More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1420 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1420  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 333 aa  671    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2319  adenylosuccinate synthetase  54.65 
 
 		 337 aa  379  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2232  adenylosuccinate synthetase  53.89 
 
 		 350 aa  378  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.463237  normal  0.0169384 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1241  adenylosuccinate synthetase  55.79 
 
 		 337 aa  375  1e-103  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0114647  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0743  adenylosuccinate synthetase  56.8 
 
 		 338 aa  377  1e-103  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00140834  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0677  adenylosuccinate synthetase  55.62 
 
 		 338 aa  372  1e-102  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.41311 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0033  adenylosuccinate synthetase  54.76 
 
 		 336 aa  373  1e-102  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0146  adenylosuccinate synthetase  56.08 
 
 		 337 aa  374  1e-102  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00393443  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0004  adenylosuccinate synthetase  53.29 
 
 		 337 aa  370  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0005  adenylosuccinate synthetase  53.59 
 
 		 346 aa  363  2e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0019  adenylosuccinate synthetase  51.95 
 
 		 336 aa  358  9.999999999999999e-98  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.617132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0146  adenylosuccinate synthetase  52.12 
 
 		 332 aa  351  1e-95  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.531372  normal  0.191753 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0162  adenylosuccinate synthetase  52.12 
 
 		 334 aa  350  2e-95  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0128  adenylosuccinate synthetase  51.36 
 
 		 334 aa  348  7e-95  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1196  adenylosuccinate synthetase  50.61 
 
 		 334 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0064  adenylosuccinate synthetase  50.9 
 
 		 336 aa  335  7e-91  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000115242  hitchhiker  0.000142172 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0015  adenylosuccinate synthetase  50.15 
 
 		 337 aa  330  2e-89  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000196036  normal  0.0126394 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1220  Adenylosuccinate synthase  48.64 
 
 		 335 aa  323  2e-87  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200996  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1964  adenylosuccinate synthetase  44.71 
 
 		 337 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1359  adenylosuccinate synthase  43.95 
 
 		 338 aa  236  3e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0403  adenylosuccinate synthetase  35.8 
 
 		 424 aa  222  9e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.841501 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0119  adenylosuccinate synthetase  42.09 
 
 		 423 aa  216  4e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  36.56 
 
 		 427 aa  206  4e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0677  adenylosuccinate synthetase  34.2 
 
 		 429 aa  199  6e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0645  adenylosuccinate synthetase  34.43 
 
 		 429 aa  199  6e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1810  adenylosuccinate synthetase  34.67 
 
 		 429 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.2738  normal  0.518624 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1841  Adenylosuccinate synthase  37.76 
 
 		 430 aa  196  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.842522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  35.62 
 
 		 428 aa  196  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0498  Adenylosuccinate synthase  38.7 
 
 		 550 aa  196  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000018536  hitchhiker  0.00191314 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1939  adenylosuccinate synthetase  32.79 
 
 		 428 aa  196  7e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2390  adenylosuccinate synthetase  32.24 
 
 		 434 aa  194  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  33.1 
 
 		 427 aa  195  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  32.17 
 
 		 451 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  31.92 
 
 		 427 aa  194  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2262  adenylosuccinate synthetase  34.12 
 
 		 429 aa  194  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0914846 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1068  adenylosuccinate synthetase  33.49 
 
 		 428 aa  194  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  32.32 
 
 		 427 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  33.41 
 
 		 428 aa  193  3e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  32.55 
 
 		 427 aa  193  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3069  adenylosuccinate synthetase  34.98 
 
 		 431 aa  193  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00455582  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  38.58 
 
 		 447 aa  193  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0509  adenylosuccinate synthetase  34.2 
 
 		 431 aa  192  5e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00567032  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2289  adenylosuccinate synthetase  33.49 
 
 		 426 aa  192  6e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3291  adenylosuccinate synthetase  34.67 
 
 		 431 aa  192  7e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000376094  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2196  adenylosuccinate synthetase  32.08 
 
 		 434 aa  192  7e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3234  adenylosuccinate synthase  33.87 
 
 		 437 aa  192  9e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000199193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  33.96 
 
 		 432 aa  192  9e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0607  adenylosuccinate synthetase  32.16 
 
 		 432 aa  191  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.272974 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  37.2 
 
