More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0005 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0005  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 346 aa  704    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2232  adenylosuccinate synthetase  76.74 
 
 		 350 aa  551  1e-156  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.463237  normal  0.0169384 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2319  adenylosuccinate synthetase  75.82 
 
 		 337 aa  545  1e-154  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0004  adenylosuccinate synthetase  78.21 
 
 		 337 aa  542  1e-153  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0064  adenylosuccinate synthetase  68.15 
 
 		 336 aa  481  1e-134  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000115242  hitchhiker  0.000142172 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0743  adenylosuccinate synthetase  55.03 
 
 		 338 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00140834  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0677  adenylosuccinate synthetase  54.73 
 
 		 338 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.41311 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1241  adenylosuccinate synthetase  54.76 
 
 		 337 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0114647  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0146  adenylosuccinate synthetase  54.76 
 
 		 337 aa  397  1e-109  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00393443  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0033  adenylosuccinate synthetase  55.06 
 
 		 336 aa  389  1e-107  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1420  adenylosuccinate synthetase  53.59 
 
 		 333 aa  363  2e-99  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1964  adenylosuccinate synthetase  47.75 
 
 		 337 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0019  adenylosuccinate synthetase  43.28 
 
 		 336 aa  282  6.000000000000001e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.617132  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1220  Adenylosuccinate synthase  40.66 
 
 		 335 aa  269  5e-71  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200996  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0128  adenylosuccinate synthetase  43.54 
 
 		 334 aa  268  1e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0162  adenylosuccinate synthetase  42.9 
 
 		 334 aa  262  6.999999999999999e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0015  adenylosuccinate synthetase  41.09 
 
 		 337 aa  261  8.999999999999999e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000196036  normal  0.0126394 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0146  adenylosuccinate synthetase  42.9 
 
 		 332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.531372  normal  0.191753 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1196  adenylosuccinate synthetase  41.99 
 
 		 334 aa  250  3e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1359  adenylosuccinate synthase  41.54 
 
 		 338 aa  223  4e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  31.24 
 
 		 427 aa  188  9e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  31.62 
 
 		 427 aa  187  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0444  adenylosuccinate synthase  32.71 
 
 		 430 aa  186  5e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.774885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4119  adenylosuccinate synthetase  34.52 
 
 		 428 aa  185  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0180773  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1841  Adenylosuccinate synthase  36.76 
 
 		 430 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.842522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  33.26 
 
 		 427 aa  184  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  33.7 
 
 		 427 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  30.52 
 
 		 427 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0017  adenylosuccinate synthetase  36.12 
 
 		 427 aa  182  7e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0017  adenylosuccinate synthetase  36.12 
 
 		 427 aa  182  7e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000177457  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10362  adenylosuccinate synthetase  32.41 
 
 		 432 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698825  normal  0.94506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  30.93 
 
 		 427 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  30.75 
 
 		 451 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0498  Adenylosuccinate synthase  37.46 
 
 		 550 aa  180  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000018536  hitchhiker  0.00191314 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  31.52 
 
 		 427 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1939  adenylosuccinate synthetase  31.15 
 
 		 428 aa  180  4e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00585  adenylosuccinate synthetase  30.12 
 
 		 432 aa  179  4.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4214  adenylosuccinate synthase  32.71 
 
 		 430 aa  179  5.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.855707  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2536  adenylosuccinate synthetase  35.52 
 
 		 427 aa  178  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4635  adenylosuccinate synthetase  30.61 
 
 		 427 aa  178  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.595604  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0119  adenylosuccinate synthetase  30.66 
 
 		 423 aa  177  3e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0115  adenylosuccinate synthase  34.43 
 
 		 433 aa  177  3e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0645  adenylosuccinate synthetase  30.81 
 
 		 429 aa  176  6e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  32.31 
 
 		 427 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0215  adenylosuccinate synthetase  29.72 
 
 		 432 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  30.97 
 
 		 427 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  30.25 
 
 		 427 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0228  adenylosuccinate synthetase  31.4 
 
 		 431 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.043517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  33.23 
 
 		 427 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1583  adenylosuccinate synthetase  30.79 
 
