More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0397 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0397  Adenylosuccinate synthase  100 
 
 
398 aa  803    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3868  adenylosuccinate synthetase  45 
 
 
442 aa  358  9.999999999999999e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.838486  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  43.36 
 
 
430 aa  355  1e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  44.24 
 
 
430 aa  352  7e-96  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  44.92 
 
 
427 aa  350  2e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  45.35 
 
 
433 aa  347  2e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0046  adenylosuccinate synthetase  44.68 
 
 
426 aa  345  8.999999999999999e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.268676  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  42.24 
 
 
424 aa  340  2e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2598  adenylosuccinate synthetase  44.81 
 
 
432 aa  339  4e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0051551  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2909  Adenylosuccinate synthetase  43.33 
 
 
429 aa  340  4e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270112  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2691  adenylosuccinate synthetase  44.81 
 
 
432 aa  339  5e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321196  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  43.44 
 
 
427 aa  339  5.9999999999999996e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1265  adenylosuccinate synthetase  44.81 
 
 
432 aa  338  8e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0163864  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  43.91 
 
 
427 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  41.81 
 
 
428 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  42.52 
 
 
429 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2207  adenylosuccinate synthetase  41.84 
 
 
430 aa  335  7.999999999999999e-91  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1816  adenylosuccinate synthetase  43.33 
 
 
434 aa  333  2e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  43.36 
 
 
426 aa  334  2e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  42.79 
 
 
427 aa  333  2e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  41.57 
 
 
428 aa  333  2e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2125  Adenylosuccinate synthase  43.43 
 
 
423 aa  333  3e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.9394  normal  0.847855 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2533  adenylosuccinate synthase  43.41 
 
 
426 aa  332  9e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000265596  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27840  Adenylosuccinate synthetase  41.3 
 
 
438 aa  332  9e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0322  adenylosuccinate synthetase  42.79 
 
 
434 aa  331  1e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0213  adenylosuccinate synthetase  44.5 
 
 
434 aa  331  1e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.816026  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  42.59 
 
 
428 aa  330  2e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2390  adenylosuccinate synthetase  43.26 
 
 
434 aa  331  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2196  adenylosuccinate synthetase  43.6 
 
 
434 aa  330  3e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3138  adenylosuccinate synthetase  40.71 
 
 
430 aa  330  3e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32892  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2416  adenylosuccinate synthetase  42.55 
 
 
428 aa  330  3e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0115  adenylosuccinate synthase  40.47 
 
 
433 aa  330  4e-89  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2262  adenylosuccinate synthetase  44.21 
 
 
429 aa  328  7e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0914846 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4344  adenylosuccinate synthetase  41.31 
 
 
432 aa  328  7e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  42.08 
 
 
427 aa  328  9e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2536  adenylosuccinate synthetase  39.57 
 
 
427 aa  328  1.0000000000000001e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35160  Adenylosuccinate synthetase  42.52 
 
 
429 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  43.1 
 
 
430 aa  328  1.0000000000000001e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2504  adenylosuccinate synthetase  42.69 
 
 
431 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000458788 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  42.35 
 
 
449 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1927  adenylosuccinate synthetase  41.87 
 
 
415 aa  327  3e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0017  adenylosuccinate synthetase  40.38 
 
 
427 aa  327  3e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000177457  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0017  adenylosuccinate synthetase  40.38 
 
 
427 aa  327  3e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0330  adenylosuccinate synthetase  42.04 
 
 
428 aa  326  4.0000000000000003e-88  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0326  adenylosuccinate synthetase  44.25 
 
 
400 aa  325  8.000000000000001e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0990  adenylosuccinate synthetase  42.65 
 
 
429 aa  325  8.000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  42.59 
 
 
447 aa  325  1e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2126  adenylosuccinate synthetase  40.81 
 
 
428 aa  325  1e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  42.35 
 
 
447 aa  323  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0205  adenylosuccinate synthetase  43.77 
 
 
404 aa  324  2e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  41.37 
 
 
427 aa  324  2e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  42.35 
 
 
447 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3635  adenylosuccinate synthetase  41.39 
 
