More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0313 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0313  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 399 aa  815    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.241475  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1284  adenylosuccinate synthetase  52.94 
 
 		 402 aa  428  1e-119  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1720  adenylosuccinate synthetase  48.65 
 
 		 397 aa  388  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1647  adenylosuccinate synthetase  48.16 
 
 		 397 aa  389  1e-107  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1365  adenylosuccinate synthetase  44.12 
 
 		 420 aa  328  9e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  44.63 
 
 		 426 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08766  adenylosuccinate synthetase  40.42 
 
 		 423 aa  318  9e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0287341  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1202  adenylosuccinate synthetase  42.92 
 
 		 425 aa  315  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.609737  normal  0.550164 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0524  adenylosuccinate synthetase  41.59 
 
 		 432 aa  312  5.999999999999999e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1134  adenylosuccinate synthetase  43.96 
 
 		 414 aa  311  2e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2031  adenylosuccinate synthetase  40.95 
 
 		 435 aa  308  8e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2262  adenylosuccinate synthetase  40.48 
 
 		 429 aa  308  8e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0914846 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0322  adenylosuccinate synthetase  40.71 
 
 		 434 aa  308  9e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  40.57 
 
 		 427 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0248  adenylosuccinate synthetase  40.38 
 
 		 423 aa  307  2.0000000000000002e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  40.1 
 
 		 428 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1816  adenylosuccinate synthetase  40.94 
 
 		 434 aa  306  3e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1608  adenylosuccinate synthetase  41.09 
 
 		 428 aa  306  5.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.395219  normal  0.555835 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4579  adenylosuccinate synthetase  41.43 
 
 		 431 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.730826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1701  adenylosuccinate synthetase  40.58 
 
 		 431 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.401877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  40.72 
 
 		 430 aa  304  1.0000000000000001e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0213  adenylosuccinate synthetase  40 
 
 		 434 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.816026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  40.43 
 
 		 427 aa  303  4.0000000000000003e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2196  adenylosuccinate synthetase  40.71 
 
 		 434 aa  301  9e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  39.95 
 
 		 428 aa  301  9e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  40.43 
 
 		 427 aa  301  1e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2390  adenylosuccinate synthetase  39.76 
 
 		 434 aa  301  2e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2958  adenylosuccinate synthetase  41.09 
 
 		 428 aa  300  3e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2641  adenylosuccinate synthetase  41.09 
 
 		 428 aa  300  3e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  40.24 
 
 		 427 aa  300  4e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  38.95 
 
 		 427 aa  299  5e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2221  adenylosuccinate synthetase  39.62 
 
 		 423 aa  299  6e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44855  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  42.39 
 
 		 427 aa  299  7e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3138  adenylosuccinate synthetase  39.1 
 
 		 430 aa  298  1e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32892  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  39.67 
 
 		 427 aa  298  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  39.86 
 
 		 427 aa  298  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0025  adenylosuccinate synthetase  39.76 
 
 		 426 aa  298  1e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.993316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11510  Adenylosuccinate synthetase  39.72 
 
 		 434 aa  297  2e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0115  adenylosuccinate synthase  39.06 
 
 		 433 aa  296  4e-79  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2963  adenylosuccinate synthetase  38.93 
 
 		 428 aa  296  5e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5638  adenylosuccinate synthetase  41.67 
 
 		 424 aa  295  6e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0744769  normal  0.421988 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  40.33 
 
 		 433 aa  295  7e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0139  adenylosuccinate synthetase  38.5 
 
 		 429 aa  295  1e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000561019 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3282  adenylosuccinate synthetase  40.43 
 
 		 437 aa  294  2e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00809393  normal  0.019729 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0133  adenylosuccinate synthase  38.26 
 
 		 807 aa  294  2e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2126  adenylosuccinate synthetase  38.57 
 
 		 428 aa  293  3e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  40.1 
 
 		 430 aa  293  5e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7050  adenylosuccinate synthetase  39.49 
 
 		 432 aa  292  7e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35160  Adenylosuccinate synthetase  38.04 
 