 		 444 aa  191  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  38.69 
 
 		 447 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  38.69 
 
 		 447 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1304  adenylosuccinate synthetase  39.46 
 
 		 421 aa  191  1e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1647  adenylosuccinate synthetase  35.52 
 
 		 397 aa  191  2e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3379  adenylosuccinate synthetase  32.64 
 
 		 436 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0735  adenylosuccinate synthetase  34.67 
 
 		 431 aa  189  5e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000671232  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0726  adenylosuccinate synthetase  34.67 
 
 		 431 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0654832  hitchhiker  0.0000471969 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  37.61 
 
 		 427 aa  189  7e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1720  adenylosuccinate synthetase  35.01 
 
 		 397 aa  189  8e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3649  adenylosuccinate synthetase  34.67 
 
 		 431 aa  189  8e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000709559  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  36.8 
 
 		 449 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0747  adenylosuccinate synthetase  34.67 
 
 		 431 aa  188  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000703533  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3266  adenylosuccinate synthetase  34.2 
 
 		 431 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000110825  hitchhiker  0.0000153755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0681  adenylosuccinate synthetase  34.2 
 
 		 431 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00011524  hitchhiker  0.00031126 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0705  adenylosuccinate synthetase  34.43 
 
 		 431 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00343177  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0461  adenylosuccinate synthetase  32.94 
 
 		 430 aa  187  2e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2909  Adenylosuccinate synthetase  33.49 
 
 		 429 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2031  adenylosuccinate synthetase  31.29 
 
 		 435 aa  187  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1049  adenylosuccinate synthetase  32.78 
 
 		 435 aa  187  2e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05701  adenylosuccinate synthetase  38.87 
 
 		 436 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0695  adenylosuccinate synthetase  34.2 
 
 		 431 aa  187  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000192259  hitchhiker  0.0000489804 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  31.84 
 
 		 430 aa  187  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  31.63 
 
 		 431 aa  186  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002264  adenylosuccinate synthetase  33.26 
 
 		 438 aa  187  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.151372  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0444  adenylosuccinate synthase  34.52 
 
 		 430 aa  186  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.774885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3357  adenylosuccinate synthetase  33.49 
 
 		 431 aa  187  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0113184  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  31.25 
 
 		 430 aa  186  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3592  adenylosuccinate synthetase  33.73 
 
 		 431 aa  186  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000897035  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05631  adenylosuccinate synthetase  38.69 
 
 		 436 aa  186  4e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0115  adenylosuccinate synthase  36.9 
 
 		 433 aa  186  4e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  32.08 
 
 		 427 aa  186  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0507  adenylosuccinate synthetase  38.28 
 
 		 436 aa  186  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  32.71 
 
 		 427 aa  186  5e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00089  adenylosuccinate synthetase  33.02 
 
 		 438 aa  186  6e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  37.69 
 
 		 444 aa  186  6e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2221  adenylosuccinate synthetase  33.8 
 
 		 423 aa  186  6e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44855  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2126  adenylosuccinate synthetase  37.8 
 
 		 428 aa  186  6e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05331  adenylosuccinate synthetase  38.39 
 
 		 436 aa  186  7e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0322  adenylosuccinate synthetase  31.76 
 
 		 434 aa  186  7e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0528  adenylosuccinate synthetase  32.87 
 
 		 429 aa  185  8e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650318  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0750  adenylosuccinate synthetase  33.73 
 
 		 431 aa  185  8e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000682785  hitchhiker  0.00737735 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3937  adenylosuccinate synthetase  33.96 
 
 		 431 aa  185  9e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00585  adenylosuccinate synthetase  32.94 
 
 		 432 aa  185  9e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  30.93 
 
 		 427 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  30.86 
 
 		 431 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3635  adenylosuccinate synthetase  31.76 
 
 		 429 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.336244 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0941  adenylosuccinate synthetase  32.55 
 
 		 435 aa  184  1.0000000000000001e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2974  adenylosuccinate synthetase  32.02 
 
 		 435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1370  adenylosuccinate synthetase  32.36 
 
 		 416 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2149  adenylosuccinate synthetase  33.41 
 
 		 425 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.755328  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4219  adenylosuccinate synthetase  33.25 
 
 		 431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000317238  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>