More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0146 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0146  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 332 aa  664    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.531372  normal  0.191753 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1196  adenylosuccinate synthetase  87.61 
 
 		 334 aa  606  9.999999999999999e-173  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0162  adenylosuccinate synthetase  85.5 
 
 		 334 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0128  adenylosuccinate synthetase  85.5 
 
 		 334 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0019  adenylosuccinate synthetase  63.55 
 
 		 336 aa  439  9.999999999999999e-123  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.617132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0015  adenylosuccinate synthetase  54.63 
 
 		 337 aa  373  1e-102  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000196036  normal  0.0126394 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1220  Adenylosuccinate synthase  54.05 
 
 		 335 aa  366  1e-100  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200996  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1420  adenylosuccinate synthetase  52.12 
 
 		 333 aa  351  1e-95  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0033  adenylosuccinate synthetase  49.1 
 
 		 336 aa  318  7.999999999999999e-86  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1241  adenylosuccinate synthetase  46.25 
 
 		 337 aa  289  4e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0114647  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0743  adenylosuccinate synthetase  45.51 
 
 		 338 aa  288  9e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00140834  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0146  adenylosuccinate synthetase  45.65 
 
 		 337 aa  286  4e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00393443  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0677  adenylosuccinate synthetase  45.81 
 
 		 338 aa  285  5.999999999999999e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.41311 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0004  adenylosuccinate synthetase  43.81 
 
 		 337 aa  272  6e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0064  adenylosuccinate synthetase  42.3 
 
 		 336 aa  271  9e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000115242  hitchhiker  0.000142172 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2232  adenylosuccinate synthetase  43.81 
 
 		 350 aa  268  8.999999999999999e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.463237  normal  0.0169384 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2319  adenylosuccinate synthetase  42.3 
 
 		 337 aa  262  6.999999999999999e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1964  adenylosuccinate synthetase  43.98 
 
 		 337 aa  260  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0005  adenylosuccinate synthetase  42.9 
 
 		 346 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1359  adenylosuccinate synthase  41.84 
 
 		 338 aa  243  3.9999999999999997e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1985  adenylosuccinate synthetase  32.25 
 
 		 444 aa  181  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.151418 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2004  adenylosuccinate synthase  34.29 
 
 		 561 aa  180  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00819563  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0550  adenylosuccinate synthetase  30.9 
 
 		 431 aa  177  3e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0526  adenylosuccinate synthetase  30.9 
 
 		 431 aa  176  4e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2857  adenylosuccinate synthetase  30.39 
 
 		 445 aa  169  5e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0610  Adenylosuccinate synthase  34.9 
 
 		 507 aa  169  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0278665  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0498  Adenylosuccinate synthase  35.52 
 
 		 550 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000018536  hitchhiker  0.00191314 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3019  adenylosuccinate synthetase  29.88 
 
 		 424 aa  166  4e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1049  adenylosuccinate synthetase  29.79 
 
 		 435 aa  166  5e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0941  adenylosuccinate synthetase  30.02 
 
 		 435 aa  164  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0330  adenylosuccinate synthetase  30.34 
 
 		 428 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  30.52 
 
 		 430 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0641  adenylosuccinate synthetase  30.12 
 
 		 431 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143682 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  30.66 
 
 		 430 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02633  adenylosuccinate synthetase  30.68 
 
 		 430 aa  160  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0528  adenylosuccinate synthetase  30.5 
 
 		 429 aa  160  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650318  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2390  adenylosuccinate synthetase  29.71 
 
 		 434 aa  160  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  28.87 
 
 		 432 aa  159  7e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  34.13 
 
 		 427 aa  159  9e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  29.11 
 
 		 431 aa  158  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65230  adenylosuccinate synthetase  30.19 
 
 		 430 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  29.11 
 
 		 432 aa  158  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0215  adenylosuccinate synthetase  32.08 
 
 		 432 aa  158  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1282  adenylosuccinate synthetase  30.75 
 
 		 431 aa  157  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5667  adenylosuccinate synthetase  29.95 
 
 		 430 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1810  adenylosuccinate synthetase  30.24 
 
 		 429 aa  157  3e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.2738  normal  0.518624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0403  adenylosuccinate synthetase  31.34 
 
 		 424 aa  156  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.841501 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1939  adenylosuccinate synthetase  30.02 
 
