More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0172 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0326  adenylosuccinate synthetase  86.25 
 
 
400 aa  717    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0172  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 
400 aa  811    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.722452 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0205  adenylosuccinate synthetase  65.01 
 
 
404 aa  525  1e-148  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0046  adenylosuccinate synthetase  46.88 
 
 
426 aa  362  7.0000000000000005e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.268676  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  45.88 
 
 
427 aa  360  2e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  46.24 
 
 
427 aa  359  6e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  46.08 
 
 
427 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2533  adenylosuccinate synthase  44.29 
 
 
426 aa  354  1e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000265596  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  43.97 
 
 
433 aa  354  2e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  45.02 
 
 
426 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  43.36 
 
 
428 aa  351  1e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5915  adenylosuccinate synthetase  44.13 
 
 
439 aa  350  3e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2909  Adenylosuccinate synthetase  44.18 
 
 
429 aa  349  5e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270112  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0330  adenylosuccinate synthetase  43.27 
 
 
428 aa  346  3e-94  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  44.55 
 
 
430 aa  345  7e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11510  Adenylosuccinate synthetase  42.59 
 
 
434 aa  345  1e-93  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0492  adenylosuccinate synthetase  46.17 
 
 
428 aa  341  1e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0115  adenylosuccinate synthase  43.4 
 
 
433 aa  341  2e-92  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  41.98 
 
 
430 aa  340  4e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  42.29 
 
 
428 aa  340  4e-92  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  42.32 
 
 
431 aa  339  5e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0366  adenylosuccinate synthetase  42.89 
 
 
430 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0524  adenylosuccinate synthetase  41.86 
 
 
432 aa  338  7e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2126  adenylosuccinate synthetase  44.21 
 
 
428 aa  338  8e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2010  adenylosuccinate synthetase  42.65 
 
 
430 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.34638  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0139  adenylosuccinate synthetase  44.71 
 
 
429 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000561019 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  43.5 
 
 
432 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  43.5 
 
 
432 aa  336  5e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  40.86 
 
 
429 aa  336  5e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0133  adenylosuccinate synthase  44.37 
 
 
807 aa  335  1e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279104  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  42.42 
 
 
447 aa  333  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  42.42 
 
 
447 aa  333  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0875  adenylosuccinate synthetase  42.65 
 
 
430 aa  333  3e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  41.94 
 
 
430 aa  333  4e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  41.81 
 
 
428 aa  332  5e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  42.96 
 
 
427 aa  332  5e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  43.36 
 
 
427 aa  330  2e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3793  adenylosuccinate synthetase  40.62 
 
 
432 aa  330  3e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  42.79 
 
 
433 aa  330  3e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0694  adenylosuccinate synthetase  40.62 
 
 
432 aa  330  3e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3648  adenylosuccinate synthetase  40.86 
 
 
432 aa  330  3e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  42.42 
 
 
427 aa  330  3e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2416  adenylosuccinate synthetase  42.55 
 
 
428 aa  330  3e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2958  adenylosuccinate synthetase  41.78 
 
 
428 aa  329  4e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2641  adenylosuccinate synthetase  41.78 
 
 
428 aa  329  4e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  40.62 
 
 
430 aa  330  4e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0370  adenylosuccinate synthetase  43.9 
 
 
416 aa  329  6e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0409344  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35160  Adenylosuccinate synthetase  42.76 
 
 
429 aa  328  7e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  42.18 
 
 
449 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  39.62 
 
 
424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  41.57 
 
 
428 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  42.42 
 
 
427 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  41.51 
 
 
430 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  41.61 
 
 
444 aa  325  6e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0075  adenylosuccinate synthetase  42.58 
 
 
419 aa  325  7e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2963  adenylosuccinate synthetase  40.86 
 
 
428 aa  325  7e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17225  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0360  adenylosuccinate synthetase  41.09 
 
