82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7671 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7671  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  428  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42038  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1605  hypothetical protein  68.25 
 
 
217 aa  288  3e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.578023  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1256  hypothetical protein  73.33 
 
 
179 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5990  hypothetical protein  58.49 
 
 
215 aa  233  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0647  flavin-nucleotide-binding protein  60.48 
 
 
229 aa  231  5e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4542  hypothetical protein  61.5 
 
 
219 aa  229  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1934  hypothetical protein  48.36 
 
 
223 aa  222  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0135128  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2785  hypothetical protein  51.17 
 
 
217 aa  221  6e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5541  hypothetical protein  52.58 
 
 
220 aa  214  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.418646 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2142  hypothetical protein  61.54 
 
 
226 aa  203  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.595619  normal  0.0167174 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1926  hypothetical protein  52.04 
 
 
219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4187  hypothetical protein  50.72 
 
 
212 aa  193  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.877149  normal  0.040626 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4532  hypothetical protein  51.55 
 
 
220 aa  191  7e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.427588  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1387  hypothetical protein  42.65 
 
 
219 aa  186  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.61444  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2201  flavin-nucleotide-binding protein  47.62 
 
 
216 aa  186  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.697368  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3638  flavin-nucleotide-binding protein  47.4 
 
 
216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.220848  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3889  flavin-nucleotide-binding protein  47.4 
 
 
216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282164  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49040  hypothetical protein  43.2 
 
 
223 aa  181  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0086  hypothetical protein  40.1 
 
 
216 aa  174  9e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1692  hypothetical protein  49.01 
 
 
239 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3493  hypothetical protein  46.11 
 
 
220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693999  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0558  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  46.2 
 
 
208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192313  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1479  hypothetical protein  47.52 
 
 
261 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0514  hypothetical protein  47.52 
 
 
261 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0134  hypothetical protein  47.52 
 
 
261 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1072  hypothetical protein  47.52 
 
 
261 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0989  hypothetical protein  47.52 
 
 
261 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.856623  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1397  hypothetical protein  47.52 
 
 
239 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2303  Uvs039  47.52 
 
 
239 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3754  hypothetical protein  42.86 
 
 
214 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3467  hypothetical protein  47.55 
 
 
228 aa  170  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0244411  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3120  hypothetical protein  48.72 
 
 
227 aa  170  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1567  flavin-nucleotide-binding protein-like protein  45.59 
 
 
292 aa  169  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.612765 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1909  hypothetical protein  45.1 
 
 
214 aa  170  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3004  hypothetical protein  49.02 
 
 
234 aa  168  6e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3056  hypothetical protein  51.93 
 
 
227 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4477  flavin-nucleotide-binding protein  44.62 
 
 
189 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3402  hypothetical protein  50.83 
 
 
227 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.278918 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6495  hypothetical protein  41.18 
 
 
240 aa  159  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000555  predicted flavin-nucleotide-binding protein  41.54 
 
 
218 aa  158  5e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6845  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  40.3 
 
 
241 aa  153  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1192  hypothetical protein  36.5 
 
 
209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0972272  normal  0.237635 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05333  hypothetical protein  40 
 
 
218 aa  152  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1550  hypothetical protein  43.46 
 
 
227 aa  152  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0342013 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2299  hypothetical protein  42.19 
 
 
210 aa  149  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13866  normal  0.499993 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2952  hypothetical protein  37.7 
 
 
199 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4367  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  42.36 
 
 
220 aa  136  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1309  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN- binding  41.81 
 
 
216 aa  124  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.306682  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5579  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  39.8 
 
 
211 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.272111  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5287  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  39.8 
 
 
211 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119354  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5199  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  39.8 
 
 
211 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2966  flavin-nucleotide-binding protein-like  40 
 
 
222 aa  106  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.840561 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01781  conserved hypothetical protein  29.86 
 
 
266 aa  97.1  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0345274 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0082  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  35.94 
 
 
210 aa  96.7  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1617  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  28.8 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1107  putative nitroimidazole resistance protein  33.56 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3154  putative nitroimidazole resistance protein  31.72 
 
 
154 aa  62.4  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0041  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  25.17 
 
 
152 aa  55.8  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295446  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2615  putative nitroimidazole resistance protein  25.64 
 
 
152 aa  55.5  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00340  hypothetical protein  31.33 
 
 
277 aa  54.3  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1549  antibiotic resistance protein  28.36 
 
 
177 aa  53.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1739  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  26.11 
 
 
163 aa  52  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000044515  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1951  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  24.07 
 
 
182 aa  51.6  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000305005  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2731  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  31.41 
 
 
205 aa  51.2  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.560885  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0166  flavin-nucleotide-binding protein  22.13 
 
 
157 aa  50.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0078  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  26.09 
 
 
158 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1135  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  26.36 
 
 
152 aa  48.5  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.551955  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0289  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  26.83 
 
 
157 aa  47.8  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3004  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding protein  27.4 
 
 
153 aa  45.4  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0856  putative cytoplasmic protein  26.24 
 
 
167 aa  45.1  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.141086  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0759  putative 5-nitroimidazole antibiotic resistance  26.24 
 
 
161 aa  45.1  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.279608  normal  0.302454 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06490  predicted flavin-nucleotide-binding protein  26.05 
 
 
165 aa  44.3  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00239792  normal  0.449333 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1948  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  24.19 
 
 
157 aa  44.3  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0449472  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2998  nitroimidazole resistance protein, putative  27.17 
 
 
180 aa  43.5  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0807  hypothetical protein  26.87 
 
 
167 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0262203  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0820  hypothetical protein  25.53 
 
 
167 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113166  normal  0.11136 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0219  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  20.16 
 
 
157 aa  43.5  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0746  putative cytoplasmic protein  25.53 
 
 
161 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000242866  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2339  hypothetical protein  22.75 
 
 
168 aa  42  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1163  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  26.39 
 
 
157 aa  41.6  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00783233  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1104  nitroimidazole resistance protein, putative  24.39 
 
 
156 aa  41.6  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1156  nitroimidazole resistance protein, putative  26.58 
 
 
164 aa  41.2  0.01  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>