More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A1632 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA0778  aminotransferase family protein  100 
 
 		 371 aa  727    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.553188  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0679  aminotransferase family protein  100 
 
 		 371 aa  727    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0567  aminotransferase family protein  100 
 
 		 371 aa  727    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.188686  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1632  aminotransferase family protein  100 
 
 		 371 aa  727    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.170388  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0496  aminotransferase family protein  90.93 
 
 		 408 aa  628  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1984  aminotransferase, class I/II  90.93 
 
 		 408 aa  628  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2081  aminotransferase, class I/II  90.69 
 
 		 408 aa  626  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0896  aminotransferase family protein  86.58 
 
 		 406 aa  578  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2576  putative aminotransferase  51.39 
 
 		 398 aa  360  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.124725 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6594  putative transcriptional regulator, GntR family  51.39 
 
 		 398 aa  359  5e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394989  normal  0.110882 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4020  GntR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 399 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  0.199262 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3498  aminotransferase, class I and II  50.75 
 
 		 399 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3440  GntR family transcriptional regulator  50.25 
 
 		 399 aa  342  5e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2654  aminotransferase, class I and II  50 
 
 		 424 aa  339  5e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5262  aminotransferase, class I and II  50 
 
 		 399 aa  339  5e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.276106  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5148  GntR family transcriptional regulator  51.41 
 
 		 399 aa  330  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5576  putative 2-aminoadipate transaminase  49.49 
 
 		 407 aa  322  5e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.981257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5662  GntR family transcriptional regulator  46.04 
 
 		 425 aa  299  5e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.182521  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  40.35 
 
 		 395 aa  277  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  40.35 
 
 		 395 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 398 aa  270  4e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  42.97 
 
 		 402 aa  270  4e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 414 aa  268  8.999999999999999e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  41.25 
 
 		 400 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  42.46 
 
 		 402 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1762  GntR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 396 aa  263  4e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  38.99 
 
 		 395 aa  259  4e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 393 aa  259  5.0000000000000005e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  43.93 
 
 		 402 aa  258  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  42.56 
 
 		 395 aa  257  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 398 aa  252  6e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  38.1 
 
 		 397 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4054  putative transcriptional regulator, GntR family  38.35 
 
 		 394 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 383 aa  246  4.9999999999999997e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0103  putative transcriptional regulator, GntR family  37.16 
 
 		 396 aa  246  6e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0233  GntR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 395 aa  246  6.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.511167 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  43.12 
 
 		 377 aa  244  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3867  putative transcriptional regulator, GntR family  37.34 
 
 		 394 aa  241  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2807  aminotransferase, class I and II  43.77 
 
 		 400 aa  240  2e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3951  aminotransferase, class I and II  39.3 
 
 		 421 aa  240  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0704499  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  36.2 
 
 		 463 aa  239  5e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0109  putative transcriptional regulator, GntR family  35.66 
 
 		 396 aa  239  5e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5814  GntR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 400 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6044  aminotransferase, class I and II  36.15 
 
 		 400 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  35.73 
 
 		 397 aa  235  9e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 393 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  34.17 
 
 		 400 aa  232  8.000000000000001e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3369  putative transcriptional regulator, GntR family  42.35 
 
 		 402 aa  232  9e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0184281  normal  0.0139033 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 403 aa  231  2e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 416 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  35.96 
 
 		 397 aa  229  6e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  38.24 
 
 		 398 aa  229  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0902  GntR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 399 aa  228  1e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.215501  normal  0.458926 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  37.92 
 
 		 436 aa  228  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3585  putative transcriptional regulator, GntR family  41.19 
 
 		 410 aa  227  3e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.06961  normal  0.158236 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 393 aa  225  8e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  38.36 
 
 		 393 aa  225  8e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  35.79 
 
 		 439 aa  225  8e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  37.73 
 
 		 398 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  38.36 
 
 		 393 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  37.4 
 
 		 438 aa  223  4e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 393 aa  222  8e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  36.51 
 
 		 441 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  34.76 
 
 		 394 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  39.42 
 
 		 417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  38.62 
 
 		 393 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  37.83 
 
 		 393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  37.83 
 
 		 393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  37.83 
 
 		 393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  38.42 
 
 		 420 aa  220  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  38.36 
 
 		 393 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09460  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  34.51 
 
 		 404 aa  219  3.9999999999999997e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  36.95 
 
 		 396 aa  219  7e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  34.67 
 
 		 386 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  36.95 
 
 		 396 aa  219  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  37.83 
 
 		 398 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  34.91 
 
 		 440 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 413 aa  217  2.9999999999999998e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  30.75 
 
 		 396 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  36.95 
 
 		 406 aa  216  4e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4323  GntR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 397 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  38.54 
 
 		 426 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0105  GntR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5405  putative transcriptional regulator, GntR family  36.03 
 
 		 446 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 426 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  35.94 
 
 		 436 aa  214  1.9999999999999998e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  35.54 
 
 		 430 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 406 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  33.08 
 
 		 433 aa  213  5.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 441 aa  212  7e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  35.28 
 
 		 404 aa  212  9e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  32.04 
 
 		 400 aa  211  1e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  36.41 
 
 		 394 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  34.22 
 
 		 437 aa  210  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  38.36 
 
 		 393 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  38.36 
 
 		 393 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  38.36 
 
 		 393 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0592  putative transcriptional regulator, GntR family  33.68 
 
 		 411 aa  209  5e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  38.36 
 
 		 393 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  38.36 
 
 		 393 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>