More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0658 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0658  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 428 aa  862    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.163412  normal  0.505489 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7581  adenylosuccinate synthetase  70.86 
 
 		 430 aa  621  1e-177  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6845  adenylosuccinate synthase  71.1 
 
 		 430 aa  618  1e-176  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5638  adenylosuccinate synthase  70.16 
 
 		 430 aa  617  1e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.171619  normal  0.25149 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1106  adenylosuccinate synthetase  69.32 
 
 		 429 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2010  adenylosuccinate synthetase  69.46 
 
 		 430 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.34638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1627  adenylosuccinate synthetase  68.22 
 
 		 533 aa  607  9.999999999999999e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1683  adenylosuccinate synthetase  68.22 
 
 		 429 aa  602  1.0000000000000001e-171  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.469628  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0366  adenylosuccinate synthetase  69.23 
 
 		 430 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0875  adenylosuccinate synthetase  69.7 
 
 		 430 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1231  adenylosuccinate synthetase  68.69 
 
 		 429 aa  600  1e-170  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2965  adenylosuccinate synthetase  68.07 
 
 		 430 aa  600  1e-170  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.125391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2742  adenylosuccinate synthetase  68.76 
 
 		 431 aa  597  1e-170  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0436902 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2683  adenylosuccinate synthetase  68.85 
 
 		 429 aa  598  1e-170  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0037  adenylosuccinate synthetase  69.3 
 
 		 448 aa  597  1e-169  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.505248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2144  adenylosuccinate synthase  68.07 
 
 		 430 aa  594  1e-169  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4086  adenylosuccinate synthetase  67.37 
 
 		 430 aa  596  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0852587 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3544  adenylosuccinate synthetase  69.14 
 
 		 432 aa  597  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2616  adenylosuccinate synthetase  69.14 
 
 		 432 aa  595  1e-169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0603  adenylosuccinate synthetase  67.52 
 
 		 430 aa  595  1e-169  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4774  adenylosuccinate synthetase  67.6 
 
 		 430 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1330  adenylosuccinate synthetase  66.9 
 
 		 430 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.396862  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3894  adenylosuccinate synthetase  67.13 
 
 		 430 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.108834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1123  adenylosuccinate synthetase  67.13 
 
 		 457 aa  593  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0558  adenylosuccinate synthetase  67.29 
 
 		 429 aa  591  1e-168  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00595695 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3346  adenylosuccinate synthetase  67.98 
 
 		 432 aa  590  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.474516  hitchhiker  0.00582802 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0510  adenylosuccinate synthetase  67.29 
 
 		 429 aa  588  1e-167  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.37093  normal  0.446838 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3089  adenylosuccinate synthetase  67.29 
 
 		 432 aa  587  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126084  normal  0.070043 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3179  adenylosuccinate synthetase  67.37 
 
 		 431 aa  584  1e-166  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1969  adenylosuccinate synthetase  66.9 
 
 		 437 aa  586  1e-166  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.769944  normal  0.0974254 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0999  adenylosuccinate synthase  68.53 
 
 		 448 aa  585  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.595096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0962  Adenylosuccinate synthase  68.53 
 
 		 430 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.470264  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1850  adenylosuccinate synthetase  66.2 
 
 		 430 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4682  adenylosuccinate synthetase  67.68 
 
 		 429 aa  581  1.0000000000000001e-165  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3159  adenylosuccinate synthetase  65.66 
 
 		 432 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0940  Adenylosuccinate synthase  68.3 
 
 		 430 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1007  Adenylosuccinate synthase  67.21 
 
 		 431 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0196756 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0285  adenylosuccinate synthetase  64.87 
 
 		 429 aa  567  1e-160  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0262  adenylosuccinate synthase  66.28 
 
 		 431 aa  567  1e-160  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2784  adenylosuccinate synthetase  66.74 
 
 		 429 aa  561  1.0000000000000001e-159  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.436445  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0475  adenylosuccinate synthetase  63.08 
 
 		 429 aa  528  1e-149  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.636476  hitchhiker  0.00197029 
 
 
-
 
NC_002978  WD0337  adenylosuccinate synthetase  53.52 
 
 		 425 aa  486  1e-136  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.112659  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0564  adenylosuccinate synthetase  50.47 
 
 		 431 aa  485  1e-136  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0461  adenylosuccinate synthetase  51.4 
 
 		 430 aa  486  1e-136  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5326  adenylosuccinate synthase  57.28 
 
 		 432 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0668634 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5832  adenylosuccinate synthase  55.63 
 