 
429 aa  323  3e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.336244 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1647  adenylosuccinate synthetase  45.75 
 
 
397 aa  323  3e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1284  adenylosuccinate synthetase  45.27 
 
 
402 aa  323  3e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  41.84 
 
 
430 aa  323  4e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0248  adenylosuccinate synthetase  41.31 
 
 
423 aa  323  4e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1720  adenylosuccinate synthetase  45.61 
 
 
397 aa  323  5e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  42.04 
 
 
427 aa  322  6e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0524  adenylosuccinate synthetase  42.28 
 
 
432 aa  322  7e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  41.65 
 
 
444 aa  322  7e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5320  adenylosuccinate synthetase  40.86 
 
 
429 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000159422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5148  adenylosuccinate synthetase  40.86 
 
 
429 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.87247e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5716  adenylosuccinate synthetase  40.86 
 
 
429 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000188586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5577  adenylosuccinate synthetase  40.86 
 
 
429 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.85689e-26 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05071  adenylosuccinate synthetase  42.79 
 
 
437 aa  321  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.22054  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  39.81 
 
 
428 aa  321  9.999999999999999e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_19549  predicted protein  42.96 
 
 
428 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.277088 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5164  adenylosuccinate synthetase  41.09 
 
 
429 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000038286  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  42.49 
 
 
432 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0172  adenylosuccinate synthetase  45.25 
 
 
400 aa  320  1.9999999999999998e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.722452 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0025  adenylosuccinate synthetase  40.77 
 
 
426 aa  321  1.9999999999999998e-86  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.993316  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  42.32 
 
 
427 aa  320  3.9999999999999996e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2963  adenylosuccinate synthetase  39.76 
 
 
428 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17225  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5915  adenylosuccinate synthetase  41.84 
 
 
439 aa  319  3.9999999999999996e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  42.65 
 
 
430 aa  319  5e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23100  Adenylosuccinate synthase  44.94 
 
 
428 aa  319  5e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  41.84 
 
 
433 aa  319  7e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02633  adenylosuccinate synthetase  41.08 
 
 
430 aa  318  7e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2031  adenylosuccinate synthetase  42.58 
 
 
435 aa  319  7e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3218  Adenylosuccinate synthase  36.92 
 
 
461 aa  319  7e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159483  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0517  adenylosuccinate synthetase  42.52 
 
 
428 aa  318  7.999999999999999e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  42.18 
 
 
427 aa  318  7.999999999999999e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5260  adenylosuccinate synthetase  40.14 
 
 
429 aa  318  1e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000740199  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  42.25 
 
 
432 aa  318  1e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2419  adenylosuccinate synthetase  41.11 
 
 
424 aa  317  2e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000351382  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5617  adenylosuccinate synthetase  41.33 
 
 
429 aa  317  2e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000421439  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11510  Adenylosuccinate synthetase  40.85 
 
 
434 aa  317  2e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3282  adenylosuccinate synthetase  40.76 
 
 
437 aa  317  2e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00809393  normal  0.019729 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  42.42 
 
 
427 aa  317  3e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5655  adenylosuccinate synthetase  41.33 
 
 
429 aa  317  3e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000753015  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10362  adenylosuccinate synthetase  43.1 
 
 
432 aa  317  3e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698825  normal  0.94506 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2289  adenylosuccinate synthetase  41.92 
 
 
426 aa  316  4e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5594  adenylosuccinate synthetase  40.62 
 
 
429 aa  316  5e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000767866  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0464  adenylosuccinate synthetase  40.62 
 
 
423 aa  315  9.999999999999999e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  41.13 
 
 
430 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2532  adenylosuccinate synthetase  41.98 
 
 
445 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2029  adenylosuccinate synthetase  39.72 
 
 
429 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00381049  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1280  adenylosuccinate synthetase  40.38 
 
 
427 aa  315  9.999999999999999e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1839  adenylosuccinate synthetase  41.94 
 
 
437 aa  314  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>