More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1964 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1964  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 337 aa  661    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0677  adenylosuccinate synthetase  47.62 
 
 		 338 aa  322  7e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.41311 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0146  adenylosuccinate synthetase  47.9 
 
 		 337 aa  321  9.000000000000001e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00393443  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0743  adenylosuccinate synthetase  46.73 
 
 		 338 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00140834  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1241  adenylosuccinate synthetase  47.01 
 
 		 337 aa  319  5e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0114647  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0033  adenylosuccinate synthetase  46.11 
 
 		 336 aa  316  4e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0064  adenylosuccinate synthetase  47.59 
 
 		 336 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000115242  hitchhiker  0.000142172 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2319  adenylosuccinate synthetase  46.25 
 
 		 337 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0005  adenylosuccinate synthetase  47.75 
 
 		 346 aa  302  5.000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1420  adenylosuccinate synthetase  44.71 
 
 		 333 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2232  adenylosuccinate synthetase  45.35 
 
 		 350 aa  282  5.000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.463237  normal  0.0169384 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0004  adenylosuccinate synthetase  45.05 
 
 		 337 aa  281  1e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0019  adenylosuccinate synthetase  44.14 
 
 		 336 aa  272  6e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.617132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0128  adenylosuccinate synthetase  44.48 
 
 		 334 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0146  adenylosuccinate synthetase  43.98 
 
 		 332 aa  260  2e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.531372  normal  0.191753 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0162  adenylosuccinate synthetase  43.98 
 
 		 334 aa  259  4e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1196  adenylosuccinate synthetase  43.24 
 
 		 334 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0015  adenylosuccinate synthetase  38.55 
 
 		 337 aa  251  9.000000000000001e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000196036  normal  0.0126394 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1220  Adenylosuccinate synthase  37.13 
 
 		 335 aa  240  2e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200996  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1359  adenylosuccinate synthase  37.98 
 
 		 338 aa  216  2.9999999999999998e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2004  adenylosuccinate synthase  35.8 
 
 		 561 aa  193  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00819563  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0610  Adenylosuccinate synthase  35.41 
 
 		 507 aa  192  5e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0278665  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0172  adenylosuccinate synthetase  32.67 
 
 		 400 aa  175  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.722452 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  30.91 
 
 		 427 aa  171  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  31.04 
 
 		 427 aa  170  4e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0115  adenylosuccinate synthase  35.65 
 
 		 433 aa  169  8e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2207  adenylosuccinate synthetase  34.23 
 
 		 430 aa  168  1e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  34.19 
 
 		 428 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  31.96 
 
 		 427 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2126  adenylosuccinate synthetase  36.86 
 
 		 428 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  32.37 
 
 		 427 aa  166  4e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  33.17 
 
 		 427 aa  166  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  35.05 
 
 		 427 aa  166  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0498  Adenylosuccinate synthase  36.16 
 
 		 550 aa  166  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000018536  hitchhiker  0.00191314 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  30.75 
 
 		 427 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  33.73 
 
 		 429 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3894  adenylosuccinate synthetase  37.5 
 
 		 430 aa  166  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.108834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2909  Adenylosuccinate synthetase  29.47 
 
 		 429 aa  164  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1330  adenylosuccinate synthetase  32.46 
 
 		 430 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.396862  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0326  adenylosuccinate synthetase  31.92 
 
 		 400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1049  adenylosuccinate synthetase  30.29 
 
 		 435 aa  164  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  29.9 
 
 		 428 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  34.14 
 
 		 430 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0205  adenylosuccinate synthetase  32.83 
 
 		 404 aa  164  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85387  predicted protein  28.1 
 
 		 430 aa  164  2.0000000000000002e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.424834 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2533  adenylosuccinate synthase  33.93 
 
 		 426 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000265596  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1123  adenylosuccinate synthetase  36.23 
 
 		 457 aa  164  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0390  adenylosuccinate synthetase  33.73 
 
 		 429 aa  164  3e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000168216  decreased coverage  0.00000000000000193534 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7581  adenylosuccinate synthetase  39.29 
 
