More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_2125 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_2125  Adenylosuccinate synthase  100 
 
 
423 aa  874    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.9394  normal  0.847855 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  49.76 
 
 
433 aa  443  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  50 
 
 
431 aa  444  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  50.24 
 
 
430 aa  444  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2419  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 
424 aa  443  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000351382  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  48.23 
 
 
426 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  48.7 
 
 
430 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1523  adenylosuccinate synthetase  48.83 
 
 
442 aa  439  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000140547  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  49.53 
 
 
427 aa  435  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2536  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 
427 aa  435  1e-121  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  47.62 
 
 
430 aa  436  1e-121  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  49.29 
 
 
447 aa  436  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  48.34 
 
 
424 aa  436  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  49.06 
 
 
444 aa  436  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  48.82 
 
 
447 aa  435  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  47.86 
 
 
430 aa  437  1e-121  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  47.87 
 
 
428 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  51.41 
 
 
451 aa  432  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  48.82 
 
 
447 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  48.35 
 
 
429 aa  431  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  49.06 
 
 
427 aa  429  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2207  adenylosuccinate synthetase  48 
 
 
430 aa  431  1e-119  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  50 
 
 
444 aa  427  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2958  adenylosuccinate synthetase  47.74 
 
 
428 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2641  adenylosuccinate synthetase  47.51 
 
 
428 aa  425  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3282  adenylosuccinate synthetase  48.82 
 
 
437 aa  427  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00809393  normal  0.019729 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  49.06 
 
 
430 aa  427  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0017  adenylosuccinate synthetase  48.22 
 
 
427 aa  424  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000177457  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4774  adenylosuccinate synthetase  48.23 
 
 
430 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0017  adenylosuccinate synthetase  48.22 
 
 
427 aa  424  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  47.17 
 
 
428 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  47.41 
 
 
449 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 
427 aa  424  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  46.46 
 
 
428 aa  420  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1330  adenylosuccinate synthetase  47.99 
 
 
430 aa  418  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.396862  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1271  adenylosuccinate synthetase  48.11 
 
 
429 aa  420  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231459  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  47.41 
 
 
432 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5320  adenylosuccinate synthetase  47.64 
 
 
429 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000159422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5148  adenylosuccinate synthetase  47.64 
 
 
429 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.87247e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0875  adenylosuccinate synthetase  50 
 
 
430 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2504  adenylosuccinate synthetase  47.41 
 
 
431 aa  415  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000458788 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5716  adenylosuccinate synthetase  47.64 
 
 
429 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000188586  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  48.82 
 
 
427 aa  417  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2029  adenylosuccinate synthetase  47.17 
 
 
429 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00381049  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5577  adenylosuccinate synthetase  47.64 
 
 
429 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.85689e-26 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0940  Adenylosuccinate synthase  48.1 
 
 
430 aa  412  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2532  adenylosuccinate synthetase  50.35 
 
 
445 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5164  adenylosuccinate synthetase  48.11 
 
 
429 aa  412  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000038286  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2691  adenylosuccinate synthetase  47.88 
 
 
432 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321196  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5260  adenylosuccinate synthetase  47.41 
 
 
429 aa  412  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000740199  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07421  adenylosuccinate synthetase  46.93 
 
 
439 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  47.74 
 
 
427 aa  412  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4086  adenylosuccinate synthetase  47.75 
 
 
430 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0852587 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5655  adenylosuccinate synthetase  48.11 
 
 
429 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000753015  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3894  adenylosuccinate synthetase  47.28 
 
 
430 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.108834  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1850  adenylosuccinate synthetase  47.75 
 
 
430 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5341  adenylosuccinate synthetase  47.64 
 
 
429 aa  413  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000698384  hitchhiker  0.0000000000916292 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05071  adenylosuccinate synthetase  47.32 
 
 
437 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.22054  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2598  adenylosuccinate synthetase  47.88 
 
 
432 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0051551  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2909  Adenylosuccinate synthetase  47.14 
 
 
429 aa  413  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270112  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  47.17 
 
 
432 aa  414  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5617  adenylosuccinate synthetase  47.88 
 
 
429 aa  410  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000421439  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2965  adenylosuccinate synthetase  46.34 
 
 
430 aa  408  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.125391  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1939  adenylosuccinate synthetase  47.89 
 
 
428 aa  410  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1265  adenylosuccinate synthetase  47.88 
 
 
432 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0163864  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  48.58 
 
 
430 aa  411  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1123  adenylosuccinate synthetase  46.34 
 
 
457 aa  410  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1969  adenylosuccinate synthetase  47.67 
 
 
437 aa  409  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.769944  normal  0.0974254 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5594  adenylosuccinate synthetase  47.88 
 
 
429 aa  411  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000767866  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2742  adenylosuccinate synthetase  47.75 
 
 
431 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0436902 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2010  adenylosuccinate synthetase  48.1 
 
 
430 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.34638  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0962  Adenylosuccinate synthase  47.38 
 
 
430 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.470264  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0037  adenylosuccinate synthetase  47.64 
 
 
448 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.505248  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  47.14 
 
 
433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0366  adenylosuccinate synthetase  48.34 
 
 
430 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08920  adenylosuccinate synthetase  47.63 
 
 
432 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1667  adenylosuccinate synthetase  46.23 
 
 
439 aa  405  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05331  adenylosuccinate synthetase  46.7 
 
 
436 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02633  adenylosuccinate synthetase  45.52 
 
 
430 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11510  Adenylosuccinate synthetase  47.76 
 
 
434 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0999  adenylosuccinate synthase  47.38 
 
 
448 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.595096  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2289  adenylosuccinate synthetase  47.65 
 
 
426 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1683  adenylosuccinate synthetase  46.92 
 
 
429 aa  402  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.469628  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0046  adenylosuccinate synthetase  46.78 
 
 
426 aa  402  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.268676  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05631  adenylosuccinate synthetase  46.23 
 
 
436 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6845  adenylosuccinate synthase  47.99 
 
 
430 aa  402  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  46.23 
 
 
431 aa  402  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0691  adenylosuccinate synthetase  45.52 
 
 
439 aa  403  1e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0507  adenylosuccinate synthetase  45.99 
 
 
436 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1106  adenylosuccinate synthetase  47.75 
 
 
429 aa  403  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7581  adenylosuccinate synthetase  48.23 
 
 
430 aa  402  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5638  adenylosuccinate synthase  46.81 
 
 
430 aa  402  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.171619  normal  0.25149 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1627  adenylosuccinate synthetase  46.92 
 
 
533 aa  402  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05701  adenylosuccinate synthetase  45.75 
 
 
436 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0390  adenylosuccinate synthetase  46.56 
 
 
429 aa  402  1e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000168216  decreased coverage  0.00000000000000193534 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1816  adenylosuccinate synthetase  46.45 
 
 
434 aa  398  9.999999999999999e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  47.06 
 
 
427 aa  398  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3179  adenylosuccinate synthetase  47.28 
 
 
431 aa  398  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2270  adenylosuccinate synthetase  49.3 
 
 
418 aa  401  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3019  adenylosuccinate synthetase  46.21 
 
 
424 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>