 		 431 aa  156  4e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0578  adenylosuccinate synthetase  29.55 
 
 		 432 aa  157  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000001206 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4937  adenylosuccinate synthetase  29.74 
 
 		 430 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0577  adenylosuccinate synthetase  29.51 
 
 		 430 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  31.46 
 
 		 431 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1784  adenylosuccinate synthetase  29.86 
 
 		 430 aa  155  6e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  30.19 
 
 		 430 aa  156  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0119  adenylosuccinate synthetase  29.74 
 
 		 423 aa  155  7e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  29.81 
 
 		 433 aa  155  8e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0213  adenylosuccinate synthetase  29.88 
 
 		 434 aa  155  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.816026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00585  adenylosuccinate synthetase  31.13 
 
 		 432 aa  154  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2031  adenylosuccinate synthetase  28.57 
 
 		 435 aa  154  1e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2126  adenylosuccinate synthetase  30.73 
 
 		 428 aa  155  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2289  adenylosuccinate synthetase  30.66 
 
 		 426 aa  155  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4889  adenylosuccinate synthetase  29.72 
 
 		 430 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0250802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2196  adenylosuccinate synthetase  28.99 
 
 		 434 aa  154  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0677  adenylosuccinate synthetase  30.57 
 
 		 429 aa  154  2e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4941  adenylosuccinate synthetase  29.72 
 
 		 430 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348011 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0540  adenylosuccinate synthetase  30.5 
 
 		 432 aa  154  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311763  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1719  adenylosuccinate synthetase  29.62 
 
 		 430 aa  154  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0645  adenylosuccinate synthetase  31.75 
 
 		 429 aa  154  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4765  adenylosuccinate synthetase  29.72 
 
 		 430 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  29.48 
 
 		 430 aa  154  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2007  adenylosuccinate synthetase  31.15 
 
 		 431 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00017376  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2262  adenylosuccinate synthetase  29.57 
 
 		 429 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0914846 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4680  adenylosuccinate synthetase  29.72 
 
 		 430 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0330  adenylosuccinate synthetase  30.77 
 
 		 431 aa  153  5e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0322  adenylosuccinate synthetase  28.74 
 
 		 434 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0694  adenylosuccinate synthetase  30.97 
 
 		 432 aa  152  7e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3648  adenylosuccinate synthetase  30.97 
 
 		 432 aa  152  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3793  adenylosuccinate synthetase  30.97 
 
 		 432 aa  152  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0607  adenylosuccinate synthetase  30.71 
 
 		 432 aa  152  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.272974 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0735  adenylosuccinate synthetase  30.12 
 
 		 431 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000671232  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1328  adenylosuccinate synthetase  30.81 
 
 		 432 aa  151  1e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3357  adenylosuccinate synthetase  29.62 
 
 		 431 aa  152  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0113184  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5638  adenylosuccinate synthetase  30.48 
 
 		 424 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0744769  normal  0.421988 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  29.98 
 
 		 427 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0750  adenylosuccinate synthetase  29.62 
 
 		 431 aa  150  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000682785  hitchhiker  0.00737735 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0705  adenylosuccinate synthetase  29.88 
 
 		 431 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00343177  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07600  Adenylosuccinate synthetase  29.01 
 
 		 430 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2626  adenylosuccinate synthase  30.82 
 
 		 437 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000737689 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3649  adenylosuccinate synthetase  29.88 
 
 		 431 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000709559  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4219  adenylosuccinate synthetase  29.88 
 
 		 431 aa  150  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000317238  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3013  adenylosuccinate synthetase  30.81 
 
 		 430 aa  150  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.220071  normal  0.0269955 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1816  adenylosuccinate synthetase  28.99 
 
 		 434 aa  150  4e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1647  adenylosuccinate synthetase  35 
 
 		 397 aa  150  4e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1720  adenylosuccinate synthetase  35.29 
 
 		 397 aa  149  5e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2149  adenylosuccinate synthetase  29.08 
 
 		 425 aa  149  5e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.755328  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  34.53 
 
 		 430 aa  149  5e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4634  adenylosuccinate synthetase  30.42 
 
 		 432 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4763  adenylosuccinate synthetase  30.42 
 
 		 432 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.707154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4644  adenylosuccinate synthetase  31.38 
 
 		 432 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0966  Adenylosuccinate synthase  27.87 
 
 		 432 aa  149  7e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>