More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2232 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2232  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 350 aa  711    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.463237  normal  0.0169384 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0004  adenylosuccinate synthetase  77.68 
 
 		 337 aa  551  1e-156  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0005  adenylosuccinate synthetase  76.74 
 
 		 346 aa  551  1e-156  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2319  adenylosuccinate synthetase  75.3 
 
 		 337 aa  537  1e-151  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0064  adenylosuccinate synthetase  69.35 
 
 		 336 aa  491  9.999999999999999e-139  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000115242  hitchhiker  0.000142172 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0743  adenylosuccinate synthetase  57.69 
 
 		 338 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00140834  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0677  adenylosuccinate synthetase  56.8 
 
 		 338 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.41311 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1241  adenylosuccinate synthetase  57.14 
 
 		 337 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0114647  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0033  adenylosuccinate synthetase  56.55 
 
 		 336 aa  397  1e-109  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0146  adenylosuccinate synthetase  56.25 
 
 		 337 aa  394  1e-108  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00393443  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1420  adenylosuccinate synthetase  53.89 
 
 		 333 aa  378  1e-104  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0019  adenylosuccinate synthetase  42.99 
 
 		 336 aa  283  3.0000000000000004e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.617132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1964  adenylosuccinate synthetase  45.35 
 
 		 337 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0128  adenylosuccinate synthetase  43.84 
 
 		 334 aa  276  3e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0162  adenylosuccinate synthetase  44.41 
 
 		 334 aa  275  6e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1220  Adenylosuccinate synthase  41.69 
 
 		 335 aa  273  3e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200996  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0146  adenylosuccinate synthetase  43.81 
 
 		 332 aa  268  1e-70  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.531372  normal  0.191753 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1196  adenylosuccinate synthetase  42.3 
 
 		 334 aa  259  3e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0015  adenylosuccinate synthetase  40.48 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000196036  normal  0.0126394 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1359  adenylosuccinate synthase  40.3 
 
 		 338 aa  225  1e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  36.04 
 
 		 427 aa  188  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0115  adenylosuccinate synthase  36.53 
 
 		 433 aa  187  3e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  33.8 
 
 		 431 aa  187  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0017  adenylosuccinate synthetase  36.12 
 
 		 427 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000177457  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  36.69 
 
 		 451 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0017  adenylosuccinate synthetase  36.12 
 
 		 427 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  35.27 
 
 		 428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  35.21 
 
 		 447 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  36.98 
 
 		 444 aa  183  3e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  35.21 
 
 		 447 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2536  adenylosuccinate synthetase  35.15 
 
 		 427 aa  181  1e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3282  adenylosuccinate synthetase  32.48 
 
 		 437 aa  181  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00809393  normal  0.019729 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  36.12 
 
 		 427 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  30.52 
 
 		 427 aa  181  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2532  adenylosuccinate synthetase  32.08 
 
 		 445 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2149  adenylosuccinate synthetase  32.01 
 
 		 425 aa  179  5.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.755328  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  31 
 
 		 427 aa  179  9e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  35.1 
 
 		 449 aa  179  9e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  36.58 
 
 		 447 aa  178  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1939  adenylosuccinate synthetase  34.72 
 
 		 428 aa  178  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1068  adenylosuccinate synthetase  32.71 
 
 		 428 aa  178  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0444  adenylosuccinate synthase  35.69 
 
 		 430 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.774885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  32.08 
 
 		 427 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  30.75 
 
 		 427 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4119  adenylosuccinate synthetase  35.91 
 
 		 428 aa  177  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0180773  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  34.13 
 
 		 427 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  30.75 
 
 		 427 aa  176  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2958  adenylosuccinate synthetase  30.39 
 
 		 428 aa  176  5e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0498  Adenylosuccinate synthase  37.85 
 
 		 550 aa  176  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000018536  hitchhiker  0.00191314 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2641  adenylosuccinate synthetase  30.39 
 