 		 440 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.147694  unclonable  0.000000227018 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  31.06 
 
 		 433 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2149  adenylosuccinate synthetase  30.35 
 
 		 425 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.755328  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0677  adenylosuccinate synthetase  30.33 
 
 		 429 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  30.7 
 
 		 431 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0515  adenylosuccinate synthetase  31.16 
 
 		 431 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0526  adenylosuccinate synthetase  31.16 
 
 		 431 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  34.42 
 
 		 447 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1985  adenylosuccinate synthetase  31.63 
 
 		 444 aa  172  5e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.151418 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  34.42 
 
 		 447 aa  172  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2125  Adenylosuccinate synthase  30.73 
 
 		 423 aa  172  5.999999999999999e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.9394  normal  0.847855 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0504  adenylosuccinate synthetase  30.93 
 
 		 431 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3868  adenylosuccinate synthetase  31.43 
 
 		 442 aa  172  9e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.838486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  34.72 
 
 		 447 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2004  adenylosuccinate synthase  32.41 
 
 		 561 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00819563  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2416  adenylosuccinate synthetase  33.83 
 
 		 428 aa  171  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1068  adenylosuccinate synthetase  29.95 
 
 		 428 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2126  adenylosuccinate synthetase  30.37 
 
 		 428 aa  172  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  29.51 
 
 		 428 aa  171  1e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2857  adenylosuccinate synthetase  30.93 
 
 		 445 aa  171  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  35.01 
 
 		 444 aa  171  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05701  adenylosuccinate synthetase  34.32 
 
 		 436 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0540  adenylosuccinate synthetase  29.48 
 
 		 432 aa  171  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311763  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07421  adenylosuccinate synthetase  33.04 
 
 		 439 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2764  adenylosuccinate synthase  30.26 
 
 		 431 aa  171  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0403  adenylosuccinate synthetase  30.95 
 
 		 424 aa  170  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.841501 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0507  adenylosuccinate synthetase  33.14 
 
 		 436 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  29.21 
 
 		 428 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  33.83 
 
 		 428 aa  170  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3138  adenylosuccinate synthetase  32.6 
 
 		 430 aa  169  5e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32892  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0497  adenylosuccinate synthetase  29.25 
 
 		 432 aa  169  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3282  adenylosuccinate synthetase  35.18 
 
 		 437 aa  169  5e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00809393  normal  0.019729 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3019  adenylosuccinate synthetase  30.68 
 
 		 424 aa  169  5e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3379  adenylosuccinate synthetase  31.53 
 
 		 436 aa  169  6e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0610  Adenylosuccinate synthase  34.56 
 
 		 507 aa  169  6e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0278665  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2390  adenylosuccinate synthetase  31.41 
 
 		 434 aa  169  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  28.74 
 
 		 428 aa  169  7e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3544  adenylosuccinate synthetase  30.99 
 
 		 432 aa  169  7e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0747  adenylosuccinate synthetase  29.65 
 
 		 431 aa  169  8e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000703533  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1460  adenylosuccinate synthetase  34.13 
 
 		 427 aa  169  8e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.57165  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0436  adenylosuccinate synthetase  29.25 
 
 		 432 aa  168  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000472279 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3089  adenylosuccinate synthetase  31.69 
 
 		 432 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126084  normal  0.070043 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2585  adenylosuccinate synthase  30.73 
 
 		 431 aa  169  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1810  adenylosuccinate synthetase  29.86 
 
 		 429 aa  168  1e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.2738  normal  0.518624 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2963  adenylosuccinate synthetase  31.47 
 
 		 428 aa  168  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2262  adenylosuccinate synthetase  30.55 
 
 		 429 aa  168  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0914846 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1304  adenylosuccinate synthetase  37.46 
 
 		 421 aa  168  1e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3069  adenylosuccinate synthetase  29.93 
 
 		 431 aa  168  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00455582  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0677  adenylosuccinate synthetase  30.93 
 
 		 431 aa  168  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3346  adenylosuccinate synthetase  31.46 
 
 		 432 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.474516  hitchhiker  0.00582802 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2661  adenylosuccinate synthetase  30.02 
 
 		 431 aa  167  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>