More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0205 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0205  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 404 aa  818    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0326  adenylosuccinate synthetase  65.51 
 
 		 400 aa  537  1e-151  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0172  adenylosuccinate synthetase  65.01 
 
 		 400 aa  525  1e-148  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.722452 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  46.59 
 
 		 447 aa  357  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  46.59 
 
 		 447 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  45.41 
 
 		 426 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05071  adenylosuccinate synthetase  45.18 
 
 		 437 aa  357  2.9999999999999997e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.22054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2909  Adenylosuccinate synthetase  43.4 
 
 		 429 aa  356  5e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0046  adenylosuccinate synthetase  45.95 
 
 		 426 aa  355  8.999999999999999e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.268676  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  46.15 
 
 		 427 aa  352  7e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  46.96 
 
 		 427 aa  352  8.999999999999999e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  44.21 
 
 		 447 aa  351  1e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  45.99 
 
 		 449 aa  352  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  44.1 
 
 		 428 aa  350  2e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  44 
 
 		 444 aa  350  2e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  43.87 
 
 		 430 aa  350  2e-95  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5915  adenylosuccinate synthetase  45.2 
 
 		 439 aa  349  4e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3282  adenylosuccinate synthetase  44.81 
 
 		 437 aa  349  4e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00809393  normal  0.019729 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  43.4 
 
 		 429 aa  349  5e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2207  adenylosuccinate synthetase  43.29 
 
 		 430 aa  348  7e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  44 
 
 		 428 aa  347  2e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  44.99 
 
 		 444 aa  346  4e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27840  Adenylosuccinate synthetase  43.45 
 
 		 438 aa  344  1e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0524  adenylosuccinate synthetase  44.29 
 
 		 432 aa  344  1e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11510  Adenylosuccinate synthetase  44.16 
 
 		 434 aa  344  1e-93  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  46.23 
 
 		 427 aa  343  2e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0691  adenylosuccinate synthetase  43.87 
 
 		 439 aa  344  2e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2533  adenylosuccinate synthase  45.73 
 
 		 426 aa  343  2e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000265596  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  46.48 
 
 		 430 aa  342  7e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  43.63 
 
 		 427 aa  342  9e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07421  adenylosuccinate synthetase  44.63 
 
 		 439 aa  341  1e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  44.16 
 
 		 427 aa  341  1e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  42.99 
 
 		 430 aa  340  2e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  42.52 
 
 		 428 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0492  adenylosuccinate synthetase  47.86 
 
 		 428 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0139  adenylosuccinate synthetase  45.33 
 
 		 429 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000561019 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  44.13 
 
 		 432 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05631  adenylosuccinate synthetase  43.53 
 
 		 436 aa  337  2.9999999999999997e-91  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05641  adenylosuccinate synthetase  42.92 
 
 		 437 aa  336  5e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.622975 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1839  adenylosuccinate synthetase  42.92 
 
 		 437 aa  336  5e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0133  adenylosuccinate synthase  44.99 
 
 		 807 aa  336  5e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  43.03 
 
 		 428 aa  335  5.999999999999999e-91  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05331  adenylosuccinate synthetase  43.29 
 
 		 436 aa  336  5.999999999999999e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0990  adenylosuccinate synthetase  42.96 
 
 		 429 aa  335  7.999999999999999e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  43.29 
 
 		 433 aa  335  9e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2532  adenylosuccinate synthetase  46.23 
 
 		 445 aa  335  9e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  43.63 
 
 		 424 aa  335  1e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  43.56 
 
 		 432 aa  334  1e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  44.99 
 
 		 427 aa  335  1e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1271  adenylosuccinate synthetase  41.78 
 
 		 429 aa  334  1e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231459  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1667  adenylosuccinate synthetase  43.93 
 
 		 439 aa  333  2e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0507  adenylosuccinate synthetase  43.29 
 
 		 436 aa  334  2e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  42.02 
 
 		 430 aa  332  5e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1841  Adenylosuccinate synthase  44.81 
 
