More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1134 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1134  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 
414 aa  846    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0524  adenylosuccinate synthetase  57.65 
 
 
432 aa  498  1e-140  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1816  adenylosuccinate synthetase  48.58 
 
 
434 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2196  adenylosuccinate synthetase  48.58 
 
 
434 aa  396  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0322  adenylosuccinate synthetase  48.1 
 
 
434 aa  397  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2958  adenylosuccinate synthetase  47.63 
 
 
428 aa  392  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2641  adenylosuccinate synthetase  47.63 
 
 
428 aa  392  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2262  adenylosuccinate synthetase  47.63 
 
 
429 aa  389  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0914846 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3282  adenylosuccinate synthetase  47.54 
 
 
437 aa  390  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00809393  normal  0.019729 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2031  adenylosuccinate synthetase  47.87 
 
 
435 aa  391  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2390  adenylosuccinate synthetase  46.68 
 
 
434 aa  389  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  46.46 
 
 
444 aa  387  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  46.08 
 
 
447 aa  382  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  44.84 
 
 
424 aa  378  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  46.68 
 
 
449 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  44.84 
 
 
433 aa  375  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  46.45 
 
 
430 aa  377  1e-103  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0213  adenylosuccinate synthetase  45.97 
 
 
434 aa  374  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.816026  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1667  adenylosuccinate synthetase  44.84 
 
 
439 aa  373  1e-102  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  44.63 
 
 
430 aa  372  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0330  adenylosuccinate synthetase  46.71 
 
 
428 aa  369  1e-101  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  45.73 
 
 
430 aa  369  1e-101  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0691  adenylosuccinate synthetase  44.13 
 
 
439 aa  369  1e-101  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  46.79 
 
 
428 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  44.89 
 
 
447 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05071  adenylosuccinate synthetase  44.37 
 
 
437 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.22054  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  43.29 
 
 
430 aa  365  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2963  adenylosuccinate synthetase  44.66 
 
 
428 aa  367  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17225  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0492  adenylosuccinate synthetase  45.93 
 
 
428 aa  366  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  44.89 
 
 
447 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2207  adenylosuccinate synthetase  45.73 
 
 
430 aa  367  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  43.93 
 
 
433 aa  365  1e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  46.56 
 
 
428 aa  364  1e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  44.63 
 
 
430 aa  365  1e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0046  adenylosuccinate synthetase  47.98 
 
 
426 aa  363  2e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.268676  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0133  adenylosuccinate synthase  45.39 
 
 
807 aa  364  2e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279104  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0025  adenylosuccinate synthetase  46.08 
 
 
426 aa  363  2e-99  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.993316  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1839  adenylosuccinate synthetase  45.07 
 
 
437 aa  363  3e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  44.6 
 
 
427 aa  363  3e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05641  adenylosuccinate synthetase  45.07 
 
 
437 aa  363  3e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.622975 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23100  Adenylosuccinate synthase  46.46 
 
 
428 aa  363  4e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07421  adenylosuccinate synthetase  44.5 
 
 
439 aa  362  5.0000000000000005e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  44.39 
 
 
432 aa  362  8e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1958  adenylosuccinate synthetase  44.5 
 
 
425 aa  362  8e-99  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  45.13 
 
 
444 aa  362  9e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  44.16 
 
 
432 aa  361  1e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0139  adenylosuccinate synthetase  45.73 
 
 
429 aa  361  1e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000561019 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0115  adenylosuccinate synthase  43.19 
 
 
433 aa  360  2e-98  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2149  adenylosuccinate synthetase  46.37 
 
 
425 aa  360  3e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.755328  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  43.43 
 
 
428 aa  360  3e-98  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2126  adenylosuccinate synthetase  41.92 
 
 
428 aa  358  8e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  45.41 
 
 
427 aa  358  9e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2909  Adenylosuccinate synthetase  45.71 
 
 
429 aa  358  9.999999999999999e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270112  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05701  adenylosuccinate synthetase  45.2 
 
 
436 aa  358  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_849  adenylosuccinate synthase  44.13 
 
 
432 aa  358  9.999999999999999e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000104861  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05631  adenylosuccinate synthetase  44.96 
 
 
436 aa  358  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0507  adenylosuccinate synthetase  44.26 
 
 
436 aa  357  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2532  adenylosuccinate synthetase  45.71 
 
 
445 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  43.56 
 
 
431 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05331  adenylosuccinate synthetase  44.5 
 
 
436 aa  356  3.9999999999999996e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27840  Adenylosuccinate synthetase  44.72 
 
 
438 aa  356  3.9999999999999996e-97  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  45.15 
 
 
432 aa  356  3.9999999999999996e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  44.37 
 
 
427 aa  356  5e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  43.43 
 
 
427 aa  354  1e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  44.96 
 
 
427 aa  355  1e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11510  Adenylosuccinate synthetase  44.39 
 
 
434 aa  354  1e-96  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08766  adenylosuccinate synthetase  44.26 
 
 
423 aa  354  1e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0287341  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  43.95 
 
 
430 aa  354  2e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  43.19 
 
 
427 aa  354  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  44.52 
 
 
429 aa  354  2e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  44.03 
 
 
428 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  43.66 
 
 
427 aa  353  2.9999999999999997e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0517  adenylosuccinate synthetase  41.88 
 
 
428 aa  352  5e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3648  adenylosuccinate synthetase  42.39 
 
 
432 aa  352  5.9999999999999994e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  45.2 
 
 
426 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0694  adenylosuccinate synthetase  42.15 
 
 
432 aa  352  7e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3793  adenylosuccinate synthetase  42.15 
 
 
432 aa  352  7e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  43.16 
 
 
427 aa  352  7e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0075  adenylosuccinate synthetase  46.45 
 
 
419 aa  351  1e-95  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4594  adenylosuccinate synthase  41.78 
 
 
428 aa  351  1e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2533  adenylosuccinate synthase  44.74 
 
 
426 aa  352  1e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000265596  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0976  adenylosuccinate synthetase  43.19 
 
 
423 aa  351  2e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000393074  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05720  adenylosuccinate synthetase  42.14 
 
 
445 aa  350  2e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.196579  normal  0.310447 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35160  Adenylosuccinate synthetase  43.47 
 
 
429 aa  350  2e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2419  adenylosuccinate synthetase  43.06 
 
 
424 aa  350  3e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000351382  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00089  adenylosuccinate synthetase  43.59 
 
 
438 aa  350  4e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2626  adenylosuccinate synthase  44.26 
 
 
437 aa  348  7e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000737689 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0867  adenylosuccinate synthetase  42.72 
 
 
432 aa  348  8e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000883365  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0966  Adenylosuccinate synthase  44.63 
 
 
432 aa  348  1e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  44.5 
 
 
427 aa  348  1e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3019  adenylosuccinate synthetase  43.53 
 
 
424 aa  348  1e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2772  adenylosuccinate synthetase  43.36 
 
 
438 aa  347  2e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  43.78 
 
 
431 aa  347  3e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0248  adenylosuccinate synthetase  43.54 
 
 
423 aa  347  3e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  42.86 
 
 
451 aa  347  3e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0497  adenylosuccinate synthetase  43.46 
 
 
432 aa  346  5e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2661  adenylosuccinate synthetase  41.55 
 
 
431 aa  345  6e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5320  adenylosuccinate synthetase  45.13 
 
 
429 aa  344  1e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000159422  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5716  adenylosuccinate synthetase  45.13 
 
 
429 aa  344  1e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000188586  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0750  adenylosuccinate synthetase  42.29 
 
 
431 aa  344  1e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000682785  hitchhiker  0.00737735 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>