More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1284 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1284  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 402 aa  813    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0313  adenylosuccinate synthetase  53.6 
 
 		 399 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.241475  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1647  adenylosuccinate synthetase  54.52 
 
 		 397 aa  429  1e-119  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1720  adenylosuccinate synthetase  54.52 
 
 		 397 aa  428  1e-119  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1365  adenylosuccinate synthetase  46.08 
 
 		 420 aa  341  2e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0397  Adenylosuccinate synthase  45.02 
 
 		 398 aa  328  1.0000000000000001e-88  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1816  adenylosuccinate synthetase  42.72 
 
 		 434 aa  320  3e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  45.28 
 
 		 426 aa  317  3e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0322  adenylosuccinate synthetase  41.85 
 
 		 434 aa  315  7e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0330  adenylosuccinate synthetase  44.63 
 
 		 428 aa  315  9.999999999999999e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  42.37 
 
 		 433 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2262  adenylosuccinate synthetase  41.59 
 
 		 429 aa  312  7.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0914846 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2196  adenylosuccinate synthetase  42.34 
 
 		 434 aa  311  1e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0524  adenylosuccinate synthetase  43.51 
 
 		 432 aa  311  2e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2031  adenylosuccinate synthetase  41.35 
 
 		 435 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11510  Adenylosuccinate synthetase  40.95 
 
 		 434 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  41.29 
 
 		 427 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0046  adenylosuccinate synthetase  43.17 
 
 		 426 aa  302  6.000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.268676  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2390  adenylosuccinate synthetase  40.62 
 
 		 434 aa  302  6.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0213  adenylosuccinate synthetase  41.12 
 
 		 434 aa  301  1e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.816026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  42 
 
 		 427 aa  300  4e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2533  adenylosuccinate synthase  41.57 
 
 		 426 aa  300  4e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000265596  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  41.55 
 
 		 427 aa  297  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2626  adenylosuccinate synthase  41.15 
 
 		 437 aa  297  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000737689 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3069  adenylosuccinate synthetase  47.83 
 
 		 431 aa  297  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00455582  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  42.03 
 
 		 432 aa  297  3e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  41.97 
 
 		 428 aa  296  4e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3635  adenylosuccinate synthetase  40.92 
 
 		 429 aa  296  6e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.336244 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0607  adenylosuccinate synthetase  43.5 
 
 		 432 aa  295  7e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.272974 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3138  adenylosuccinate synthetase  40.81 
 
 		 430 aa  295  9e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32892  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1608  adenylosuccinate synthetase  43.58 
 
 		 428 aa  295  9e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.395219  normal  0.555835 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3914  adenylosuccinate synthetase  43.24 
 
 		 432 aa  294  1e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.923104  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  41.49 
 
 		 444 aa  295  1e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3716  adenylosuccinate synthetase  43.24 
 
 		 432 aa  293  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316289  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  41.05 
 
 		 432 aa  294  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1282  adenylosuccinate synthetase  40.92 
 
 		 431 aa  294  2e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  42.65 
 
 		 427 aa  294  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002264  adenylosuccinate synthetase  42.62 
 
 		 438 aa  294  2e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.151372  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4579  adenylosuccinate synthetase  40.78 
 
 		 431 aa  293  3e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.730826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1328  adenylosuccinate synthetase  42.51 
 
 		 432 aa  293  3e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2149  adenylosuccinate synthetase  41.22 
 
 		 425 aa  293  4e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.755328  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07600  Adenylosuccinate synthetase  42.13 
 
 		 430 aa  293  5e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0330  adenylosuccinate synthetase  42.22 
 
 		 431 aa  291  1e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  40.81 
 
 		 432 aa  291  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27840  Adenylosuccinate synthetase  39.02 
 
 		 438 aa  291  1e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  42.32 
 
 		 427 aa  290  2e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3648  adenylosuccinate synthetase  42.38 
 
 		 432 aa  290  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  39.67 
 
 		 428 aa  291  2e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  40.19 
 
 		 430 aa  291  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00585  adenylosuccinate synthetase  41.49 
 
 		 432 aa  290  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0025  adenylosuccinate synthetase  40.39 
 
 		 426 aa  290  2e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.993316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1271  adenylosuccinate synthetase  38.86 
 
 		 429 aa  290  3e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231459  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2772  adenylosuccinate synthetase  41.37 
 
