More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1241 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0146  adenylosuccinate synthetase  95.25 
 
 		 337 aa  660    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00393443  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1241  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 337 aa  684    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0114647  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0677  adenylosuccinate synthetase  97.02 
 
 		 338 aa  665    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.41311 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0743  adenylosuccinate synthetase  87.2 
 
 		 338 aa  617  1e-176  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00140834  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0033  adenylosuccinate synthetase  76.79 
 
 		 336 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0004  adenylosuccinate synthetase  57.57 
 
 		 337 aa  412  1e-114  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2319  adenylosuccinate synthetase  56.85 
 
 		 337 aa  402  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0005  adenylosuccinate synthetase  54.76 
 
 		 346 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2232  adenylosuccinate synthetase  57.14 
 
 		 350 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.463237  normal  0.0169384 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0064  adenylosuccinate synthetase  54.17 
 
 		 336 aa  383  1e-105  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000115242  hitchhiker  0.000142172 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1420  adenylosuccinate synthetase  55.79 
 
 		 333 aa  375  1e-103  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1964  adenylosuccinate synthetase  47.01 
 
 		 337 aa  319  5e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0128  adenylosuccinate synthetase  47.16 
 
 		 334 aa  302  6.000000000000001e-81  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0019  adenylosuccinate synthetase  46.43 
 
 		 336 aa  294  2e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.617132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0146  adenylosuccinate synthetase  46.25 
 
 		 332 aa  289  4e-77  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.531372  normal  0.191753 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0162  adenylosuccinate synthetase  45.95 
 
 		 334 aa  289  6e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1196  adenylosuccinate synthetase  45.35 
 
 		 334 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0015  adenylosuccinate synthetase  45.65 
 
 		 337 aa  283  2.0000000000000002e-75  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000196036  normal  0.0126394 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1220  Adenylosuccinate synthase  42.64 
 
 		 335 aa  277  2e-73  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200996  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1359  adenylosuccinate synthase  40.59 
 
 		 338 aa  223  4.9999999999999996e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0215  adenylosuccinate synthetase  33.25 
 
 		 432 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00585  adenylosuccinate synthetase  33.25 
 
 		 432 aa  218  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  32.63 
 
 		 451 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0403  adenylosuccinate synthetase  33.89 
 
 		 424 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.841501 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1939  adenylosuccinate synthetase  31.62 
 
 		 428 aa  212  7e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2221  adenylosuccinate synthetase  33.33 
 
 		 423 aa  211  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44855  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0330  adenylosuccinate synthetase  34.44 
 
 		 431 aa  211  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0119  adenylosuccinate synthetase  33.81 
 
 		 423 aa  211  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1810  adenylosuccinate synthetase  33.25 
 
 		 429 aa  210  3e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.2738  normal  0.518624 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1978  adenylosuccinate synthetase  32.78 
 
 		 432 aa  208  8e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0677  adenylosuccinate synthetase  33.25 
 
 		 429 aa  208  1e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  33.88 
 
 		 424 aa  208  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3179  adenylosuccinate synthetase  33.02 
 
 		 431 aa  207  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  36.8 
 
 		 449 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1049  adenylosuccinate synthetase  32.62 
 
 		 435 aa  207  2e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0645  adenylosuccinate synthetase  33.97 
 
 		 429 aa  207  2e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2742  adenylosuccinate synthetase  32.94 
 
 		 431 aa  205  8e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0436902 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  33.73 
 
 		 428 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0941  adenylosuccinate synthetase  32.38 
 
 		 435 aa  204  2e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0368  adenylosuccinate synthetase  33.17 
 
 		 416 aa  204  2e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.361154  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3234  adenylosuccinate synthase  32.55 
 
 		 437 aa  204  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000199193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0115  adenylosuccinate synthase  31.79 
 
 		 433 aa  203  3e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  36.2 
 
 		 447 aa  203  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  32.71 
 
 		 430 aa  203  3e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2010  adenylosuccinate synthetase  33.1 
 
 		 430 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.34638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0497  adenylosuccinate synthetase  32.55 
 
 		 432 aa  203  4e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0046  adenylosuccinate synthetase  33.9 
 
 		 426 aa  203  4e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.268676  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  31.21 
 
