More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0326 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0172  adenylosuccinate synthetase  86.25 
 
 
400 aa  717    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.722452 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0326  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 
400 aa  815    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0205  adenylosuccinate synthetase  65.51 
 
 
404 aa  537  1e-151  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0046  adenylosuccinate synthetase  46.88 
 
 
426 aa  369  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.268676  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11510  Adenylosuccinate synthetase  44 
 
 
434 aa  366  1e-100  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2909  Adenylosuccinate synthetase  45.13 
 
 
429 aa  367  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270112  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  45.5 
 
 
433 aa  366  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  46.21 
 
 
427 aa  366  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0330  adenylosuccinate synthetase  45.04 
 
 
428 aa  358  9.999999999999999e-98  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  45.26 
 
 
430 aa  358  9.999999999999999e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5915  adenylosuccinate synthetase  44.13 
 
 
439 aa  357  2.9999999999999997e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  43.84 
 
 
426 aa  356  5e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  44.5 
 
 
427 aa  355  1e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2533  adenylosuccinate synthase  43.81 
 
 
426 aa  353  2.9999999999999997e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000265596  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  43.06 
 
 
428 aa  350  2e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  43.09 
 
 
428 aa  350  3e-95  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  42.52 
 
 
430 aa  348  7e-95  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  42.28 
 
 
429 aa  347  1e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2416  adenylosuccinate synthetase  44.71 
 
 
428 aa  348  1e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  44.79 
 
 
427 aa  346  4e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  44.11 
 
 
427 aa  345  8e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0115  adenylosuccinate synthase  43.03 
 
 
433 aa  343  2.9999999999999997e-93  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0139  adenylosuccinate synthetase  44.31 
 
 
429 aa  341  1e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000561019 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0176  adenylosuccinate synthetase  44.79 
 
 
427 aa  340  2e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386224  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  42.52 
 
 
428 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  41.84 
 
 
430 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  43.59 
 
 
427 aa  340  4e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  43.97 
 
 
432 aa  339  4e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  43.6 
 
 
449 aa  339  4e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35160  Adenylosuccinate synthetase  43.74 
 
 
429 aa  339  5e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  42.28 
 
 
428 aa  339  5e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0075  adenylosuccinate synthetase  45.01 
 
 
419 aa  339  5e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0133  adenylosuccinate synthase  44.1 
 
 
807 aa  339  5.9999999999999996e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279104  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  43.97 
 
 
432 aa  338  7e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  43.58 
 
 
427 aa  338  7e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  41.23 
 
 
444 aa  338  9.999999999999999e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05071  adenylosuccinate synthetase  42.28 
 
 
437 aa  337  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.22054  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  41.81 
 
 
430 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  42.92 
 
 
430 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  41.23 
 
 
447 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  41.23 
 
 
447 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3868  adenylosuccinate synthetase  43.54 
 
 
442 aa  336  5e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.838486  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2207  adenylosuccinate synthetase  42.65 
 
 
430 aa  335  5.999999999999999e-91  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27840  Adenylosuccinate synthetase  41.8 
 
 
438 aa  335  5.999999999999999e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0990  adenylosuccinate synthetase  42.92 
 
 
429 aa  335  7e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  42.08 
 
 
431 aa  335  1e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  40.76 
 
 
447 aa  333  3e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0524  adenylosuccinate synthetase  42.25 
 
 
432 aa  333  3e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3282  adenylosuccinate synthetase  41.71 
 
 
437 aa  333  3e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00809393  normal  0.019729 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2641  adenylosuccinate synthetase  42.22 
 
 
428 aa  332  6e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2958  adenylosuccinate synthetase  42.22 
 
 
428 aa  332  8e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2963  adenylosuccinate synthetase  41.61 
 
 
428 aa  332  9e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17225  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3635  adenylosuccinate synthetase  42.32 
 
 
429 aa  331  2e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.336244 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0035  adenylosuccinate synthetase  43.65 
 
