81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0558 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0558  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  100 
 
 		 208 aa  427  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1192  hypothetical protein  61 
 
 		 209 aa  261  4e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0972272  normal  0.237635 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1934  hypothetical protein  50.73 
 
 		 223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0135128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4187  hypothetical protein  48.78 
 
 		 212 aa  199  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.877149  normal  0.040626 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4532  hypothetical protein  51.3 
 
 		 220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.427588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1909  hypothetical protein  52.13 
 
 		 214 aa  194  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1605  hypothetical protein  49.48 
 
 		 217 aa  187  8e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.578023  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5990  hypothetical protein  46.88 
 
 		 215 aa  178  5.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6495  hypothetical protein  46.2 
 
 		 240 aa  177  9e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2785  hypothetical protein  45.99 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3493  hypothetical protein  46.32 
 
 		 220 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693999  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3754  hypothetical protein  44.06 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7671  hypothetical protein  46.2 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1692  hypothetical protein  45.23 
 
 		 239 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1567  flavin-nucleotide-binding protein-like protein  48.09 
 
 		 292 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.612765 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2299  hypothetical protein  43.41 
 
 		 210 aa  168  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13866  normal  0.499993 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2201  flavin-nucleotide-binding protein  42.16 
 
 		 216 aa  168  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.697368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6845  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  44.02 
 
 		 241 aa  167  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2303  Uvs039  44.72 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1479  hypothetical protein  44.72 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0989  hypothetical protein  44.72 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.856623  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1072  hypothetical protein  44.72 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0134  hypothetical protein  44.72 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0514  hypothetical protein  44.72 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1397  hypothetical protein  44.72 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3638  flavin-nucleotide-binding protein  42.5 
 
 		 216 aa  165  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.220848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3889  flavin-nucleotide-binding protein  42.5 
 
 		 216 aa  165  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49040  hypothetical protein  41.58 
 
 		 223 aa  162  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4542  hypothetical protein  46.6 
 
 		 219 aa  162  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0647  flavin-nucleotide-binding protein  42.51 
 
 		 229 aa  162  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3004  hypothetical protein  44.81 
 
 		 234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3056  hypothetical protein  48.04 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3402  hypothetical protein  47.49 
 
 		 227 aa  159  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.278918 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3120  hypothetical protein  44.22 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1926  hypothetical protein  39.5 
 
 		 219 aa  159  4e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0086  hypothetical protein  42.7 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1256  hypothetical protein  47.59 
 
 		 179 aa  157  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4477  flavin-nucleotide-binding protein  42.54 
 
 		 189 aa  155  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3467  hypothetical protein  43.6 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0244411  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1387  hypothetical protein  40.11 
 
 		 219 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.61444  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05333  hypothetical protein  38.71 
 
 		 218 aa  145  5e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1550  hypothetical protein  41.92 
 
 		 227 aa  144  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0342013 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000555  predicted flavin-nucleotide-binding protein  39.25 
 
 		 218 aa  144  7.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5541  hypothetical protein  34.78 
 
 		 220 aa  142  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.418646 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2952  hypothetical protein  37.08 
 
 		 199 aa  131  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1309  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN- binding  45.57 
 
 		 216 aa  129  3e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.306682  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0082  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  38.74 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2142  hypothetical protein  38.76 
 
 		 226 aa  122  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.595619  normal  0.0167174 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4367  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  39.89 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01781  conserved hypothetical protein  33.04 
 
 		 266 aa  115  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0345274 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5287  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  37.11 
 
 		 211 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5199  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  37.11 
 
 		 211 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2966  flavin-nucleotide-binding protein-like  40.43 
 
 		 222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.840561 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5579  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  37.11 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.272111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2731  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  29.45 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.560885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1617  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  28.35 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0041  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  25.66 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1549  antibiotic resistance protein  28.57 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3858  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding protein  24.1 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.788225  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1806  nitroimidazole resistance protein, putative  22.73 
 
 		 171 aa  49.3  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000286648  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3154  putative nitroimidazole resistance protein  24.48 
 
 		 154 aa  48.9  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0247  LexA DNA-binding domain protein  27.34 
 
 		 233 aa  48.9  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1620  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  26.19 
 
 		 156 aa  48.9  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1951  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  27.56 
 
 		 182 aa  48.5  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000305005  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00340  hypothetical protein  28.03 
 
 		 277 aa  48.1  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1824  hypothetical protein  26.83 
 
 		 176 aa  48.1  0.00009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06490  predicted flavin-nucleotide-binding protein  29.1 
 
 		 165 aa  48.1  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00239792  normal  0.449333 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1104  nitroimidazole resistance protein, putative  29.53 
 
 		 156 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0289  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  25.6 
 
 		 157 aa  47  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1135  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  26.45 
 
 		 152 aa  46.6  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.551955  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0350  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  20.33 
 
 		 170 aa  45.4  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.123938  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20760  predicted flavin-nucleotide-binding protein  24.39 
 
 		 167 aa  45.1  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2339  hypothetical protein  26.83 
 
 		 168 aa  45.1  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1739  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  22.13 
 
 		 163 aa  44.3  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000044515  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2615  putative nitroimidazole resistance protein  22.52 
 
 		 152 aa  44.7  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1107  putative nitroimidazole resistance protein  22.38 
 
 		 154 aa  44.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1007  hypothetical protein  32.29 
 
 		 154 aa  42.4  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.596538 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0526  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  27.42 
 
 		 153 aa  42  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1986  putative nitroimidazole resistance protein  20.59 
 
 		 171 aa  42  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1296  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  23.62 
 
 		 157 aa  41.6  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.474408  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  22.75 
 
 		 158 aa  42  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>