More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0610 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0610  Adenylosuccinate synthase  100 
 
 		 507 aa  1030    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0278665  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0498  Adenylosuccinate synthase  55.11 
 
 		 550 aa  520  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000018536  hitchhiker  0.00191314 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2004  adenylosuccinate synthase  47.6 
 
 		 561 aa  449  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00819563  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1964  adenylosuccinate synthetase  35.41 
 
 		 337 aa  192  9e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1359  adenylosuccinate synthase  37.16 
 
 		 338 aa  190  5e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0015  adenylosuccinate synthetase  36.72 
 
 		 337 aa  186  9e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000196036  normal  0.0126394 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0033  adenylosuccinate synthetase  34.08 
 
 		 336 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1420  adenylosuccinate synthetase  34.75 
 
 		 333 aa  177  3e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0128  adenylosuccinate synthetase  35.47 
 
 		 334 aa  176  8e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0019  adenylosuccinate synthetase  34.92 
 
 		 336 aa  176  8e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.617132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0146  adenylosuccinate synthetase  34.9 
 
 		 332 aa  169  9e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.531372  normal  0.191753 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0005  adenylosuccinate synthetase  34.56 
 
 		 346 aa  169  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1220  Adenylosuccinate synthase  34.83 
 
 		 335 aa  168  2e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200996  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1196  adenylosuccinate synthetase  34.08 
 
 		 334 aa  168  2e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0162  adenylosuccinate synthetase  33.43 
 
 		 334 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0677  adenylosuccinate synthetase  32.02 
 
 		 338 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.41311 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1241  adenylosuccinate synthetase  31.46 
 
 		 337 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0114647  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0743  adenylosuccinate synthetase  32.02 
 
 		 338 aa  163  7e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00140834  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2232  adenylosuccinate synthetase  33.07 
 
 		 350 aa  160  4e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.463237  normal  0.0169384 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0146  adenylosuccinate synthetase  31.74 
 
 		 337 aa  160  5e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00393443  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0064  adenylosuccinate synthetase  30.17 
 
 		 336 aa  159  1e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000115242  hitchhiker  0.000142172 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0004  adenylosuccinate synthetase  31.82 
 
 		 337 aa  154  4e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2319  adenylosuccinate synthetase  31.83 
 
 		 337 aa  154  5e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  31.75 
 
 		 427 aa  133  9e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1939  adenylosuccinate synthetase  32.38 
 
 		 428 aa  130  6e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  30.59 
 
 		 427 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  33.24 
 
 		 427 aa  130  8.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2262  adenylosuccinate synthetase  28.87 
 
 		 429 aa  129  9.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0914846 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0119  adenylosuccinate synthetase  31.62 
 
 		 423 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  33.24 
 
 		 427 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0176  adenylosuccinate synthetase  32.76 
 
 		 427 aa  125  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2390  adenylosuccinate synthetase  28.14 
 
 		 434 aa  125  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0213  adenylosuccinate synthetase  31.92 
 
 		 434 aa  124  3e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.816026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0139  adenylosuccinate synthetase  30.95 
 
 		 429 aa  124  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000561019 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0322  adenylosuccinate synthetase  31.74 
 
 		 434 aa  124  5e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1816  adenylosuccinate synthetase  27.42 
 
 		 434 aa  124  5e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_19549  predicted protein  30.52 
 
 		 428 aa  124  6e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.277088 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2125  Adenylosuccinate synthase  31.98 
 
 		 423 aa  123  9e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.9394  normal  0.847855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  30.61 
 
 		 427 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  30.37 
 
 		 427 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  31.52 
 
 		 451 aa  121  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  31.61 
 
 		 427 aa  121  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0133  adenylosuccinate synthase  30.42 
 
 		 807 aa  121  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0046  adenylosuccinate synthetase  29.51 
 
 		 426 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.268676  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2196  adenylosuccinate synthetase  29.94 
 
 		 434 aa  120  7.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0075  adenylosuccinate synthetase  26.45 
 
 		 419 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2126  adenylosuccinate synthetase  31.61 
 