 		 429 aa  291  9e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  41.01 
 
 		 424 aa  291  1e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2149  adenylosuccinate synthetase  40.1 
 
 		 425 aa  291  1e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.755328  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  41.23 
 
 		 427 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2536  adenylosuccinate synthetase  38.33 
 
 		 427 aa  291  2e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0330  adenylosuccinate synthetase  41.53 
 
 		 428 aa  290  2e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23100  Adenylosuccinate synthase  40.91 
 
 		 428 aa  291  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  39.33 
 
 		 444 aa  291  2e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0017  adenylosuccinate synthetase  38.1 
 
 		 427 aa  290  3e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000177457  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2416  adenylosuccinate synthetase  39.9 
 
 		 428 aa  290  3e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0017  adenylosuccinate synthetase  38.1 
 
 		 427 aa  290  3e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4635  adenylosuccinate synthetase  38.73 
 
 		 427 aa  288  8e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.595604  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2532  adenylosuccinate synthetase  39.33 
 
 		 445 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0691  adenylosuccinate synthetase  38.48 
 
 		 439 aa  288  1e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  38.86 
 
 		 430 aa  288  1e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_002950  PG0464  adenylosuccinate synthetase  39.76 
 
 		 423 aa  287  2e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0176  adenylosuccinate synthetase  40.57 
 
 		 427 aa  287  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05631  adenylosuccinate synthetase  38 
 
 		 436 aa  287  2e-76  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  38.63 
 
 		 432 aa  287  2e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  39.09 
 
 		 447 aa  288  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05331  adenylosuccinate synthetase  38 
 
 		 436 aa  288  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4119  adenylosuccinate synthetase  39.57 
 
 		 428 aa  286  4e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0180773  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0507  adenylosuccinate synthetase  38 
 
 		 436 aa  286  4e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  40.19 
 
 		 429 aa  286  4e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07421  adenylosuccinate synthetase  38.61 
 
 		 439 aa  286  4e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  39.95 
 
 		 431 aa  286  5e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  39.23 
 
 		 444 aa  285  8e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  39.34 
 
 		 430 aa  285  8e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2533  adenylosuccinate synthase  40 
 
 		 426 aa  285  1.0000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000265596  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0367  adenylosuccinate synthetase  39.47 
 
 		 428 aa  284  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  37.5 
 
 		 430 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3592  adenylosuccinate synthetase  39.72 
 
 		 431 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000897035  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4219  adenylosuccinate synthetase  39.24 
 
 		 431 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000317238  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  37.95 
 
 		 427 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  39.23 
 
 		 447 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  39.23 
 
 		 447 aa  283  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05071  adenylosuccinate synthetase  37.65 
 
 		 437 aa  283  6.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.22054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0075  adenylosuccinate synthetase  39.09 
 
 		 419 aa  282  7.000000000000001e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1271  adenylosuccinate synthetase  39.53 
 
 		 429 aa  282  8.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231459  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3635  adenylosuccinate synthetase  38.44 
 
 		 429 aa  282  8.000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.336244 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2764  adenylosuccinate synthase  38.1 
 
 		 431 aa  282  9e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  39.52 
 
 		 433 aa  281  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2626  adenylosuccinate synthase  38.33 
 
 		 437 aa  281  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000737689 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1667  adenylosuccinate synthetase  37.56 
 
 		 439 aa  281  1e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3291  adenylosuccinate synthetase  38.77 
 
 		 431 aa  281  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000376094  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0397  Adenylosuccinate synthase  39.45 
 
 		 398 aa  281  2e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  39.33 
 
 		 449 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05701  adenylosuccinate synthetase  38 
 
 		 436 aa  280  3e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1927  adenylosuccinate synthetase  41.21 
 
 		 415 aa  280  4e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  39.86 
 
 		 428 aa  280  4e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2207  adenylosuccinate synthetase  40.05 
 
 		 430 aa  280  4e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0750  adenylosuccinate synthetase  38.53 
 
 		 431 aa  279  6e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000682785  hitchhiker  0.00737735 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>