77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1181 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  100 
 
 		 158 aa  320  3e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1620  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  70.59 
 
 		 156 aa  223  1e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0247  LexA DNA-binding domain protein  47.33 
 
 		 233 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3517  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  42 
 
 		 154 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0426327  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1739  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  36.36 
 
 		 163 aa  103  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000044515  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1227  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  39.86 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0424349 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0526  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  34.67 
 
 		 153 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0087  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  40.4 
 
 		 154 aa  99  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20760  predicted flavin-nucleotide-binding protein  37.42 
 
 		 167 aa  95.5  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2141  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  34.39 
 
 		 171 aa  92  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0350  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  36.18 
 
 		 170 aa  90.9  6e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.123938  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2731  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  35.26 
 
 		 205 aa  89.7  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.560885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1007  hypothetical protein  38.41 
 
 		 154 aa  87  9e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.596538 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2615  putative nitroimidazole resistance protein  33.11 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1951  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  35.44 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000305005  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0078  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  34.67 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1407  nitroimidazole resistance protein, putative  29.65 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.460048 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0289  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  32.68 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06490  predicted flavin-nucleotide-binding protein  33.55 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00239792  normal  0.449333 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1163  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  34.87 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00783233  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0166  flavin-nucleotide-binding protein  33.55 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1296  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  34.62 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.474408  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1104  nitroimidazole resistance protein, putative  29.94 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1948  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  33.33 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0449472  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1617  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  31.58 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0322  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  35.04 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346639  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1107  putative nitroimidazole resistance protein  32.88 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1549  antibiotic resistance protein  34.17 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2326  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  33.77 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2998  nitroimidazole resistance protein, putative  29.22 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1135  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  33.58 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.551955  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1961  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  30.77 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988174  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0041  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  38.53 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3004  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding protein  30.87 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1156  nitroimidazole resistance protein, putative  32.73 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0096  flavin-nucleotide-binding protein  32.3 
 
 		 195 aa  63.9  0.0000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000283829  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1986  putative nitroimidazole resistance protein  28.57 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3154  putative nitroimidazole resistance protein  30.14 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2063  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  25.32 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.20286 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1953  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  26.45 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.406915  normal  0.0305712 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1824  hypothetical protein  32.59 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3858  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding protein  27.54 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.788225  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0823  putative nitroimidazole resistance protein  32.12 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0109955  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0471  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  32.65 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0514663  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1806  nitroimidazole resistance protein, putative  29.59 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000286648  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1106  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  34.45 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2339  hypothetical protein  32.45 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2417  nitroimidazole resistance protein, putative  27.95 
 
 		 158 aa  50.4  0.000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.608683  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0082  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  29.41 
 
 		 210 aa  50.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3868  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  26.62 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3548  hypothetical protein  30.19 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.232443 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3740  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  22.92 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1385  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  23.89 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2448  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  29.45 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292837  normal  0.0448667 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0856  putative cytoplasmic protein  25.97 
 
 		 167 aa  48.5  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.141086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0820  hypothetical protein  25.97 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113166  normal  0.11136 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0759  putative 5-nitroimidazole antibiotic resistance  25.97 
 
 		 161 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.279608  normal  0.302454 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3191  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  36.11 
 
 		 77 aa  48.1  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0746  putative cytoplasmic protein  25.32 
 
 		 161 aa  47.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000242866  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2051  hypothetical protein  27.72 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0320963  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0807  hypothetical protein  24.68 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0262203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0982  hypothetical protein  28.46 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00175108 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5121  Transcriptional regulator-like protein  24.63 
 
 		 215 aa  44.3  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6495  hypothetical protein  26.83 
 
 		 240 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6845  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  22.58 
 
 		 241 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0219  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  26.98 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5579  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  24.8 
 
 		 211 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.272111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5199  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  24.8 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2086  hypothetical protein  40.54 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.58745 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2785  hypothetical protein  26.83 
 
 		 217 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5287  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  24.8 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1192  hypothetical protein  29.51 
 
 		 209 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0972272  normal  0.237635 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6269  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  26.37 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.341844  normal  0.0782266 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0558  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  22.75 
 
 		 208 aa  42  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2456  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  25 
 
 		 171 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  0.600278 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4880  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  32.58 
 
 		 148 aa  40.8  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.746169 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0850  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  31.88 
 
 		 155 aa  40.8  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.119424  normal  0.155123 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>