More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1720 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1647  adenylosuccinate synthetase  96.22 
 
 		 397 aa  786    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1720  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 397 aa  803    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1284  adenylosuccinate synthetase  54.52 
 
 		 402 aa  419  1e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0313  adenylosuccinate synthetase  48.65 
 
 		 399 aa  388  1e-107  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.241475  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1365  adenylosuccinate synthetase  47.77 
 
 		 420 aa  348  9e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2031  adenylosuccinate synthetase  45.82 
 
 		 435 aa  330  2e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  45.24 
 
 		 433 aa  328  8e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1816  adenylosuccinate synthetase  44.89 
 
 		 434 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2262  adenylosuccinate synthetase  45.22 
 
 		 429 aa  325  8.000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0914846 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0322  adenylosuccinate synthetase  44.26 
 
 		 434 aa  323  2e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  44.02 
 
 		 427 aa  324  2e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2390  adenylosuccinate synthetase  43.3 
 
 		 434 aa  323  4e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0397  Adenylosuccinate synthase  45.61 
 
 		 398 aa  323  5e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  42.99 
 
 		 424 aa  322  6e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  45.71 
 
 		 426 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2196  adenylosuccinate synthetase  44.26 
 
 		 434 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  43.3 
 
 		 427 aa  319  5e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  44.73 
 
 		 428 aa  318  1e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0213  adenylosuccinate synthetase  43.2 
 
 		 434 aa  316  6e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.816026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  43.33 
 
 		 427 aa  315  9e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1134  adenylosuccinate synthetase  42.2 
 
 		 414 aa  313  2.9999999999999996e-84  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2419  adenylosuccinate synthetase  41.94 
 
 		 424 aa  311  1e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000351382  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  43.1 
 
 		 427 aa  311  1e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0524  adenylosuccinate synthetase  43 
 
 		 432 aa  311  1e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  43.55 
 
 		 428 aa  310  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23100  Adenylosuccinate synthase  45.52 
 
 		 428 aa  310  4e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0330  adenylosuccinate synthetase  43.48 
 
 		 428 aa  309  6.999999999999999e-83  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  42.18 
 
 		 431 aa  308  9e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0115  adenylosuccinate synthase  42.39 
 
 		 433 aa  308  1.0000000000000001e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  41.84 
 
 		 430 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  44.04 
 
 		 428 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  42.89 
 
 		 444 aa  306  4.0000000000000004e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  42.89 
 
 		 447 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  42.89 
 
 		 447 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1958  adenylosuccinate synthetase  42.99 
 
 		 425 aa  305  9.000000000000001e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  42.76 
 
 		 432 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08766  adenylosuccinate synthetase  40.49 
 
 		 423 aa  305  1.0000000000000001e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0287341  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  42.99 
 
 		 432 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0046  adenylosuccinate synthetase  44.55 
 
 		 426 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.268676  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  43.33 
 
 		 427 aa  304  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  41.37 
 
 		 444 aa  303  4.0000000000000003e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4579  adenylosuccinate synthetase  41.63 
 
 		 431 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.730826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  42.34 
 
 		 429 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2532  adenylosuccinate synthetase  42.52 
 
 		 445 aa  302  7.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  42.55 
 
 		 431 aa  302  8.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2909  Adenylosuccinate synthetase  42.86 
 
 		 429 aa  301  9e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  42.69 
 
 		 427 aa  301  1e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  41.67 
 
 		 428 aa  301  2e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2126  adenylosuccinate synthetase  42.76 
 
 		 428 aa  301  2e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  42.08 
 
 		 447 aa  300  3e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  42.32 
 
 		 433 aa  300  4e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  43.17 
 
 		 430 aa  299  4e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  43.93 
 
 		 449 aa  299  7e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1202  adenylosuccinate synthetase  41.22 
 
 		 425 aa  298  8e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.609737  normal  0.550164 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0492  adenylosuccinate synthetase  43.44 
 
 		 428 aa  298  1e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  43.69 
 
 		 430 aa  298  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2533  adenylosuccinate synthase  43.27 
 
