More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0004 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0004  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 337 aa  685    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2232  adenylosuccinate synthetase  77.68 
 
 		 350 aa  551  1e-156  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.463237  normal  0.0169384 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0005  adenylosuccinate synthetase  78.21 
 
 		 346 aa  542  1e-153  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2319  adenylosuccinate synthetase  73.21 
 
 		 337 aa  529  1e-149  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0064  adenylosuccinate synthetase  67.46 
 
 		 336 aa  472  1e-132  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000115242  hitchhiker  0.000142172 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1241  adenylosuccinate synthetase  57.57 
 
 		 337 aa  412  1e-114  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0114647  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0677  adenylosuccinate synthetase  57.1 
 
 		 338 aa  408  1e-113  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.41311 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0146  adenylosuccinate synthetase  56.08 
 
 		 337 aa  401  1e-111  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00393443  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0743  adenylosuccinate synthetase  55.92 
 
 		 338 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00140834  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0033  adenylosuccinate synthetase  54.46 
 
 		 336 aa  385  1e-106  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1420  adenylosuccinate synthetase  53.29 
 
 		 333 aa  370  1e-101  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1220  Adenylosuccinate synthase  42.04 
 
 		 335 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200996  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0019  adenylosuccinate synthetase  42.09 
 
 		 336 aa  281  1e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.617132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1964  adenylosuccinate synthetase  45.05 
 
 		 337 aa  281  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0128  adenylosuccinate synthetase  44.74 
 
 		 334 aa  280  3e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0162  adenylosuccinate synthetase  43.81 
 
 		 334 aa  275  8e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0146  adenylosuccinate synthetase  43.81 
 
 		 332 aa  272  6e-72  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.531372  normal  0.191753 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1196  adenylosuccinate synthetase  43.81 
 
 		 334 aa  272  6e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0015  adenylosuccinate synthetase  41.74 
 
 		 337 aa  270  2.9999999999999997e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000196036  normal  0.0126394 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1359  adenylosuccinate synthase  39.4 
 
 		 338 aa  216  7e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  31.69 
 
 		 451 aa  191  1e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1939  adenylosuccinate synthetase  31.15 
 
 		 428 aa  191  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  30.91 
 
 		 427 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1583  adenylosuccinate synthetase  31.95 
 
 		 440 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.147694  unclonable  0.000000227018 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3138  adenylosuccinate synthetase  32.24 
 
 		 430 aa  188  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32892  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0017  adenylosuccinate synthetase  36.61 
 
 		 427 aa  187  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000177457  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0017  adenylosuccinate synthetase  36.61 
 
 		 427 aa  187  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  35.21 
 
 		 447 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  35.21 
 
 		 447 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1985  adenylosuccinate synthetase  30.72 
 
 		 444 aa  182  6e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.151418 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2857  adenylosuccinate synthetase  30.95 
 
 		 445 aa  182  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  34.43 
 
 		 427 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  36.69 
 
 		 428 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00585  adenylosuccinate synthetase  30.21 
 
 		 432 aa  181  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2536  adenylosuccinate synthetase  35.71 
 
 		 427 aa  181  2e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0578  adenylosuccinate synthetase  30.05 
 
 		 432 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000001206 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  30.5 
 
 		 427 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0215  adenylosuccinate synthetase  29.51 
 
 		 432 aa  179  4e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  34.52 
 
 		 427 aa  180  4e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1281  adenylosuccinate synthetase  30.18 
 
 		 446 aa  179  4.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  30.84 
 
 		 427 aa  179  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0115  adenylosuccinate synthase  34.43 
 
 		 433 aa  179  5.999999999999999e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  29.79 
 
 		 432 aa  178  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0676  adenylosuccinate synthetase  30.43 
 
 		 446 aa  178  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.678663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2289  adenylosuccinate synthetase  31.22 
 
 		 426 aa  178  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3069  adenylosuccinate synthetase  30.07 
 
 		 431 aa  178  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00455582  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0436  adenylosuccinate synthetase  30.68 
 
 		 432 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000472279 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  29.34 
 
 		 427 aa  177  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  31.8 
 
 		 431 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  31.4 
 
 		 427 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2585  adenylosuccinate synthase  30.52 
 
