66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2417 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2417  nitroimidazole resistance protein, putative  100 
 
 		 158 aa  325  2.0000000000000001e-88  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.608683  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1953  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  39.1 
 
 		 163 aa  124  4.0000000000000003e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.406915  normal  0.0305712 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0219  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  37.91 
 
 		 157 aa  117  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0820  hypothetical protein  34.42 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113166  normal  0.11136 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0856  putative cytoplasmic protein  34.42 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.141086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0746  putative cytoplasmic protein  34.42 
 
 		 161 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000242866  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0759  putative 5-nitroimidazole antibiotic resistance  34.42 
 
 		 161 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.279608  normal  0.302454 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0807  hypothetical protein  34.42 
 
 		 167 aa  100  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0262203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1617  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  35.06 
 
 		 176 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0166  flavin-nucleotide-binding protein  32.68 
 
 		 157 aa  98.2  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2339  hypothetical protein  35.48 
 
 		 168 aa  97.1  8e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1135  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  33.1 
 
 		 152 aa  95.1  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.551955  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3868  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  37.58 
 
 		 153 aa  94  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1362  flavin-nucleotide-binding protein  35.54 
 
 		 199 aa  92  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0289  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  32.03 
 
 		 157 aa  91.3  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2615  putative nitroimidazole resistance protein  31.37 
 
 		 152 aa  90.1  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1104  nitroimidazole resistance protein, putative  32.28 
 
 		 156 aa  85.5  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0041  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  30.07 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3154  putative nitroimidazole resistance protein  28.97 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1107  putative nitroimidazole resistance protein  28.28 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3191  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  43.59 
 
 		 77 aa  69.3  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1948  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  32.67 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0449472  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2998  nitroimidazole resistance protein, putative  31.21 
 
 		 180 aa  67.8  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1620  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  29.19 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1961  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  29.33 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988174  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1951  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  34.38 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000305005  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6845  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  26.99 
 
 		 241 aa  60.8  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1296  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  30.34 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.474408  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2063  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  29.27 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.20286 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1163  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  28.21 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00783233  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6495  hypothetical protein  25.93 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0526  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  28.03 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1549  antibiotic resistance protein  29.27 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1739  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  31.25 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000044515  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1227  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  29.27 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0424349 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2326  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  29.17 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1106  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  32.76 
 
 		 216 aa  52.8  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1385  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  21.23 
 
 		 153 aa  51.6  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0247  LexA DNA-binding domain protein  28.57 
 
 		 233 aa  50.8  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  27.95 
 
 		 158 aa  50.4  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0720  flavin-nucleotide-binding protein-like protein  28.4 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.5612  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2785  hypothetical protein  27.95 
 
 		 217 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3517  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  27.95 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0426327  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2141  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  23.78 
 
 		 171 aa  48.1  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0350  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  30.89 
 
 		 170 aa  47.4  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.123938  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0078  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  27.27 
 
 		 158 aa  47.8  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1934  hypothetical protein  25.22 
 
 		 223 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0135128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3858  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding protein  25.93 
 
 		 184 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.788225  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5990  hypothetical protein  23.97 
 
 		 215 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4532  hypothetical protein  26.45 
 
 		 220 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.427588  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1605  hypothetical protein  25.53 
 
 		 217 aa  45.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.578023  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4542  hypothetical protein  23.74 
 
 		 219 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0322  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  23.64 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346639  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0097  hypothetical protein  33.85 
 
 		 158 aa  43.9  0.0009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.578349  hitchhiker  0.00635148 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06490  predicted flavin-nucleotide-binding protein  25.47 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00239792  normal  0.449333 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0471  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  27.69 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0514663  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0647  flavin-nucleotide-binding protein  22.13 
 
 		 229 aa  43.9  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3004  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding protein  25.81 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1007  hypothetical protein  27.36 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.596538 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0087  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  23.12 
 
 		 154 aa  42.4  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20760  predicted flavin-nucleotide-binding protein  26.11 
 
 		 167 aa  42  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3467  hypothetical protein  23.42 
 
 		 228 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0244411  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1926  hypothetical protein  27.33 
 
 		 219 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1407  nitroimidazole resistance protein, putative  22.47 
 
 		 178 aa  42  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.460048 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0657  hypothetical protein  34.43 
 
 		 160 aa  40.4  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.52348  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1429  hypothetical protein  29.91 
 
 		 184 aa  40.4  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>