuccinate synthetase  44.26 
 
 		 416 aa  362  1e-98  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  45.13 
 
 		 451 aa  361  2e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  45.41 
 
 		 427 aa  359  6e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  45.22 
 
 		 428 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26256  adenylosuccinate synthetase  41.92 
 
 		 526 aa  358  9.999999999999999e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1271  adenylosuccinate synthetase  44.21 
 
 		 429 aa  358  9.999999999999999e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231459  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl074  adenylosuccinate synthetase  45.37 
 
 		 429 aa  356  5.999999999999999e-97  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02633  adenylosuccinate synthetase  44.44 
 
 		 430 aa  355  5.999999999999999e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1958  adenylosuccinate synthetase  43.66 
 
 		 425 aa  353  2e-96  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1784  adenylosuccinate synthetase  45.01 
 
 		 430 aa  354  2e-96  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  44.39 
 
 		 431 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1927  adenylosuccinate synthetase  44.94 
 
 		 415 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  44.63 
 
 		 433 aa  352  5e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  44.29 
 
 		 430 aa  353  5e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0492  adenylosuccinate synthetase  43.4 
 
 		 428 aa  353  5e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  44.47 
 
 		 429 aa  352  5e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  45.45 
 
 		 430 aa  352  5.9999999999999994e-96  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1719  adenylosuccinate synthetase  44.78 
 
 		 430 aa  352  5.9999999999999994e-96  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  43.36 
 
 		 427 aa  351  1e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  44.29 
 
 		 430 aa  351  1e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2131  adenylosuccinate synthetase  44.5 
 
 		 416 aa  352  1e-95  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2958  adenylosuccinate synthetase  45.05 
 
 		 428 aa  351  1e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2641  adenylosuccinate synthetase  45.05 
 
 		 428 aa  351  1e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0025  adenylosuccinate synthetase  44.08 
 
 		 426 aa  351  1e-95  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.993316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  44.92 
 
 		 427 aa  350  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1265  adenylosuccinate synthetase  45.77 
 
 		 432 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0163864  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1282  adenylosuccinate synthetase  45.56 
 
 		 431 aa  350  2e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1328  adenylosuccinate synthetase  45.1 
 
 		 432 aa  350  3e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2691  adenylosuccinate synthetase  45.77 
 
 		 432 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321196  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0750  adenylosuccinate synthetase  45.81 
 
 		 431 aa  350  4e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000682785  hitchhiker  0.00737735 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2598  adenylosuccinate synthetase  45.77 
 
 		 432 aa  350  4e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0051551  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85387  predicted protein  43.46 
 
 		 430 aa  350  4e-95  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.424834 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2266  adenylosuccinate synthetase  43.94 
 
 		 425 aa  349  4e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0370  adenylosuccinate synthetase  43.56 
 
 		 416 aa  349  4e-95  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0409344  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  44.31 
 
 		 430 aa  349  6e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3013  adenylosuccinate synthetase  44.78 
 
 		 430 aa  349  6e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.220071  normal  0.0269955 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1068  adenylosuccinate synthetase  42.96 
 
 		 428 aa  349  7e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04750  adenylosuccinate synthase, putative  44.26 
 
 		 430 aa  348  8e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.154045  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  44.86 
 
 		 427 aa  348  9e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  43.19 
 
 		 432 aa  348  1e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1671  adenylosuccinate synthetase  43.76 
 
 		 416 aa  347  2e-94  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  44.78 
 
 		 430 aa  347  2e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1490  adenylosuccinate synthetase  43.76 
 
 		 416 aa  347  2e-94  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  42.96 
 
 		 432 aa  347  2e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1939  adenylosuccinate synthetase  44.81 
 
 		 428 aa  347  2e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  42.69 
 
 		 428 aa  347  2e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3282  adenylosuccinate synthetase  43.29 
 
 		 437 aa  347  2e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00809393  normal  0.019729 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1846  adenylosuccinate synthetase  43.76 
 
 		 416 aa  347  2e-94  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  43.57 
 
 		 427 aa  347  2e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0528  adenylosuccinate synthetase  46.26 
 
 		 429 aa  347  3e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650318  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  44.13 
 
 		 430 aa  347  3e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10362  adenylosuccinate synthetase  44.44 
 
 		 432 aa  346  4e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698825  normal  0.94506 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65230  adenylosuccinate synthetase  46.23 
 
 		 430 aa  346  4e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5667  adenylosuccinate synthetase  46.23 
 
 		 430 aa  346  5e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2504  adenylosuccinate synthetase  45.54 
 
 		 431 aa  346  5e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000458788 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4219  adenylosuccinate synthetase  45.12 
 
 		 431 aa  346  5e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000317238  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2585  adenylosuccinate synthase  42.89 
 
 		 431 aa  346  6e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11510  Adenylosuccinate synthetase  42.86 
 
 		 434 aa  345  8.999999999999999e-94  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2764  adenylosuccinate synthase  43.87 
 
 		 431 aa  345  8.999999999999999e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0941  adenylosuccinate synthetase  43.84 
 
 		 435 aa  345  8.999999999999999e-94  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3291  adenylosuccinate synthetase  44.65 
 
 		 431 aa  345  1e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000376094  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3592  adenylosuccinate synthetase  45.12 
 
 		 431 aa  345  1e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000897035  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0607  adenylosuccinate synthetase  45.07 
 
 		 432 aa  344  1e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.272974 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1049  adenylosuccinate synthetase  43.6 
 
 		 435 aa  344  1e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0747  adenylosuccinate synthetase  44.76 
 
 		 431 aa  344  2e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000703533  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  43.13 
 
 		 427 aa  343  2e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0330  adenylosuccinate synthetase  45.43 
 
 		 431 aa  344  2e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0726  adenylosuccinate synthetase  44.76 
 
 		 431 aa  343  2e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0654832  hitchhiker  0.0000471969 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  43.53 
 
 		 426 aa  344  2e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0705  adenylosuccinate synthetase  44.76 
 
 		 431 aa  344  2e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00343177  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0735  adenylosuccinate synthetase  44.76 
 
 		 431 aa  344  2e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000671232  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2626  adenylosuccinate synthase  46.1 
 
 		 437 aa  344  2e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000737689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>