 		 427 aa  202  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0366  adenylosuccinate synthetase  32.86 
 
 		 430 aa  202  6e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1370  adenylosuccinate synthetase  31.33 
 
 		 416 aa  202  8e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  36.2 
 
 		 447 aa  202  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  36.2 
 
 		 447 aa  202  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  31.15 
 
 		 427 aa  202  9e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2641  adenylosuccinate synthetase  31.31 
 
 		 428 aa  202  9e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3291  adenylosuccinate synthetase  32.07 
 
 		 431 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000376094  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  31.54 
 
 		 431 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  34.72 
 
 		 444 aa  201  1.9999999999999998e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3069  adenylosuccinate synthetase  31.35 
 
 		 431 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00455582  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2131  adenylosuccinate synthetase  32.93 
 
 		 416 aa  200  3e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2958  adenylosuccinate synthetase  31.07 
 
 		 428 aa  200  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0540  adenylosuccinate synthetase  32.08 
 
 		 432 aa  200  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311763  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4219  adenylosuccinate synthetase  31.59 
 
 		 431 aa  200  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000317238  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0025  adenylosuccinate synthetase  33.02 
 
 		 426 aa  200  3e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.993316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  32.08 
 
 		 433 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4763  adenylosuccinate synthetase  32.08 
 
 		 432 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.707154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4634  adenylosuccinate synthetase  32.08 
 
 		 432 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  33.1 
 
 		 427 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4644  adenylosuccinate synthetase  32.08 
 
 		 432 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4784  adenylosuccinate synthetase  32.08 
 
 		 432 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0550  adenylosuccinate synthetase  33.02 
 
 		 431 aa  199  5e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0607  adenylosuccinate synthetase  31.76 
 
 		 432 aa  199  5e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.272974 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4727  adenylosuccinate synthetase  32.08 
 
 		 432 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0875  adenylosuccinate synthetase  32.86 
 
 		 430 aa  199  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  30.75 
 
 		 428 aa  199  5e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2764  adenylosuccinate synthase  31.29 
 
 		 431 aa  199  5e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1985  adenylosuccinate synthetase  31.32 
 
 		 444 aa  199  6e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.151418 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  30.99 
 
 		 428 aa  199  6e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0578  adenylosuccinate synthetase  30.24 
 
 		 432 aa  199  6e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000001206 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0526  adenylosuccinate synthetase  33.02 
 
 		 431 aa  199  7e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  31.69 
 
 		 427 aa  199  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1282  adenylosuccinate synthetase  32.55 
 
 		 431 aa  199  7e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1969  adenylosuccinate synthetase  32.33 
 
 		 437 aa  199  7e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.769944  normal  0.0974254 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2207  adenylosuccinate synthetase  32.62 
 
 		 430 aa  199  7e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2533  adenylosuccinate synthase  32.94 
 
 		 426 aa  199  7.999999999999999e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000265596  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0390  adenylosuccinate synthetase  31.38 
 
 		 429 aa  199  7.999999999999999e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000168216  decreased coverage  0.00000000000000193534 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04044  adenylosuccinate synthetase  31.84 
 
 		 432 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3816  Adenylosuccinate synthase  31.84 
 
 		 432 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3914  adenylosuccinate synthetase  32.08 
 
 		 432 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.923104  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4708  adenylosuccinate synthetase  31.84 
 
 		 432 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3836  adenylosuccinate synthetase  31.84 
 
 		 432 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.930032  hitchhiker  0.00000195768 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4648  adenylosuccinate synthetase  31.84 
 
 		 432 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.378806 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0528  adenylosuccinate synthetase  32.23 
 
 		 429 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650318  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  31.59 
 
 		 432 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2289  adenylosuccinate synthetase  31.46 
 
 		 426 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  35.61 
 
 		 444 aa  198  1.0000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4736  adenylosuccinate synthetase  31.84 
 
 		 432 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4420  adenylosuccinate synthetase  31.84 
 
 		 432 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04006  hypothetical protein  31.84 
 
 		 432 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0660  adenylosuccinate synthetase  32.71 
 
 		 431 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0133  adenylosuccinate synthase  35.82 
 
 		 807 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279104  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>