More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0990 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0990  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 429 aa  863    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  55.42 
 
 		 427 aa  451  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11510  Adenylosuccinate synthetase  52.82 
 
 		 434 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0139  adenylosuccinate synthetase  55.53 
 
 		 429 aa  451  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000561019 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  50.93 
 
 		 430 aa  451  1e-125  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0133  adenylosuccinate synthase  55.53 
 
 		 807 aa  449  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  54.37 
 
 		 427 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  52.48 
 
 		 427 aa  444  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  52.96 
 
 		 427 aa  444  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  49.53 
 
 		 430 aa  444  1e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3138  adenylosuccinate synthetase  52.96 
 
 		 430 aa  441  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32892  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  49.06 
 
 		 428 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6908  adenylosuccinate synthetase  55.06 
 
 		 429 aa  436  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  53.9 
 
 		 427 aa  435  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  48.82 
 
 		 428 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2126  adenylosuccinate synthetase  52.69 
 
 		 428 aa  436  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  52.59 
 
 		 427 aa  432  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27840  Adenylosuccinate synthetase  49.89 
 
 		 438 aa  434  1e-120  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0367  adenylosuccinate synthetase  54.82 
 
 		 428 aa  433  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0025  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 		 426 aa  429  1e-119  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.993316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10362  adenylosuccinate synthetase  53.4 
 
 		 432 aa  430  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698825  normal  0.94506 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0667  adenylosuccinate synthetase  52.36 
 
 		 429 aa  429  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0176  adenylosuccinate synthetase  53.07 
 
 		 427 aa  430  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38190  adenylosuccinate synthetase  56 
 
 		 428 aa  430  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0522  adenylosuccinate synthetase  52.83 
 
 		 429 aa  430  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4344  adenylosuccinate synthetase  52.34 
 
 		 432 aa  431  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08920  adenylosuccinate synthetase  52.48 
 
 		 432 aa  430  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  48.35 
 
 		 433 aa  425  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1958  adenylosuccinate synthetase  52.83 
 
 		 425 aa  427  1e-118  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4777  adenylosuccinate synthetase  56 
 
 		 429 aa  427  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.545109  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4119  adenylosuccinate synthetase  52.83 
 
 		 428 aa  426  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0180773  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  51.3 
 
 		 433 aa  426  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05720  adenylosuccinate synthetase  51.03 
 
 		 445 aa  424  1e-117  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.196579  normal  0.310447 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5915  adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 		 439 aa  422  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  49.65 
 
 		 428 aa  423  1e-117  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  48.82 
 
 		 429 aa  424  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  48.71 
 
 		 427 aa  424  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35160  Adenylosuccinate synthetase  51.77 
 
 		 429 aa  422  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  47.17 
 
 		 426 aa  422  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0517  adenylosuccinate synthetase  51.52 
 
 		 428 aa  422  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2963  adenylosuccinate synthetase  51.65 
 
 		 428 aa  424  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17225  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4635  adenylosuccinate synthetase  52.25 
 
 		 427 aa  423  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.595604  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  49.29 
 
 		 451 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0677  adenylosuccinate synthetase  52.46 
 
 		 431 aa  422  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0035  adenylosuccinate synthetase  50.57 
 
 		 438 aa  418  1e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  51.42 
 
 		 427 aa  420  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0504  adenylosuccinate synthetase  52.69 
 
 		 431 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2029  adenylosuccinate synthetase  50.24 
 
 		 429 aa  419  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00381049  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0228  adenylosuccinate synthetase  52.69 
 
 		 431 aa  418  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.043517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0515  adenylosuccinate synthetase  52.69 
 
 		 431 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2909  Adenylosuccinate synthetase  45.99 
 
 		 429 aa  421  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0526  adenylosuccinate synthetase  52.69 
 
 		 431 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2536  adenylosuccinate synthetase  47.16 
 
 		 427 aa  417  9.999999999999999e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5320  adenylosuccinate synthetase  49.05 
 
 		 429 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000159422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5148  adenylosuccinate synthetase  49.05 
 
 		 429 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.87247e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5577  adenylosuccinate synthetase  49.05 
 
 		 429 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.85689e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5716  adenylosuccinate synthetase  49.05 
 
 		 429 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000188586  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2416  adenylosuccinate synthetase  50.71 
 
 		 428 aa  418  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2207  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 		 430 aa  416  9.999999999999999e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3635  adenylosuccinate synthetase  52.01 
 
 		 429 aa  416  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.336244 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0390  adenylosuccinate synthetase  48.12 
 
 		 429 aa  416  9.999999999999999e-116  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000168216  decreased coverage  0.00000000000000193534 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0330  adenylosuccinate synthetase  49.16 
 
 		 428 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0017  adenylosuccinate synthetase  46.45 
 
 		 427 aa  414  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000177457  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02210  adenylosuccinate synthetase  52.48 
 
 		 429 aa  413  1e-114  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  48.11 
 
 		 432 aa  413  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  48.59 
 
 		 431 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  47.88 
 
 		 428 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  46.93 
 
 		 427 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0017  adenylosuccinate synthetase  46.45 
 
 		 427 aa  414  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  49.06 
 
 		 427 aa  413  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  47.17 
 
 		 430 aa  412  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2196  adenylosuccinate synthetase  48.82 
 
 		 434 aa  414  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  50 
 
 		 427 aa  410  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5164  adenylosuccinate synthetase  48.82 
 
 		 429 aa  409  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000038286  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  47.41 
 
 		 432 aa  411  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  47.88 
 
 		 424 aa  410  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2262  adenylosuccinate synthetase  49.05 
 
 		 429 aa  411  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0914846 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  47.89 
 
 		 430 aa  409  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1939  adenylosuccinate synthetase  48.35 
 
 		 428 aa  409  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0046  adenylosuccinate synthetase  48.69 
 
 		 426 aa  410  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.268676  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5617  adenylosuccinate synthetase  48.34 
 
 		 429 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000421439  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3019  adenylosuccinate synthetase  47.76 
 
 		 424 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5655  adenylosuccinate synthetase  48.34 
 
 		 429 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000753015  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1816  adenylosuccinate synthetase  47.98 
 
 		 434 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  47.52 
 
 		 430 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4054  adenylosuccinate synthetase  52.46 
 
 		 428 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.441295  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3868  adenylosuccinate synthetase  47.49 
 
 		 442 aa  408  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.838486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  49.76 
 
 		 430 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2419  adenylosuccinate synthetase  47.28 
 
 		 424 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000351382  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4889  adenylosuccinate synthetase  49.76 
 
 		 430 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0250802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2289  adenylosuccinate synthetase  47.64 
 
 		 426 aa  404  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0641  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 		 431 aa  403  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143682 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2007  adenylosuccinate synthetase  49.05 
 
 		 431 aa  404  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00017376  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5260  adenylosuccinate synthetase  48.1 
 
 		 429 aa  403  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000740199  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3793  adenylosuccinate synthetase  48.46 
 
 		 432 aa  402  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3648  adenylosuccinate synthetase  48.22 
 
 		 432 aa  402  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1271  adenylosuccinate synthetase  48.11 
 
 		 429 aa  402  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231459  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4765  adenylosuccinate synthetase  49.76 
 
 		 430 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00089  adenylosuccinate synthetase  48.36 
 
 		 438 aa  402  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2390  adenylosuccinate synthetase  46.81 
 
 		 434 aa  403  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>