 		 431 aa  177  3e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  30.88 
 
 		 432 aa  176  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0695  adenylosuccinate synthetase  30.17 
 
 		 431 aa  176  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000192259  hitchhiker  0.0000489804 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3266  adenylosuccinate synthetase  30.17 
 
 		 431 aa  176  5e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000110825  hitchhiker  0.0000153755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0681  adenylosuccinate synthetase  30.17 
 
 		 431 aa  176  5e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00011524  hitchhiker  0.00031126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  30.05 
 
 		 427 aa  176  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0046  adenylosuccinate synthetase  30.55 
 
 		 426 aa  176  5e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.268676  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1049  adenylosuccinate synthetase  30 
 
 		 435 aa  176  6e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2149  adenylosuccinate synthetase  30.12 
 
 		 425 aa  176  6e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.755328  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  30.88 
 
 		 430 aa  176  6e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0390  adenylosuccinate synthetase  28.9 
 
 		 429 aa  175  8e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000168216  decreased coverage  0.00000000000000193534 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0603  adenylosuccinate synthetase  30.63 
 
 		 430 aa  175  8e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0509  adenylosuccinate synthetase  31.12 
 
 		 431 aa  175  9e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00567032  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  31.03 
 
 		 433 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  34.72 
 
 		 444 aa  175  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2958  adenylosuccinate synthetase  29.6 
 
 		 428 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2262  adenylosuccinate synthetase  31.41 
 
 		 429 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0914846 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  30.02 
 
 		 432 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3937  adenylosuccinate synthetase  30.5 
 
 		 431 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4635  adenylosuccinate synthetase  29.81 
 
 		 427 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.595604  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2974  adenylosuccinate synthetase  32 
 
 		 435 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0607  adenylosuccinate synthetase  29.81 
 
 		 432 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.272974 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4219  adenylosuccinate synthetase  29.21 
 
 		 431 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000317238  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0510  adenylosuccinate synthetase  30.86 
 
 		 429 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.37093  normal  0.446838 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  33.73 
 
 		 449 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1460  adenylosuccinate synthetase  35.14 
 
 		 427 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.57165  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0747  adenylosuccinate synthetase  30.17 
 
 		 431 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000703533  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0705  adenylosuccinate synthetase  30.17 
 
 		 431 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00343177  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0941  adenylosuccinate synthetase  29.76 
 
 		 435 aa  173  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  29.81 
 
 		 427 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10362  adenylosuccinate synthetase  30.54 
 
 		 432 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698825  normal  0.94506 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  30.52 
 
 		 427 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2683  adenylosuccinate synthetase  31.4 
 
 		 429 aa  173  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  34.02 
 
 		 444 aa  174  2.9999999999999996e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2641  adenylosuccinate synthetase  29.37 
 
 		 428 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0726  adenylosuccinate synthetase  30.17 
 
 		 431 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0654832  hitchhiker  0.0000471969 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05701  adenylosuccinate synthetase  32.97 
 
 		 436 aa  173  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0528  adenylosuccinate synthetase  30.05 
 
 		 429 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650318  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0735  adenylosuccinate synthetase  30.17 
 
 		 431 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000671232  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3649  adenylosuccinate synthetase  30.17 
 
 		 431 aa  173  5e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000709559  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3379  adenylosuccinate synthetase  32.48 
 
 		 436 aa  173  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  29.3 
 
 		 428 aa  173  5e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3019  adenylosuccinate synthetase  30.28 
 
 		 424 aa  172  5e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0990  adenylosuccinate synthetase  31.53 
 
 		 429 aa  172  5e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3357  adenylosuccinate synthetase  30.64 
 
 		 431 aa  173  5e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0113184  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  29.43 
 
 		 431 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0498  Adenylosuccinate synthase  35.57 
 
 		 550 aa  172  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000018536  hitchhiker  0.00191314 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2031  adenylosuccinate synthetase  30.46 
 
 		 435 aa  172  6.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  29.07 
 
 		 428 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0330  adenylosuccinate synthetase  29.43 
 
 		 428 aa  172  9e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>