68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1256 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1256  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  356  9e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1605  hypothetical protein  72.78 
 
 
217 aa  248  3e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.578023  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7671  hypothetical protein  73.33 
 
 
214 aa  234  7e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42038  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0647  flavin-nucleotide-binding protein  65.52 
 
 
229 aa  213  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5990  hypothetical protein  63.58 
 
 
215 aa  206  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4542  hypothetical protein  63.58 
 
 
219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2785  hypothetical protein  54.65 
 
 
217 aa  188  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1934  hypothetical protein  51.74 
 
 
223 aa  185  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0135128  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5541  hypothetical protein  53.76 
 
 
220 aa  180  9.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.418646 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2142  hypothetical protein  63.01 
 
 
226 aa  178  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.595619  normal  0.0167174 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4532  hypothetical protein  52 
 
 
220 aa  171  5.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.427588  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1567  flavin-nucleotide-binding protein-like protein  50.29 
 
 
292 aa  169  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.612765 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3493  hypothetical protein  48.24 
 
 
220 aa  168  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693999  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3754  hypothetical protein  44.13 
 
 
214 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4187  hypothetical protein  53.94 
 
 
212 aa  166  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.877149  normal  0.040626 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1926  hypothetical protein  50 
 
 
219 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1909  hypothetical protein  46.59 
 
 
214 aa  157  6e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0558  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  47.59 
 
 
208 aa  157  7e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192313  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3467  hypothetical protein  52.05 
 
 
228 aa  155  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0244411  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2303  Uvs039  49.15 
 
 
239 aa  154  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1397  hypothetical protein  49.15 
 
 
239 aa  154  9e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1479  hypothetical protein  49.15 
 
 
261 aa  153  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0514  hypothetical protein  49.15 
 
 
261 aa  153  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0134  hypothetical protein  49.15 
 
 
261 aa  153  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1072  hypothetical protein  49.15 
 
 
261 aa  153  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0989  hypothetical protein  49.15 
 
 
261 aa  153  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.856623  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1692  hypothetical protein  49.15 
 
 
239 aa  151  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3120  hypothetical protein  50.56 
 
 
227 aa  151  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3004  hypothetical protein  51.16 
 
 
234 aa  149  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1387  hypothetical protein  41.18 
 
 
219 aa  149  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.61444  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49040  hypothetical protein  41.52 
 
 
223 aa  147  7e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1550  hypothetical protein  47.75 
 
 
227 aa  147  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0342013 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0086  hypothetical protein  38.55 
 
 
216 aa  145  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6495  hypothetical protein  42.11 
 
 
240 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3889  flavin-nucleotide-binding protein  45.68 
 
 
216 aa  144  9e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282164  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3638  flavin-nucleotide-binding protein  45.68 
 
 
216 aa  144  9e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.220848  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4477  flavin-nucleotide-binding protein  45.68 
 
 
189 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2201  flavin-nucleotide-binding protein  45.68 
 
 
216 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.697368  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6845  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  40.8 
 
 
241 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3056  hypothetical protein  51.66 
 
 
227 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3402  hypothetical protein  49.67 
 
 
227 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.278918 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1309  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN- binding  45.2 
 
 
216 aa  130  7.999999999999999e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.306682  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2299  hypothetical protein  42.68 
 
 
210 aa  127  9.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13866  normal  0.499993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1192  hypothetical protein  36.36 
 
 
209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0972272  normal  0.237635 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000555  predicted flavin-nucleotide-binding protein  41.88 
 
 
218 aa  122  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05333  hypothetical protein  37.91 
 
 
218 aa  118  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2952  hypothetical protein  38.41 
 
 
199 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4367  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  44.17 
 
 
220 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0082  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  42.86 
 
 
210 aa  105  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01781  conserved hypothetical protein  39.46 
 
 
266 aa  99.4  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0345274 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5199  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  41.48 
 
 
211 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5287  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  41.48 
 
 
211 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119354  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5579  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  40.91 
 
 
211 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.272111  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2966  flavin-nucleotide-binding protein-like  42.5 
 
 
222 aa  95.1  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.840561 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3154  putative nitroimidazole resistance protein  34.35 
 
 
154 aa  58.2  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1107  putative nitroimidazole resistance protein  34.35 
 
 
154 aa  57  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1617  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  28.37 
 
 
176 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2731  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  29.93 
 
 
205 aa  54.3  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.560885  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0041  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  24.43 
 
 
152 aa  46.6  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295446  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1407  nitroimidazole resistance protein, putative  24.83 
 
 
178 aa  44.7  0.0007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.460048 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1156  nitroimidazole resistance protein, putative  26.15 
 
 
164 aa  43.9  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3858  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding protein  25 
 
 
184 aa  43.9  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.788225  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3740  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  28.72 
 
 
150 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1135  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  25.49 
 
 
152 aa  42.4  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.551955  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00340  hypothetical protein  32.79 
 
 
277 aa  42.7  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1549  antibiotic resistance protein  27 
 
 
177 aa  42.4  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2615  putative nitroimidazole resistance protein  21.8 
 
 
152 aa  41.6  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0289  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  26.47 
 
 
157 aa  40.8  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>