More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1359 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1359  adenylosuccinate synthase  100 
 
 
338 aa  689    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0015  adenylosuccinate synthetase  43.92 
 
 
337 aa  262  6.999999999999999e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000196036  normal  0.0126394 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1220  Adenylosuccinate synthase  42.43 
 
 
335 aa  249  5e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200996  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0146  adenylosuccinate synthetase  41.84 
 
 
332 aa  243  5e-63  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.531372  normal  0.191753 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1196  adenylosuccinate synthetase  41.27 
 
 
334 aa  242  7.999999999999999e-63  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0128  adenylosuccinate synthetase  41.77 
 
 
334 aa  241  1e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0162  adenylosuccinate synthetase  40.36 
 
 
334 aa  239  5e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1420  adenylosuccinate synthetase  43.95 
 
 
333 aa  236  3e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0019  adenylosuccinate synthetase  40.36 
 
 
336 aa  235  7e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.617132  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2319  adenylosuccinate synthetase  40.18 
 
 
337 aa  226  3e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0146  adenylosuccinate synthetase  41.18 
 
 
337 aa  226  3e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00393443  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2232  adenylosuccinate synthetase  40.3 
 
 
350 aa  225  9e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.463237  normal  0.0169384 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0677  adenylosuccinate synthetase  41.11 
 
 
338 aa  224  2e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.41311 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0005  adenylosuccinate synthetase  41.54 
 
 
346 aa  223  4e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0033  adenylosuccinate synthetase  40.24 
 
 
336 aa  223  4e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1241  adenylosuccinate synthetase  40.59 
 
 
337 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0114647  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0743  adenylosuccinate synthetase  40 
 
 
338 aa  220  3e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00140834  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1964  adenylosuccinate synthetase  37.98 
 
 
337 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0004  adenylosuccinate synthetase  39.4 
 
 
337 aa  216  7e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0064  adenylosuccinate synthetase  39.03 
 
 
336 aa  206  7e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000115242  hitchhiker  0.000142172 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2004  adenylosuccinate synthase  37.98 
 
 
561 aa  203  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00819563  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0610  Adenylosuccinate synthase  37.16 
 
 
507 aa  190  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0278665  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0498  Adenylosuccinate synthase  38.1 
 
 
550 aa  180  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000018536  hitchhiker  0.00191314 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3069  adenylosuccinate synthetase  34.31 
 
 
431 aa  152  7e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00455582  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0330  adenylosuccinate synthetase  32.77 
 
 
431 aa  150  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0750  adenylosuccinate synthetase  33.53 
 
 
431 aa  150  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000682785  hitchhiker  0.00737735 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3291  adenylosuccinate synthetase  32.84 
 
 
431 aa  150  4e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000376094  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  32.55 
 
 
430 aa  150  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3592  adenylosuccinate synthetase  33.24 
 
 
431 aa  150  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000897035  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08920  adenylosuccinate synthetase  33.14 
 
 
432 aa  149  5e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4219  adenylosuccinate synthetase  33.24 
 
 
431 aa  149  7e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000317238  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1328  adenylosuccinate synthetase  33.14 
 
 
432 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0694  adenylosuccinate synthetase  33.24 
 
 
432 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4763  adenylosuccinate synthetase  32.26 
 
 
432 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.707154  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4634  adenylosuccinate synthetase  32.26 
 
 
432 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3648  adenylosuccinate synthetase  33.24 
 
 
432 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3793  adenylosuccinate synthetase  33.24 
 
 
432 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04044  adenylosuccinate synthetase  32.26 
 
 
432 aa  147  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3816  Adenylosuccinate synthase  32.26 
 
 
432 aa  147  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5693  adenylosuccinate synthetase  32.26 
 
 
432 aa  147  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.580203  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4727  adenylosuccinate synthetase  32.26 
 
 
432 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4648  adenylosuccinate synthetase  32.26 
 
 
432 aa  147  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.378806 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04006  hypothetical protein  32.26 
 
 
432 aa  147  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4736  adenylosuccinate synthetase  32.26 
 
 
432 aa  147  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4708  adenylosuccinate synthetase  32.26 
 
 
432 aa  147  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4784  adenylosuccinate synthetase  32.26 
 
 
432 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3836  adenylosuccinate synthetase  32.26 
 
 
432 aa  147  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.930032  hitchhiker  0.00000195768 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4420  adenylosuccinate synthetase  32.26 
 
 
432 aa  147  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4644  adenylosuccinate synthetase  32.26 
 