 		 430 aa  332  6e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.842522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0025  adenylosuccinate synthetase  42.22 
 
 		 426 aa  331  1e-89  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.993316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0330  adenylosuccinate synthetase  42 
 
 		 428 aa  330  2e-89  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0176  adenylosuccinate synthetase  44.76 
 
 		 427 aa  331  2e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1958  adenylosuccinate synthetase  44.39 
 
 		 425 aa  331  2e-89  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0367  adenylosuccinate synthetase  43.49 
 
 		 428 aa  330  2e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2641  adenylosuccinate synthetase  42.82 
 
 		 428 aa  330  2e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35160  Adenylosuccinate synthetase  43.4 
 
 		 429 aa  330  2e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  44.16 
 
 		 427 aa  330  3e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05701  adenylosuccinate synthetase  42.82 
 
 		 436 aa  330  3e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  43.22 
 
 		 427 aa  329  6e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  41.96 
 
 		 430 aa  329  6e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2958  adenylosuccinate synthetase  42.59 
 
 		 428 aa  328  7e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2536  adenylosuccinate synthetase  42.12 
 
 		 427 aa  328  9e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  42.07 
 
 		 433 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0017  adenylosuccinate synthetase  42.06 
 
 		 427 aa  327  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000177457  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  43.79 
 
 		 431 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  41.49 
 
 		 431 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0017  adenylosuccinate synthetase  42.06 
 
 		 427 aa  327  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4214  adenylosuccinate synthase  44.34 
 
 		 430 aa  327  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.855707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  43.16 
 
 		 427 aa  327  3e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2784  adenylosuccinate synthetase  45.9 
 
 		 429 aa  326  4.0000000000000003e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.436445  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2416  adenylosuccinate synthetase  43.16 
 
 		 428 aa  326  5e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2126  adenylosuccinate synthetase  42.99 
 
 		 428 aa  326  5e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  42.4 
 
 		 430 aa  326  6e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  43.63 
 
 		 427 aa  325  7e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2270  adenylosuccinate synthetase  43.33 
 
 		 418 aa  325  9e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0397  Adenylosuccinate synthase  43.77 
 
 		 398 aa  324  2e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0940  Adenylosuccinate synthase  42.59 
 
 		 430 aa  324  2e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0115  adenylosuccinate synthase  41.82 
 
 		 433 aa  324  2e-87  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0444  adenylosuccinate synthase  44.44 
 
 		 430 aa  324  2e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.774885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3138  adenylosuccinate synthetase  42.72 
 
 		 430 aa  323  4e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32892  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7581  adenylosuccinate synthetase  44.47 
 
 		 430 aa  323  4e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4774  adenylosuccinate synthetase  44.13 
 
 		 430 aa  323  4e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2963  adenylosuccinate synthetase  43.4 
 
 		 428 aa  322  5e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0962  Adenylosuccinate synthase  42.59 
 
 		 430 aa  322  6e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.470264  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4086  adenylosuccinate synthetase  43.19 
 
 		 430 aa  322  7e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0852587 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4344  adenylosuccinate synthetase  43.36 
 
 		 432 aa  322  8e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2262  adenylosuccinate synthetase  41.81 
 
 		 429 aa  321  9.999999999999999e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0914846 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0037  adenylosuccinate synthetase  43.03 
 
 		 448 aa  321  9.999999999999999e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.505248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_849  adenylosuccinate synthase  41.27 
 
 		 432 aa  322  9.999999999999999e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000104861  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0999  adenylosuccinate synthase  42.35 
 
 		 448 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.595096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  40.89 
 
 		 427 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1850  adenylosuccinate synthetase  43.53 
 
 		 430 aa  320  3e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1460  adenylosuccinate synthetase  42.19 
 
 		 427 aa  320  3.9999999999999996e-86  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.57165  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6845  adenylosuccinate synthase  43.76 
 
 		 430 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0075  adenylosuccinate synthetase  42.75 
 
 		 419 aa  319  5e-86  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>