More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2319 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2319  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 
337 aa  694    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0005  adenylosuccinate synthetase  75.82 
 
 
346 aa  545  1e-154  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2232  adenylosuccinate synthetase  75.3 
 
 
350 aa  537  1e-151  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.463237  normal  0.0169384 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0004  adenylosuccinate synthetase  73.21 
 
 
337 aa  529  1e-149  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0064  adenylosuccinate synthetase  66.87 
 
 
336 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000115242  hitchhiker  0.000142172 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0743  adenylosuccinate synthetase  58.04 
 
 
338 aa  409  1e-113  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00140834  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1241  adenylosuccinate synthetase  56.85 
 
 
337 aa  402  1e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0114647  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0146  adenylosuccinate synthetase  55.95 
 
 
337 aa  398  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00393443  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0677  adenylosuccinate synthetase  56.85 
 
 
338 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.41311 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0033  adenylosuccinate synthetase  54.76 
 
 
336 aa  389  1e-107  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1420  adenylosuccinate synthetase  54.65 
 
 
333 aa  379  1e-104  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1964  adenylosuccinate synthetase  46.25 
 
 
337 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0019  adenylosuccinate synthetase  42.73 
 
 
336 aa  284  2.0000000000000002e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.617132  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0128  adenylosuccinate synthetase  42.64 
 
 
334 aa  272  5.000000000000001e-72  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0162  adenylosuccinate synthetase  42.6 
 
 
334 aa  268  8e-71  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0146  adenylosuccinate synthetase  42.3 
 
 
332 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.531372  normal  0.191753 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1220  Adenylosuccinate synthase  38.67 
 
 
335 aa  260  2e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200996  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0015  adenylosuccinate synthetase  41.09 
 
 
337 aa  258  1e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000196036  normal  0.0126394 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1196  adenylosuccinate synthetase  41.39 
 
 
334 aa  256  3e-67  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1359  adenylosuccinate synthase  40.18 
 
 
338 aa  226  3e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  32.94 
 
 
427 aa  188  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  31.15 
 
 
451 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  30.21 
 
 
427 aa  186  5e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1939  adenylosuccinate synthetase  30.16 
 
 
428 aa  186  6e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  34.63 
 
 
427 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  30.11 
 
 
432 aa  182  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  33.83 
 
 
447 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0444  adenylosuccinate synthase  32.01 
 
 
430 aa  180  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.774885  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  33.83 
 
 
447 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  30.11 
 
 
432 aa  180  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  29.51 
 
 
427 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  29.93 
 
 
427 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  30.89 
 
 
431 aa  179  7e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  35.63 
 
 
428 aa  179  8e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  30.89 
 
 
433 aa  178  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3138  adenylosuccinate synthetase  30.59 
 
 
430 aa  178  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32892  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  30.11 
 
 
430 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  30.72 
 
 
430 aa  177  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0119  adenylosuccinate synthetase  31.18 
 
 
423 aa  177  3e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3868  adenylosuccinate synthetase  30.48 
 
 
442 aa  176  6e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.838486  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  33.73 
 
 
449 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0498  Adenylosuccinate synthase  36.72 
 
 
550 aa  175  9e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000018536  hitchhiker  0.00191314 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  34.32 
 
 
444 aa  175  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  31.63 
 
 
427 aa  175  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3282  adenylosuccinate synthetase  35.5 
 
 
437 aa  174  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00809393  normal  0.019729 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1985  adenylosuccinate synthetase  30.65 
 
 
444 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.151418 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1841  Adenylosuccinate synthase  35.59 
 
 
430 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.842522  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0403  adenylosuccinate synthetase  31.43 
 
 
424 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.841501 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  33.82 
 
 
447 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0115  adenylosuccinate synthase  34.63 
 
 
433 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1068  adenylosuccinate synthetase  31.62 
 
 
428 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4214  adenylosuccinate synthase  30.61 
 
 
430 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.855707  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3544  adenylosuccinate synthetase  31.34 
 