 
432 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0747  adenylosuccinate synthetase  32.84 
 
 
431 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000703533  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3357  adenylosuccinate synthetase  32.84 
 
 
431 aa  146  5e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0113184  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3914  adenylosuccinate synthetase  32.95 
 
 
432 aa  146  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.923104  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  32.08 
 
 
432 aa  146  5e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002264  adenylosuccinate synthetase  32.08 
 
 
438 aa  146  6e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.151372  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5638  adenylosuccinate synthetase  32.57 
 
 
424 aa  146  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0744769  normal  0.421988 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3649  adenylosuccinate synthetase  32.84 
 
 
431 aa  146  6e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000709559  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0735  adenylosuccinate synthetase  32.84 
 
 
431 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000671232  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0705  adenylosuccinate synthetase  32.26 
 
 
431 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00343177  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3937  adenylosuccinate synthetase  32.84 
 
 
431 aa  145  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3716  adenylosuccinate synthetase  32.95 
 
 
432 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316289  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0509  adenylosuccinate synthetase  32.26 
 
 
431 aa  145  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00567032  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0119  adenylosuccinate synthetase  32.48 
 
 
423 aa  145  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0540  adenylosuccinate synthetase  32.37 
 
 
432 aa  145  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311763  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00089  adenylosuccinate synthetase  31.91 
 
 
438 aa  145  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3266  adenylosuccinate synthetase  32.84 
 
 
431 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000110825  hitchhiker  0.0000153755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0681  adenylosuccinate synthetase  32.84 
 
 
431 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00011524  hitchhiker  0.00031126 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0695  adenylosuccinate synthetase  32.84 
 
 
431 aa  145  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000192259  hitchhiker  0.0000489804 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1939  adenylosuccinate synthetase  32.37 
 
 
431 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2772  adenylosuccinate synthetase  32.37 
 
 
438 aa  144  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0360  adenylosuccinate synthetase  31.38 
 
 
432 aa  144  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.655854  hitchhiker  0.00425653 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0726  adenylosuccinate synthetase  32.84 
 
 
431 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0654832  hitchhiker  0.0000471969 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0436  adenylosuccinate synthetase  32.66 
 
 
432 aa  144  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000472279 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0497  adenylosuccinate synthetase  31.79 
 
 
432 aa  142  6e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0658  adenylosuccinate synthetase  33.04 
 
 
428 aa  142  8e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.163412  normal  0.505489 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  29.57 
 
 
430 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2504  adenylosuccinate synthetase  32.75 
 
 
431 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000458788 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0578  adenylosuccinate synthetase  31.44 
 
 
432 aa  142  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000001206 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3234  adenylosuccinate synthase  33.53 
 
 
437 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000199193  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1810  adenylosuccinate synthetase  32.36 
 
 
429 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.2738  normal  0.518624 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2963  adenylosuccinate synthetase  30.5 
 
 
428 aa  140  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17225  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0075  adenylosuccinate synthetase  29.01 
 
 
419 aa  140  3e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2691  adenylosuccinate synthetase  32.75 
 
 
432 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321196  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0677  adenylosuccinate synthetase  33.53 
 
 
431 aa  140  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2598  adenylosuccinate synthetase  32.75 
 
 
432 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0051551  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1265  adenylosuccinate synthetase  32.75 
 
 
432 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0163864  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1282  adenylosuccinate synthetase  31.67 
 
 
431 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35160  Adenylosuccinate synthetase  32.25 
 
 
429 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3138  adenylosuccinate synthetase  29.64 
 
 
430 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32892  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1978  adenylosuccinate synthetase  31.85 
 
 
432 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0215  adenylosuccinate synthetase  32.55 
 
 
432 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2416  adenylosuccinate synthetase  29.88 
 
 
428 aa  139  6e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0660  adenylosuccinate synthetase  28.44 
 
 
431 aa  139  6e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2764  adenylosuccinate synthase  32.84 
 
 
431 aa  139  7.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5667  adenylosuccinate synthetase  32.46 
 
 
430 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65230  adenylosuccinate synthetase  32.46 
 
 
430 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0517  adenylosuccinate synthetase  33.53 
 
 
428 aa  139  8.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  30.97 
 
 
427 aa  138  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0228  adenylosuccinate synthetase  32.65 
 
 
431 aa  138  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.043517  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4777  adenylosuccinate synthetase  35.29 
 
 
429 aa  138  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.545109  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2149  adenylosuccinate synthetase  31.4 
 
 
425 aa  138  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.755328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>