 		 428 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  30.48 
 
 		 433 aa  118  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2031  adenylosuccinate synthetase  30.75 
 
 		 435 aa  118  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  30.61 
 
 		 427 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27840  Adenylosuccinate synthetase  29.55 
 
 		 438 aa  115  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0464  adenylosuccinate synthetase  31.14 
 
 		 423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0403  adenylosuccinate synthetase  27.93 
 
 		 424 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.841501 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  31.32 
 
 		 427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0035  adenylosuccinate synthetase  26.64 
 
 		 438 aa  116  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0025  adenylosuccinate synthetase  25.12 
 
 		 426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.993316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  28.94 
 
 		 427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2144  adenylosuccinate synthase  28.17 
 
 		 430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0658  adenylosuccinate synthetase  27.74 
 
 		 428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.163412  normal  0.505489 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1007  Adenylosuccinate synthase  29.74 
 
 		 431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0196756 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5009  adenylosuccinate synthetase  29.7 
 
 		 458 aa  115  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1370  adenylosuccinate synthetase  29.65 
 
 		 416 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26256  adenylosuccinate synthetase  28.61 
 
 		 526 aa  115  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2533  adenylosuccinate synthase  29.33 
 
 		 426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000265596  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35160  Adenylosuccinate synthetase  28.94 
 
 		 429 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  27.21 
 
 		 431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  31.25 
 
 		 428 aa  114  3e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3544  adenylosuccinate synthetase  27.34 
 
 		 432 aa  114  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1701  adenylosuccinate synthetase  29.35 
 
 		 431 aa  115  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.401877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07600  Adenylosuccinate synthetase  30.95 
 
 		 430 aa  114  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3635  adenylosuccinate synthetase  29.27 
 
 		 429 aa  114  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.336244 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  28.76 
 
 		 430 aa  114  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0262  adenylosuccinate synthase  28.17 
 
 		 431 aa  114  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4469  adenylosuccinate synthetase  32.19 
 
 		 429 aa  113  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2536  adenylosuccinate synthetase  29.11 
 
 		 427 aa  113  8.000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  29.55 
 
 		 430 aa  113  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3138  adenylosuccinate synthetase  29.46 
 
 		 430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32892  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  28.77 
 
 		 430 aa  113  1.0000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3159  adenylosuccinate synthetase  26.64 
 
 		 432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1850  adenylosuccinate synthetase  30.35 
 
 		 430 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2909  Adenylosuccinate synthetase  28.86 
 
 		 429 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4086  adenylosuccinate synthetase  31.12 
 
 		 430 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0852587 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2207  adenylosuccinate synthetase  30.17 
 
 		 430 aa  111  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  30.35 
 
 		 429 aa  111  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2616  adenylosuccinate synthetase  28.04 
 
 		 432 aa  111  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0962  Adenylosuccinate synthase  27.53 
 
 		 430 aa  111  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.470264  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1123  adenylosuccinate synthetase  29.08 
 
 		 457 aa  111  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0578  adenylosuccinate synthetase  29.19 
 
 		 432 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000001206 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1460  adenylosuccinate synthetase  28.7 
 
 		 427 aa  111  4.0000000000000004e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.57165  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0999  adenylosuccinate synthase  27.53 
 
 		 448 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.595096  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4635  adenylosuccinate synthetase  28.69 
 
 		 427 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.595604  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0524  adenylosuccinate synthetase  28.05 
 
 		 432 aa  110  5e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  30.29 
 
 		 427 aa  110  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  29.68 
 
 		 430 aa  110  5e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  28.98 
 
 		 433 aa  110  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0115  adenylosuccinate synthase  30.4 
 
 		 433 aa  110  6e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2963  adenylosuccinate synthetase  28.08 
 
 		 428 aa  110  6e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65230  adenylosuccinate synthetase  27.06 
 
 		 430 aa  110  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2289  adenylosuccinate synthetase  28.85 
 
 		 426 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3019  adenylosuccinate synthetase  29.55 
 
 		 424 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>