 		 430 aa  164  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  34.85 
 
 		 428 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  34.14 
 
 		 430 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  30.14 
 
 		 428 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08920  adenylosuccinate synthetase  31.4 
 
 		 432 aa  162  6e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4635  adenylosuccinate synthetase  31.35 
 
 		 427 aa  162  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.595604  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6845  adenylosuccinate synthase  38.69 
 
 		 430 aa  162  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4086  adenylosuccinate synthetase  36.61 
 
 		 430 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0852587 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0941  adenylosuccinate synthetase  30.05 
 
 		 435 aa  162  8.000000000000001e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0046  adenylosuccinate synthetase  28.81 
 
 		 426 aa  162  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.268676  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4774  adenylosuccinate synthetase  31.44 
 
 		 430 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0025  adenylosuccinate synthetase  30.26 
 
 		 426 aa  161  1e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.993316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1939  adenylosuccinate synthetase  36.01 
 
 		 428 aa  161  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2072  adenylosuccinate synthetase  37.06 
 
 		 426 aa  162  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.643545  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  30.68 
 
 		 427 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  34.23 
 
 		 451 aa  161  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1370  adenylosuccinate synthetase  32.52 
 
 		 416 aa  161  2e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  32.69 
 
 		 427 aa  160  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  34.33 
 
 		 427 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  32.13 
 
 		 424 aa  161  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0368  adenylosuccinate synthetase  29.33 
 
 		 416 aa  160  3e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.361154  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0370  adenylosuccinate synthetase  28.81 
 
 		 416 aa  160  3e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0409344  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02633  adenylosuccinate synthetase  31.59 
 
 		 430 aa  160  4e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  34.83 
 
 		 430 aa  160  4e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2965  adenylosuccinate synthetase  36.53 
 
 		 430 aa  160  4e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.125391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1523  adenylosuccinate synthetase  29.55 
 
 		 442 aa  160  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000140547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27840  Adenylosuccinate synthetase  33.15 
 
 		 438 aa  159  5e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  35.26 
 
 		 427 aa  159  5e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2764  adenylosuccinate synthase  31 
 
 		 431 aa  159  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  33.63 
 
 		 449 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  30.22 
 
 		 431 aa  159  7e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3379  adenylosuccinate synthetase  31.47 
 
 		 436 aa  159  9e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1068  adenylosuccinate synthetase  30.36 
 
 		 428 aa  158  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  32.13 
 
 		 447 aa  158  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1328  adenylosuccinate synthetase  29.74 
 
 		 432 aa  158  1e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2504  adenylosuccinate synthetase  31.65 
 
 		 431 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000458788 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1280  adenylosuccinate synthetase  31.91 
 
 		 427 aa  158  1e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3346  adenylosuccinate synthetase  32.63 
 
 		 432 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.474516  hitchhiker  0.00582802 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2661  adenylosuccinate synthetase  33.24 
 
 		 431 aa  157  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3089  adenylosuccinate synthetase  32.39 
 
 		 432 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126084  normal  0.070043 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0578  adenylosuccinate synthetase  31.5 
 
 		 432 aa  157  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000001206 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  30.05 
 
 		 430 aa  157  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3544  adenylosuccinate synthetase  33.33 
 
 		 432 aa  158  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4469  adenylosuccinate synthetase  31.92 
 
 		 429 aa  157  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1850  adenylosuccinate synthetase  37.2 
 
 		 430 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26256  adenylosuccinate synthetase  28.27 
 
 		 526 aa  157  3e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1985  adenylosuccinate synthetase  30.75 
 
 		 444 aa  156  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.151418 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2131  adenylosuccinate synthetase  28.57 
 
 		 416 aa  156  4e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  32.42 
 
 		 444 aa  156  4e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0940  Adenylosuccinate synthase  33.97 
 
 		 430 aa  156  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2390  adenylosuccinate synthetase  29.59 
 
 		 434 aa  156  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0999  adenylosuccinate synthase  33.73 
 
 		 448 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.595096  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>