85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2998 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2998  nitroimidazole resistance protein, putative  100 
 
 		 180 aa  367  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1163  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  42.86 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00783233  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1106  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  32.16 
 
 		 216 aa  108  3e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3004  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding protein  38.57 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0078  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  37.75 
 
 		 158 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1948  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  35.71 
 
 		 157 aa  102  4e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0449472  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1961  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  33.57 
 
 		 157 aa  101  5e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988174  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1296  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  30.71 
 
 		 157 aa  94  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.474408  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2339  hypothetical protein  30.95 
 
 		 168 aa  89.7  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0166  flavin-nucleotide-binding protein  31.82 
 
 		 157 aa  88.6  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2326  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  30.71 
 
 		 156 aa  87.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1617  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  35.29 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0526  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  38.06 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2615  putative nitroimidazole resistance protein  32.26 
 
 		 152 aa  80.1  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1007  hypothetical protein  31.94 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.596538 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0289  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  30.72 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0247  LexA DNA-binding domain protein  35.48 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1951  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  39.2 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000305005  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0041  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  32.05 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1739  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  32.91 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000044515  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0350  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  27.89 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.123938  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0219  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  27.39 
 
 		 157 aa  72  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1104  nitroimidazole resistance protein, putative  27.04 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1227  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  34.13 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0424349 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3154  putative nitroimidazole resistance protein  33.58 
 
 		 154 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1107  putative nitroimidazole resistance protein  33.33 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0807  hypothetical protein  29.81 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0262203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0820  hypothetical protein  29.81 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113166  normal  0.11136 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2417  nitroimidazole resistance protein, putative  31.21 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.608683  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0856  putative cytoplasmic protein  29.81 
 
 		 167 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.141086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0759  putative 5-nitroimidazole antibiotic resistance  29.81 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.279608  normal  0.302454 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0746  putative cytoplasmic protein  29.19 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000242866  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  29.22 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1549  antibiotic resistance protein  32.03 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1135  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  28.03 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.551955  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0322  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  29.37 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346639  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1620  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  30.22 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3517  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  33.54 
 
 		 154 aa  63.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0426327  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1953  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  31.65 
 
 		 163 aa  62  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.406915  normal  0.0305712 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06490  predicted flavin-nucleotide-binding protein  30.13 
 
 		 165 aa  60.8  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00239792  normal  0.449333 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0087  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  32.48 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2731  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  33.56 
 
 		 205 aa  57  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.560885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3868  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  27.39 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1949  GCN5-related N-acetyltransferase  33.59 
 
 		 361 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.494681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0006  hypothetical protein  28.79 
 
 		 151 aa  51.6  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0096  flavin-nucleotide-binding protein  21.43 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000283829  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6845  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  26.74 
 
 		 241 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0086  hypothetical protein  26.63 
 
 		 216 aa  48.5  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3858  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding protein  29.22 
 
 		 184 aa  48.1  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.788225  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1387  hypothetical protein  25.86 
 
 		 219 aa  47.8  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.61444  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2785  hypothetical protein  23.66 
 
 		 217 aa  47.8  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6495  hypothetical protein  26.58 
 
 		 240 aa  47.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2082  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding protein  33.87 
 
 		 155 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.510158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1385  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  31.86 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2952  hypothetical protein  27.78 
 
 		 199 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2201  flavin-nucleotide-binding protein  34.88 
 
 		 216 aa  45.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.697368  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49040  hypothetical protein  24.71 
 
 		 223 aa  45.8  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1372  hypothetical protein  25.48 
 
 		 144 aa  45.8  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.823726  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20760  predicted flavin-nucleotide-binding protein  25.32 
 
 		 167 aa  45.1  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1947  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  32.26 
 
 		 155 aa  45.4  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000031905  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4532  hypothetical protein  25.7 
 
 		 220 aa  44.7  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.427588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2360  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  31.15 
 
 		 150 aa  44.3  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.233006 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4187  hypothetical protein  29.29 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.877149  normal  0.040626 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4000  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  27.59 
 
 		 150 aa  43.9  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.166717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1156  nitroimidazole resistance protein, putative  28.57 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5702  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  25.22 
 
 		 150 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.884169  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0060  GCN5-related N-acetyltransferase  29.88 
 
 		 361 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.461775  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1962  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  23.93 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.181208  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0471  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  27.97 
 
 		 142 aa  43.1  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0514663  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1934  hypothetical protein  25.58 
 
 		 223 aa  43.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0135128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7671  hypothetical protein  27.17 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1328  hypothetical protein  24.84 
 
 		 144 aa  43.5  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0353  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  30.34 
 
 		 135 aa  43.5  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.934539  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2141  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  25.57 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2436  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  30.56 
 
 		 150 aa  42.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000271809  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1407  nitroimidazole resistance protein, putative  24.34 
 
 		 178 aa  42.7  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.460048 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1362  flavin-nucleotide-binding protein  29.41 
 
 		 199 aa  42.4  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0048  GCN5-related N-acetyltransferase  32.17 
 
 		 359 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0243  FMN-binding negative transcriptional regulator  26.16 
 
 		 209 aa  42.4  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3889  flavin-nucleotide-binding protein  31.87 
 
 		 216 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3638  flavin-nucleotide-binding protein  31.87 
 
 		 216 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.220848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4477  flavin-nucleotide-binding protein  31.87 
 
 		 189 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0372  hypothetical protein  41.27 
 
 		 135 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.396466  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04380  predicted flavin-nucleotide-binding protein  29.93 
 
 		 174 aa  41.2  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01781  conserved hypothetical protein  23.84 
 
 		 266 aa  40.8  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0345274 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>