 		 438 aa  290  4e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0694  adenylosuccinate synthetase  42.14 
 
 		 432 aa  290  4e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3793  adenylosuccinate synthetase  42.14 
 
 		 432 aa  290  4e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0436  adenylosuccinate synthetase  42.27 
 
 		 432 aa  289  5.0000000000000004e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000472279 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3868  adenylosuccinate synthetase  40.05 
 
 		 442 aa  289  5.0000000000000004e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.838486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  40.43 
 
 		 424 aa  289  5.0000000000000004e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  40.19 
 
 		 451 aa  289  6e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  39.47 
 
 		 430 aa  289  6e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2007  adenylosuccinate synthetase  39 
 
 		 431 aa  289  8e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00017376  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4634  adenylosuccinate synthetase  42.41 
 
 		 432 aa  288  9e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4763  adenylosuccinate synthetase  42.41 
 
 		 432 aa  288  9e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.707154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0747  adenylosuccinate synthetase  44.56 
 
 		 431 aa  288  1e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000703533  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4644  adenylosuccinate synthetase  42.41 
 
 		 432 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3266  adenylosuccinate synthetase  44.56 
 
 		 431 aa  288  1e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000110825  hitchhiker  0.0000153755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0681  adenylosuccinate synthetase  44.56 
 
 		 431 aa  288  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00011524  hitchhiker  0.00031126 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04044  adenylosuccinate synthetase  42.65 
 
 		 432 aa  287  2e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3816  Adenylosuccinate synthase  42.65 
 
 		 432 aa  287  2e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  40.19 
 
 		 433 aa  287  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0035  adenylosuccinate synthetase  40.09 
 
 		 438 aa  288  2e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0726  adenylosuccinate synthetase  46.67 
 
 		 431 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0654832  hitchhiker  0.0000471969 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3937  adenylosuccinate synthetase  42.65 
 
 		 431 aa  288  2e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0540  adenylosuccinate synthetase  41.79 
 
 		 432 aa  288  2e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311763  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04006  hypothetical protein  42.65 
 
 		 432 aa  287  2e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4420  adenylosuccinate synthetase  42.65 
 
 		 432 aa  287  2e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4736  adenylosuccinate synthetase  42.65 
 
 		 432 aa  287  2e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4648  adenylosuccinate synthetase  42.65 
 
 		 432 aa  287  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.378806 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3836  adenylosuccinate synthetase  42.65 
 
 		 432 aa  287  2e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.930032  hitchhiker  0.00000195768 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4708  adenylosuccinate synthetase  42.65 
 
 		 432 aa  287  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  42.14 
 
 		 444 aa  288  2e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0509  adenylosuccinate synthetase  43.14 
 
 		 431 aa  287  2e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00567032  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0990  adenylosuccinate synthetase  41.83 
 
 		 429 aa  287  2e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0676  adenylosuccinate synthetase  40.61 
 
 		 446 aa  287  2e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.678663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5693  adenylosuccinate synthetase  42.65 
 
 		 432 aa  287  2e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.580203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02633  adenylosuccinate synthetase  40.76 
 
 		 430 aa  288  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35160  Adenylosuccinate synthetase  40.58 
 
 		 429 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  39.95 
 
 		 429 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1281  adenylosuccinate synthetase  40.09 
 
 		 446 aa  287  2.9999999999999996e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  40.81 
 
 		 431 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  42.31 
 
 		 430 aa  287  2.9999999999999996e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0115  adenylosuccinate synthase  40.05 
 
 		 433 aa  286  2.9999999999999996e-76  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0735  adenylosuccinate synthetase  46.67 
 
 		 431 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000671232  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4727  adenylosuccinate synthetase  42.41 
 
 		 432 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4680  adenylosuccinate synthetase  41.65 
 
 		 430 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0695  adenylosuccinate synthetase  44.3 
 
 		 431 aa  286  4e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000192259  hitchhiker  0.0000489804 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4784  adenylosuccinate synthetase  42.41 
 
 		 432 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3649  adenylosuccinate synthetase  46.67 
 
 		 431 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000709559  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0705  adenylosuccinate synthetase  46.38 
 
 		 431 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00343177  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2641  adenylosuccinate synthetase  40 
 
 		 428 aa  286  5.999999999999999e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>