More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2072 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2072  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 426 aa  871    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.643545  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 		 430 aa  428  1e-119  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  48.94 
 
 		 426 aa  421  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 		 428 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2536  adenylosuccinate synthetase  49.18 
 
 		 427 aa  417  9.999999999999999e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  49.17 
 
 		 430 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 		 447 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 		 447 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0017  adenylosuccinate synthetase  48.71 
 
 		 427 aa  414  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0017  adenylosuccinate synthetase  48.71 
 
 		 427 aa  414  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000177457  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  48.94 
 
 		 447 aa  411  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  48 
 
 		 427 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  48.94 
 
 		 429 aa  411  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  48.47 
 
 		 444 aa  409  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2958  adenylosuccinate synthetase  48.47 
 
 		 428 aa  410  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2641  adenylosuccinate synthetase  48.47 
 
 		 428 aa  410  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  48.94 
 
 		 444 aa  405  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 		 427 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  48 
 
 		 449 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3282  adenylosuccinate synthetase  47.53 
 
 		 437 aa  405  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00809393  normal  0.019729 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2909  Adenylosuccinate synthetase  48.23 
 
 		 429 aa  408  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  48.11 
 
 		 433 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5320  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 		 429 aa  401  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000159422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5148  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 		 429 aa  401  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.87247e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  47.28 
 
 		 428 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  47.18 
 
 		 430 aa  404  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5716  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 		 429 aa  401  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000188586  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  47.89 
 
 		 432 aa  404  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2207  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 		 430 aa  404  1e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5577  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 		 429 aa  401  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.85689e-26 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  47.52 
 
 		 428 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  46.71 
 
 		 432 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05071  adenylosuccinate synthetase  47.76 
 
 		 437 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.22054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2532  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 		 445 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  48.24 
 
 		 430 aa  397  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  45.41 
 
 		 424 aa  395  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  48.24 
 
 		 430 aa  397  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07421  adenylosuccinate synthetase  47.06 
 
 		 439 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1282  adenylosuccinate synthetase  48.57 
 
 		 431 aa  396  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0390  adenylosuccinate synthetase  45.67 
 
 		 429 aa  398  1e-109  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000168216  decreased coverage  0.00000000000000193534 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  46.48 
 
 		 431 aa  396  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1939  adenylosuccinate synthetase  48.1 
 
 		 431 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5617  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 		 429 aa  392  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000421439  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0069  adenylosuccinate synthetase  46.82 
 
 		 432 aa  394  1e-108  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215485  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  47.63 
 
 		 430 aa  393  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3868  adenylosuccinate synthetase  47.02 
 
 		 442 aa  394  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.838486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5341  adenylosuccinate synthetase  49.65 
 
 		 429 aa  393  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000698384  hitchhiker  0.0000000000916292 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2419  adenylosuccinate synthetase  45.99 
 
 		 424 aa  392  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000351382  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05641  adenylosuccinate synthetase  46.82 
 
 		 437 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.622975 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5164  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 		 429 aa  390  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000038286  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  47.41 
 
 		 427 aa  388  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1839  adenylosuccinate synthetase  46.82 
 
 		 437 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5655  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 		 429 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000753015  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5594  adenylosuccinate synthetase  49.17 
 
 		 429 aa  390  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000767866  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1523  adenylosuccinate synthetase  46.19 
 
 		 442 aa  389  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000140547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5260  adenylosuccinate synthetase  49.17 
 
 		 429 aa  391  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000740199  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  47.53 
 
 		 427 aa  385  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0550  adenylosuccinate synthetase  47.87 
 
 		 431 aa  387  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0526  adenylosuccinate synthetase  47.39 
 
 		 431 aa  386  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  48.11 
 
 		 427 aa  386  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  46.95 
 
 		 427 aa  385  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  46.59 
 
 		 427 aa  387  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08920  adenylosuccinate synthetase  48.58 
 
 		 432 aa  385  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  46.48 
 
 		 451 aa  388  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  46.01 
 
 		 433 aa  383  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4889  adenylosuccinate synthetase  48.34 
 
 		 430 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0250802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4765  adenylosuccinate synthetase  48.34 
 
 		 430 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1667  adenylosuccinate synthetase  46.12 
 
 		 439 aa  384  1e-105  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0691  adenylosuccinate synthetase  45.88 
 
 		 439 aa  384  1e-105  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0507  adenylosuccinate synthetase  47.06 
 
 		 436 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4941  adenylosuccinate synthetase  48.34 
 
 		 430 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348011 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1784  adenylosuccinate synthetase  48 
 
 		 430 aa  382  1e-105  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27840  Adenylosuccinate synthetase  47.94 
 
 		 438 aa  384  1e-105  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0660  adenylosuccinate synthetase  49.06 
 
 		 431 aa  382  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0990  adenylosuccinate synthetase  46.95 
 
 		 429 aa  385  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2125  Adenylosuccinate synthase  48.01 
 
 		 423 aa  382  1e-105  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.9394  normal  0.847855 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0578  adenylosuccinate synthetase  47.62 
 
 		 432 aa  382  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000001206 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10362  adenylosuccinate synthetase  47.69 
 
 		 432 aa  384  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698825  normal  0.94506 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1460  adenylosuccinate synthetase  47.53 
 
 		 427 aa  383  1e-105  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.57165  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0641  adenylosuccinate synthetase  48.46 
 
 		 431 aa  382  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143682 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  46.71 
 
 		 430 aa  382  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2029  adenylosuccinate synthetase  46.71 
 
 		 429 aa  381  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00381049  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  47.41 
 
 		 427 aa  380  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0330  adenylosuccinate synthetase  47.98 
 
 		 431 aa  381  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4680  adenylosuccinate synthetase  48.34 
 
 		 430 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4937  adenylosuccinate synthetase  47.63 
 
 		 430 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0577  adenylosuccinate synthetase  47.63 
 
 		 430 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1719  adenylosuccinate synthetase  47.76 
 
 		 430 aa  380  1e-104  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0528  adenylosuccinate synthetase  47.38 
 
 		 429 aa  378  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650318  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  46.01 
 
 		 431 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  47.06 
 
 		 427 aa  380  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5667  adenylosuccinate synthetase  47.63 
 
 		 430 aa  378  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05331  adenylosuccinate synthetase  46.12 
 
 		 436 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05701  adenylosuccinate synthetase  46.59 
 
 		 436 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3013  adenylosuccinate synthetase  48.46 
 
 		 430 aa  379  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.220071  normal  0.0269955 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2007  adenylosuccinate synthetase  48.1 
 
 		 431 aa  381  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00017376  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1328  adenylosuccinate synthetase  46.82 
 
 		 432 aa  379  1e-104  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02633  adenylosuccinate synthetase  47.27 
 
 		 430 aa  380  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05631  adenylosuccinate synthetase  46.12 
 
 		 436 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65230  adenylosuccinate synthetase  47.63 
 
 		 430 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>