 
438 aa  330  2e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2126  adenylosuccinate synthetase  42.79 
 
 
428 aa  331  2e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  42.72 
 
 
427 aa  330  2e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  41.12 
 
 
427 aa  330  3e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1927  adenylosuccinate synthetase  43.37 
 
 
415 aa  329  4e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  40.57 
 
 
424 aa  330  4e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0517  adenylosuccinate synthetase  42.69 
 
 
428 aa  329  4e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0492  adenylosuccinate synthetase  44.74 
 
 
428 aa  330  4e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0370  adenylosuccinate synthetase  42.93 
 
 
416 aa  329  4e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0409344  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3138  adenylosuccinate synthetase  41.84 
 
 
430 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32892  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1671  adenylosuccinate synthetase  43.34 
 
 
416 aa  327  2.0000000000000001e-88  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  41.23 
 
 
444 aa  327  2.0000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1846  adenylosuccinate synthetase  43.34 
 
 
416 aa  327  2.0000000000000001e-88  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  41.47 
 
 
427 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1490  adenylosuccinate synthetase  43.34 
 
 
416 aa  327  2.0000000000000001e-88  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85387  predicted protein  41.05 
 
 
430 aa  327  3e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.424834 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07421  adenylosuccinate synthetase  41.81 
 
 
439 aa  326  3e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2149  adenylosuccinate synthetase  44.47 
 
 
425 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.755328  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2691  adenylosuccinate synthetase  42.86 
 
 
432 aa  326  5e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321196  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1265  adenylosuccinate synthetase  42.86 
 
 
432 aa  326  5e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0163864  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2504  adenylosuccinate synthetase  42.69 
 
 
431 aa  325  7e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000458788 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0677  adenylosuccinate synthetase  43.5 
 
 
431 aa  325  7e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0397  Adenylosuccinate synthase  44.25 
 
 
398 aa  325  8.000000000000001e-88  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2598  adenylosuccinate synthetase  42.62 
 
 
432 aa  325  9e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0051551  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0540  adenylosuccinate synthetase  41.81 
 
 
432 aa  325  1e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311763  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6908  adenylosuccinate synthetase  43.74 
 
 
429 aa  325  1e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0228  adenylosuccinate synthetase  43.97 
 
 
431 aa  325  1e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.043517  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5320  adenylosuccinate synthetase  41.09 
 
 
429 aa  324  2e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000159422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5148  adenylosuccinate synthetase  41.09 
 
 
429 aa  324  2e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.87247e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3648  adenylosuccinate synthetase  41.57 
 
 
432 aa  323  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0366  adenylosuccinate synthetase  41.37 
 
 
430 aa  324  2e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5716  adenylosuccinate synthetase  41.09 
 
 
429 aa  324  2e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000188586  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0515  adenylosuccinate synthetase  43.74 
 
 
431 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5577  adenylosuccinate synthetase  41.09 
 
 
429 aa  324  2e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.85689e-26 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0694  adenylosuccinate synthetase  41.81 
 
 
432 aa  324  2e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3793  adenylosuccinate synthetase  41.81 
 
 
432 aa  324  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0526  adenylosuccinate synthetase  43.74 
 
 
431 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2010  adenylosuccinate synthetase  41.37 
 
 
430 aa  323  3e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.34638  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10362  adenylosuccinate synthetase  43.5 
 
 
432 aa  323  3e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698825  normal  0.94506 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0691  adenylosuccinate synthetase  41.61 
 
 
439 aa  323  3e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  40.66 
 
 
427 aa  323  4e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0504  adenylosuccinate synthetase  43.5 
 
 
431 aa  322  6e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  41.61 
 
 
433 aa  322  7e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1627  adenylosuccinate synthetase  42.65 
 
 
533 aa  322  7e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26256  adenylosuccinate synthetase  41.49 
 
 
526 aa  322  8e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1958  adenylosuccinate synthetase  42.38 
 
 
425 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1839  adenylosuccinate synthetase  40.38 
 
 
437 aa  320  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>