 
432 aa  173  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2857  adenylosuccinate synthetase  29.26 
 
 
445 aa  173  3.9999999999999995e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  29.58 
 
 
427 aa  173  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  28.6 
 
 
428 aa  172  5e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2149  adenylosuccinate synthetase  30.12 
 
 
425 aa  172  5.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.755328  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  32.05 
 
 
427 aa  172  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3346  adenylosuccinate synthetase  31.88 
 
 
432 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.474516  hitchhiker  0.00582802 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  33.33 
 
 
444 aa  171  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0390  adenylosuccinate synthetase  28.84 
 
 
429 aa  171  1e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000168216  decreased coverage  0.00000000000000193534 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05701  adenylosuccinate synthetase  32.54 
 
 
436 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  29.18 
 
 
430 aa  171  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  32.84 
 
 
430 aa  171  2e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11510  Adenylosuccinate synthetase  31.15 
 
 
434 aa  170  3e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  28.14 
 
 
428 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  28.81 
 
 
427 aa  170  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4635  adenylosuccinate synthetase  29.27 
 
 
427 aa  170  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.595604  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2616  adenylosuccinate synthetase  30.8 
 
 
432 aa  170  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199466  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1304  adenylosuccinate synthetase  38.07 
 
 
421 aa  170  3e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10362  adenylosuccinate synthetase  30.35 
 
 
432 aa  169  4e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698825  normal  0.94506 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4119  adenylosuccinate synthetase  33.73 
 
 
428 aa  169  6e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0180773  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0017  adenylosuccinate synthetase  33.13 
 
 
427 aa  169  8e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000177457  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0017  adenylosuccinate synthetase  33.13 
 
 
427 aa  169  8e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05071  adenylosuccinate synthetase  32.94 
 
 
437 aa  169  9e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.22054  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1049  adenylosuccinate synthetase  29.76 
 
 
435 aa  169  9e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  28.87 
 
 
431 aa  168  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  29.77 
 
 
428 aa  168  1e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2585  adenylosuccinate synthase  30.21 
 
 
431 aa  167  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0367  adenylosuccinate synthetase  29.65 
 
 
428 aa  168  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3089  adenylosuccinate synthetase  30.65 
 
 
432 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126084  normal  0.070043 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0507  adenylosuccinate synthetase  33.04 
 
 
436 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2289  adenylosuccinate synthetase  29.51 
 
 
426 aa  167  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3635  adenylosuccinate synthetase  33.23 
 
 
429 aa  167  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.336244 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2416  adenylosuccinate synthetase  32.84 
 
 
428 aa  167  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2533  adenylosuccinate synthase  34.12 
 
 
426 aa  167  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000265596  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00585  adenylosuccinate synthetase  29.21 
 
 
432 aa  167  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05331  adenylosuccinate synthetase  32.84 
 
 
436 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2125  Adenylosuccinate synthase  31.13 
 
 
423 aa  167  2e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.9394  normal  0.847855 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2536  adenylosuccinate synthetase  33.43 
 
 
427 aa  167  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05631  adenylosuccinate synthetase  32.54 
 
 
436 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5341  adenylosuccinate synthetase  27.84 
 
 
429 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000698384  hitchhiker  0.0000000000916292 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3291  adenylosuccinate synthetase  29.69 
 
 
431 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000376094  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3266  adenylosuccinate synthetase  29.45 
 
 
431 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000110825  hitchhiker  0.0000153755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0681  adenylosuccinate synthetase  29.45 
 
 
431 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00011524  hitchhiker  0.00031126 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0550  adenylosuccinate synthetase  30.37 
 
 
431 aa  166  4e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3019  adenylosuccinate synthetase  29.04 
 
 
424 aa  166  4e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0941  adenylosuccinate synthetase  29.52 
 
 
435 aa  166  4e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5594  adenylosuccinate synthetase  27.84 
 
 
429 aa  166  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000767866  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0695  adenylosuccinate synthetase  29.45 
 
 
431 aa  166  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000192259  hitchhiker  0.0000489804 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>