 
432 aa  325  8.000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.655854  hitchhiker  0.00425653 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3868  adenylosuccinate synthetase  42.22 
 
 
442 aa  325  9e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.838486  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04044  adenylosuccinate synthetase  40.86 
 
 
432 aa  324  1e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3816  Adenylosuccinate synthase  40.86 
 
 
432 aa  324  1e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4420  adenylosuccinate synthetase  40.86 
 
 
432 aa  324  1e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4648  adenylosuccinate synthetase  40.86 
 
 
432 aa  324  1e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.378806 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4708  adenylosuccinate synthetase  40.86 
 
 
432 aa  324  1e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05071  adenylosuccinate synthetase  42.72 
 
 
437 aa  325  1e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.22054  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5693  adenylosuccinate synthetase  40.86 
 
 
432 aa  324  1e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.580203  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04006  hypothetical protein  40.86 
 
 
432 aa  324  1e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4736  adenylosuccinate synthetase  40.86 
 
 
432 aa  324  1e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3836  adenylosuccinate synthetase  40.86 
 
 
432 aa  324  1e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.930032  hitchhiker  0.00000195768 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0176  adenylosuccinate synthetase  43.66 
 
 
427 aa  324  2e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386224  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2149  adenylosuccinate synthetase  43.88 
 
 
425 aa  324  2e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.755328  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3282  adenylosuccinate synthetase  42.55 
 
 
437 aa  324  2e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00809393  normal  0.019729 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  40.6 
 
 
427 aa  323  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  40.47 
 
 
427 aa  323  3e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4727  adenylosuccinate synthetase  40.62 
 
 
432 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4784  adenylosuccinate synthetase  40.62 
 
 
432 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0540  adenylosuccinate synthetase  41.09 
 
 
432 aa  323  4e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311763  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4644  adenylosuccinate synthetase  40.62 
 
 
432 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4763  adenylosuccinate synthetase  40.62 
 
 
432 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.707154  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4634  adenylosuccinate synthetase  40.62 
 
 
432 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0035  adenylosuccinate synthetase  44.21 
 
 
438 aa  323  5e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3716  adenylosuccinate synthetase  41.57 
 
 
432 aa  322  5e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316289  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2207  adenylosuccinate synthetase  41 
 
 
430 aa  322  7e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3914  adenylosuccinate synthetase  41.57 
 
 
432 aa  322  8e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.923104  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0497  adenylosuccinate synthetase  42.04 
 
 
432 aa  321  9.999999999999999e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  39.9 
 
 
430 aa  321  9.999999999999999e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2270  adenylosuccinate synthetase  43.27 
 
 
418 aa  322  9.999999999999999e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2144  adenylosuccinate synthase  42.79 
 
 
430 aa  322  9.999999999999999e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1265  adenylosuccinate synthetase  42.72 
 
 
432 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0163864  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  42.22 
 
 
427 aa  321  9.999999999999999e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3635  adenylosuccinate synthetase  41.47 
 
 
429 aa  321  9.999999999999999e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.336244 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2691  adenylosuccinate synthetase  42.72 
 
 
432 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321196  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3069  adenylosuccinate synthetase  41.27 
 
 
431 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00455582  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1671  adenylosuccinate synthetase  41.77 
 
 
416 aa  320  1.9999999999999998e-86  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0966  Adenylosuccinate synthase  41.63 
 
 
432 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1846  adenylosuccinate synthetase  41.77 
 
 
416 aa  320  1.9999999999999998e-86  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  41.96 
 
 
447 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2598  adenylosuccinate synthetase  42.49 
 
 
432 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0051551  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1490  adenylosuccinate synthetase  41.77 
 
 
416 aa  320  1.9999999999999998e-86  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4469  adenylosuccinate synthetase  43.93 
 
 
429 aa  320  3e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0367  adenylosuccinate synthetase  42.49 
 
 
428 aa  320  3e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>