 		 428 aa  176  7e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  36.12 
 
 		 428 aa  175  9.999999999999999e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2289  adenylosuccinate synthetase  31.07 
 
 		 426 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  33.14 
 
 		 444 aa  174  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05701  adenylosuccinate synthetase  33.15 
 
 		 436 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0390  adenylosuccinate synthetase  29.37 
 
 		 429 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000168216  decreased coverage  0.00000000000000193534 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2857  adenylosuccinate synthetase  31.18 
 
 		 445 aa  174  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4214  adenylosuccinate synthase  35.69 
 
 		 430 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.855707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2533  adenylosuccinate synthase  35.61 
 
 		 426 aa  173  2.9999999999999996e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000265596  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  32.18 
 
 		 430 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  34.43 
 
 		 430 aa  172  5e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  34.33 
 
 		 430 aa  172  5.999999999999999e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1304  adenylosuccinate synthetase  38.18 
 
 		 421 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1583  adenylosuccinate synthetase  31.49 
 
 		 440 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.147694  unclonable  0.000000227018 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1281  adenylosuccinate synthetase  30.65 
 
 		 446 aa  171  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1720  adenylosuccinate synthetase  33.33 
 
 		 397 aa  171  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1647  adenylosuccinate synthetase  33.08 
 
 		 397 aa  172  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  34.13 
 
 		 427 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  34.52 
 
 		 428 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2585  adenylosuccinate synthase  31.22 
 
 		 431 aa  171  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0330  adenylosuccinate synthetase  31.37 
 
 		 428 aa  171  2e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0119  adenylosuccinate synthetase  31.21 
 
 		 423 aa  171  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4635  adenylosuccinate synthetase  31.22 
 
 		 427 aa  170  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.595604  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1839  adenylosuccinate synthetase  31.09 
 
 		 437 aa  170  4e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05641  adenylosuccinate synthetase  31.09 
 
 		 437 aa  170  4e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.622975 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1985  adenylosuccinate synthetase  31.18 
 
 		 444 aa  170  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.151418 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0403  adenylosuccinate synthetase  31.37 
 
 		 424 aa  169  5e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.841501 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2963  adenylosuccinate synthetase  33.33 
 
 		 428 aa  169  7e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  29.74 
 
 		 427 aa  169  8e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2004  adenylosuccinate synthase  32.01 
 
 		 561 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00819563  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3357  adenylosuccinate synthetase  30.61 
 
 		 431 aa  168  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0113184  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  33.93 
 
 		 428 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4579  adenylosuccinate synthetase  30.59 
 
 		 431 aa  168  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.730826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2416  adenylosuccinate synthetase  32.63 
 
 		 428 aa  168  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  30.25 
 
 		 433 aa  167  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0726  adenylosuccinate synthetase  29.98 
 
 		 431 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0654832  hitchhiker  0.0000471969 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0735  adenylosuccinate synthetase  29.74 
 
 		 431 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000671232  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1841  Adenylosuccinate synthase  35.14 
 
 		 430 aa  168  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.842522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3649  adenylosuccinate synthetase  29.74 
 
 		 431 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000709559  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  35.93 
 
 		 427 aa  167  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05631  adenylosuccinate synthetase  31 
 
 		 436 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2661  adenylosuccinate synthetase  30.75 
 
 		 431 aa  167  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05071  adenylosuccinate synthetase  30.71 
 
 		 437 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.22054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2262  adenylosuccinate synthetase  31.41 
 
 		 429 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0914846 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3138  adenylosuccinate synthetase  33.53 
 
 		 430 aa  167  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32892  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2390  adenylosuccinate synthetase  30.91 
 
 		 434 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3914  adenylosuccinate synthetase  30.44 
 
 		 432 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.923104  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  32.3 
 
 		 430 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0139  adenylosuccinate synthetase  33.73 
 
 		 429 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000561019 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35160  Adenylosuccinate synthetase  33.83 
 
 		 429 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0133  adenylosuccinate synthase  32.85 
 
 		 807 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279104  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>