90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6495 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6495  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  492  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6845  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  73 
 
 		 241 aa  361  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3493  hypothetical protein  52.05 
 
 		 220 aa  224  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693999  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49040  hypothetical protein  47.62 
 
 		 223 aa  201  9e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4532  hypothetical protein  51.02 
 
 		 220 aa  201  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.427588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3754  hypothetical protein  46.01 
 
 		 214 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1387  hypothetical protein  44.59 
 
 		 219 aa  191  7e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.61444  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2785  hypothetical protein  45.67 
 
 		 217 aa  186  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1909  hypothetical protein  49.21 
 
 		 214 aa  185  6e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1934  hypothetical protein  44.83 
 
 		 223 aa  180  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0135128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0558  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  46.2 
 
 		 208 aa  177  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192313  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1605  hypothetical protein  44.12 
 
 		 217 aa  176  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.578023  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0086  hypothetical protein  44.44 
 
 		 216 aa  169  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000555  predicted flavin-nucleotide-binding protein  40.28 
 
 		 218 aa  169  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2299  hypothetical protein  44.68 
 
 		 210 aa  168  9e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13866  normal  0.499993 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1692  hypothetical protein  45.81 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3120  hypothetical protein  41.94 
 
 		 227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3056  hypothetical protein  46.24 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2303  Uvs039  44.69 
 
 		 239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1397  hypothetical protein  44.69 
 
 		 239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1479  hypothetical protein  44.69 
 
 		 261 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0989  hypothetical protein  44.69 
 
 		 261 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.856623  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1072  hypothetical protein  44.69 
 
 		 261 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0134  hypothetical protein  44.69 
 
 		 261 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0514  hypothetical protein  44.69 
 
 		 261 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3402  hypothetical protein  44.51 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.278918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7671  hypothetical protein  41.18 
 
 		 214 aa  159  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05333  hypothetical protein  38.54 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4187  hypothetical protein  42.47 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.877149  normal  0.040626 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1567  flavin-nucleotide-binding protein-like protein  40.69 
 
 		 292 aa  152  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.612765 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3004  hypothetical protein  42.16 
 
 		 234 aa  150  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1926  hypothetical protein  43.24 
 
 		 219 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3638  flavin-nucleotide-binding protein  38.54 
 
 		 216 aa  148  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.220848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3889  flavin-nucleotide-binding protein  38.54 
 
 		 216 aa  148  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2201  flavin-nucleotide-binding protein  38.74 
 
 		 216 aa  146  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.697368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4542  hypothetical protein  41.26 
 
 		 219 aa  146  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1256  hypothetical protein  42.11 
 
 		 179 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4477  flavin-nucleotide-binding protein  39.89 
 
 		 189 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3467  hypothetical protein  41.87 
 
 		 228 aa  141  8e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0244411  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1192  hypothetical protein  36.72 
 
 		 209 aa  141  9e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0972272  normal  0.237635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5541  hypothetical protein  36.62 
 
 		 220 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.418646 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1550  hypothetical protein  38.05 
 
 		 227 aa  135  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0342013 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5990  hypothetical protein  37.88 
 
 		 215 aa  134  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0647  flavin-nucleotide-binding protein  35.48 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2952  hypothetical protein  33.92 
 
 		 199 aa  118  9e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2966  flavin-nucleotide-binding protein-like  45.86 
 
 		 222 aa  113  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.840561 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0082  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  35.87 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1309  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN- binding  36.17 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.306682  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2142  hypothetical protein  35.47 
 
 		 226 aa  97.1  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.595619  normal  0.0167174 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4367  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  34.24 
 
 		 220 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01781  conserved hypothetical protein  30.05 
 
 		 266 aa  95.9  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0345274 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5287  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  33.75 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5199  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  33.75 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5579  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  33.33 
 
 		 211 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.272111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1617  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  28.12 
 
 		 176 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3154  putative nitroimidazole resistance protein  30.77 
 
 		 154 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1107  putative nitroimidazole resistance protein  27.97 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2615  putative nitroimidazole resistance protein  26.49 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2339  hypothetical protein  25 
 
 		 168 aa  60.5  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0041  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  24.34 
 
 		 152 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295446  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2417  nitroimidazole resistance protein, putative  25.93 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.608683  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1549  antibiotic resistance protein  33.33 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3858  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding protein  23.08 
 
 		 184 aa  54.3  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.788225  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2731  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  29.37 
 
 		 205 aa  54.3  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.560885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0078  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  26.23 
 
 		 158 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2326  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  27.66 
 
 		 156 aa  53.1  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1296  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  26.02 
 
 		 157 aa  52.4  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.474408  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06490  predicted flavin-nucleotide-binding protein  26.42 
 
 		 165 aa  52.4  0.000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00239792  normal  0.449333 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1620  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  23.14 
 
 		 156 aa  52  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1951  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  26.62 
 
 		 182 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000305005  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0350  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  20.33 
 
 		 170 aa  49.7  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.123938  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0759  putative 5-nitroimidazole antibiotic resistance  23.03 
 
 		 161 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.279608  normal  0.302454 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0856  putative cytoplasmic protein  23.03 
 
 		 167 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.141086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0746  putative cytoplasmic protein  23.03 
 
 		 161 aa  48.9  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000242866  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1163  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  26.95 
 
 		 157 aa  48.5  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00783233  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20760  predicted flavin-nucleotide-binding protein  24.19 
 
 		 167 aa  48.5  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2998  nitroimidazole resistance protein, putative  26.58 
 
 		 180 aa  47.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0820  hypothetical protein  22.37 
 
 		 167 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113166  normal  0.11136 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1961  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  21.77 
 
 		 157 aa  47.4  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988174  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1135  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  18.84 
 
 		 152 aa  47.4  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.551955  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1948  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  22.31 
 
 		 157 aa  47  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0449472  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0807  hypothetical protein  21.71 
 
 		 167 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0262203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1007  hypothetical protein  28.42 
 
 		 154 aa  46.2  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.596538 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3004  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding protein  26.32 
 
 		 153 aa  45.8  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  26.83 
 
 		 158 aa  43.9  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1104  nitroimidazole resistance protein, putative  24.85 
 
 		 156 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2063  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  26.98 
 
 		 155 aa  42  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.20286 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1739  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  21.01 
 
 		 163 aa  41.6  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000044515  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0166  flavin-nucleotide-binding protein  22.12 
 
 		 157 aa  41.6  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0526  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  25 
 
 		 153 aa  41.6  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>