 		 432 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6675  adenylosuccinate synthase  55.63 
 
 		 432 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6526  adenylosuccinate synthetase  56.1 
 
 		 432 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.768523 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6199  adenylosuccinate synthase  55.63 
 
 		 453 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0247215 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2974  adenylosuccinate synthetase  54.04 
 
 		 435 aa  449  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5753  adenylosuccinate synthase  54.33 
 
 		 429 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.590489 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07600  Adenylosuccinate synthetase  53.4 
 
 		 430 aa  448  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5997  adenylosuccinate synthase  54.57 
 
 		 429 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140056  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2857  adenylosuccinate synthetase  53.67 
 
 		 445 aa  447  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1523  adenylosuccinate synthetase  52.67 
 
 		 442 aa  442  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000140547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2198  adenylosuccinate synthetase  52.87 
 
 		 443 aa  438  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5667  adenylosuccinate synthetase  54.1 
 
 		 430 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1985  adenylosuccinate synthetase  52.75 
 
 		 444 aa  435  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.151418 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1181  adenylosuccinate synthetase  52.22 
 
 		 458 aa  436  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.4333 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1434  adenylosuccinate synthetase  52 
 
 		 459 aa  437  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104272  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1101  adenylosuccinate synthetase  51.78 
 
 		 458 aa  437  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.415884  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1939  adenylosuccinate synthetase  53.04 
 
 		 431 aa  437  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5009  adenylosuccinate synthetase  52.44 
 
 		 458 aa  436  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65230  adenylosuccinate synthetase  53.86 
 
 		 430 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2007  adenylosuccinate synthetase  54.08 
 
 		 431 aa  435  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00017376  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4937  adenylosuccinate synthetase  53.4 
 
 		 430 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0577  adenylosuccinate synthetase  53.4 
 
 		 430 aa  431  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0607  adenylosuccinate synthetase  53.15 
 
 		 432 aa  433  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.272974 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  53.18 
 
 		 430 aa  431  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3379  adenylosuccinate synthetase  54.17 
 
 		 436 aa  432  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2504  adenylosuccinate synthetase  53.26 
 
 		 431 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000458788 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0641  adenylosuccinate synthetase  53.61 
 
 		 431 aa  431  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143682 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1271  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 		 429 aa  434  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231459  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0441  adenylosuccinate synthetase  50.92 
 
 		 435 aa  430  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.83493  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2296  adenylosuccinate synthetase  52.44 
 
 		 458 aa  429  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16562  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1583  adenylosuccinate synthetase  53.21 
 
 		 440 aa  429  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.147694  unclonable  0.000000227018 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  51.98 
 
 		 432 aa  430  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4680  adenylosuccinate synthetase  53.16 
 
 		 430 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0694  adenylosuccinate synthetase  51.87 
 
 		 432 aa  428  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4889  adenylosuccinate synthetase  52.69 
 
 		 430 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0250802  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1978  adenylosuccinate synthetase  51.99 
 
 		 432 aa  426  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0330  adenylosuccinate synthetase  51.75 
 
 		 431 aa  426  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2772  adenylosuccinate synthetase  50.92 
 
 		 438 aa  425  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3648  adenylosuccinate synthetase  51.64 
 
 		 432 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0528  adenylosuccinate synthetase  52.91 
 
 		 429 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650318  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0660  adenylosuccinate synthetase  53.26 
 
 		 431 aa  426  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0540  adenylosuccinate synthetase  51.75 
 
 		 432 aa  425  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311763  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3793  adenylosuccinate synthetase  51.87 
 
 		 432 aa  428  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4765  adenylosuccinate synthetase  52.69 
 
 		 430 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4941  adenylosuccinate synthetase  52.69 
 
 		 430 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348011 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  50.7 
 
 		 430 aa  426  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0578  adenylosuccinate synthetase  53.15 
 
 		 432 aa  427  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000001206 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  50.93 
 
 		 432 aa  426  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3716  adenylosuccinate synthetase  52.1 
 
 		 432 aa  424  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316289  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2029  adenylosuccinate synthetase  50.47 
 
 		 429 aa  424  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00381049  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2764  adenylosuccinate synthase  51.64 
 
 		 431 aa  423  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  50.94 
 
 		 427 aa  424  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0436  adenylosuccinate synthetase  51.87 
 
 		 432 aa  422  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000472279 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3914  adenylosuccinate synthetase  51.87 
 
 		 432 aa  424  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.923104  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0497  adenylosuccinate synthetase  51.87 
 
 		 432 aa  424  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>