 		 426 aa  298  1e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000265596  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4635  adenylosuccinate synthetase  43.44 
 
 		 427 aa  297  2e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.595604  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1271  adenylosuccinate synthetase  42.04 
 
 		 429 aa  298  2e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231459  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05071  adenylosuccinate synthetase  42.18 
 
 		 437 aa  297  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.22054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1608  adenylosuccinate synthetase  41.04 
 
 		 428 aa  296  5e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.395219  normal  0.555835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  43.1 
 
 		 427 aa  296  5e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2221  adenylosuccinate synthetase  40.29 
 
 		 423 aa  295  7e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44855  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5638  adenylosuccinate synthetase  41.05 
 
 		 424 aa  295  8e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0744769  normal  0.421988 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0691  adenylosuccinate synthetase  41.23 
 
 		 439 aa  295  8e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2742  adenylosuccinate synthetase  41.78 
 
 		 431 aa  295  9e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0436902 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0603  adenylosuccinate synthetase  42.35 
 
 		 430 aa  295  9e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  42.18 
 
 		 430 aa  295  1e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2963  adenylosuccinate synthetase  41.87 
 
 		 428 aa  295  1e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0507  adenylosuccinate synthetase  40.85 
 
 		 436 aa  295  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1265  adenylosuccinate synthetase  43.62 
 
 		 432 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0163864  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1330  adenylosuccinate synthetase  41.51 
 
 		 430 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.396862  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2598  adenylosuccinate synthetase  43.62 
 
 		 432 aa  294  1e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0051551  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2958  adenylosuccinate synthetase  41.67 
 
 		 428 aa  295  1e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07421  adenylosuccinate synthetase  43.77 
 
 		 439 aa  295  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2149  adenylosuccinate synthetase  42.93 
 
 		 425 aa  294  2e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.755328  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2007  adenylosuccinate synthetase  41.67 
 
 		 431 aa  294  2e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00017376  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4119  adenylosuccinate synthetase  44.02 
 
 		 428 aa  294  2e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0180773  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2691  adenylosuccinate synthetase  43.62 
 
 		 432 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321196  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2641  adenylosuccinate synthetase  41.43 
 
 		 428 aa  293  3e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1282  adenylosuccinate synthetase  40.86 
 
 		 431 aa  293  4e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3179  adenylosuccinate synthetase  41.78 
 
 		 431 aa  293  5e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4086  adenylosuccinate synthetase  41.27 
 
 		 430 aa  293  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0852587 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0370  adenylosuccinate synthetase  40.53 
 
 		 416 aa  292  7e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0409344  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0248  adenylosuccinate synthetase  39.51 
 
 		 423 aa  292  8e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1839  adenylosuccinate synthetase  42.71 
 
 		 437 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05641  adenylosuccinate synthetase  42.71 
 
 		 437 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.622975 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3282  adenylosuccinate synthetase  40.52 
 
 		 437 aa  291  1e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00809393  normal  0.019729 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  41.43 
 
 		 427 aa  291  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1370  adenylosuccinate synthetase  40.62 
 
 		 416 aa  291  2e-77  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0368  adenylosuccinate synthetase  41.3 
 
 		 416 aa  290  2e-77  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.361154  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05631  adenylosuccinate synthetase  40.38 
 
 		 436 aa  291  2e-77  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1667  adenylosuccinate synthetase  41.23 
 
 		 439 aa  291  2e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2125  Adenylosuccinate synthase  40.66 
 
 		 423 aa  290  2e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.9394  normal  0.847855 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7050  adenylosuccinate synthetase  39.72 
 
 		 432 aa  291  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4774  adenylosuccinate synthetase  41.75 
 
 		 430 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0069  adenylosuccinate synthetase  39.38 
 
 		 432 aa  290  3e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215485  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3894  adenylosuccinate synthetase  41.04 
 
 		 430 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.108834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3635  adenylosuccinate synthetase  42.14 
 
 		 429 aa  290  4e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.336244 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05331  adenylosuccinate synthetase  40.38 
 
 		 436 aa  289  5.0000000000000004e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>