62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1104 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1104  nitroimidazole resistance protein, putative  100 
 
 		 156 aa  326  6e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0526  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  30.97 
 
 		 153 aa  86.3  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2417  nitroimidazole resistance protein, putative  32.28 
 
 		 158 aa  85.5  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.608683  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0041  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  31.37 
 
 		 152 aa  83.6  9e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0166  flavin-nucleotide-binding protein  26.14 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0289  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  28.95 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  29.94 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0247  LexA DNA-binding domain protein  32.28 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2998  nitroimidazole resistance protein, putative  27.04 
 
 		 180 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1620  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  26.75 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1135  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  24.31 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.551955  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3154  putative nitroimidazole resistance protein  27.34 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1951  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  32.53 
 
 		 182 aa  67.4  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000305005  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1107  putative nitroimidazole resistance protein  28.47 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1227  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  33.33 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0424349 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1739  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  26.45 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000044515  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1953  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  24.84 
 
 		 163 aa  64.3  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.406915  normal  0.0305712 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1617  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  29.68 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1407  nitroimidazole resistance protein, putative  24.71 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.460048 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2141  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  29.93 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2615  putative nitroimidazole resistance protein  28.03 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20760  predicted flavin-nucleotide-binding protein  30.17 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1948  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  26.35 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0449472  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0746  putative cytoplasmic protein  27.16 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000242866  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0759  putative 5-nitroimidazole antibiotic resistance  27.16 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.279608  normal  0.302454 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2731  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  30.49 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.560885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2063  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  26.8 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.20286 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0807  hypothetical protein  27.16 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0262203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0856  putative cytoplasmic protein  26.54 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.141086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2339  hypothetical protein  26.4 
 
 		 168 aa  57  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0820  hypothetical protein  25.93 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113166  normal  0.11136 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1106  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  25.62 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1961  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  25.68 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988174  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0350  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  21.52 
 
 		 170 aa  53.9  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.123938  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2326  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  24.83 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3517  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  29.84 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0426327  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0096  flavin-nucleotide-binding protein  29 
 
 		 195 aa  52  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000283829  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1549  antibiotic resistance protein  31.4 
 
 		 177 aa  51.2  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1362  flavin-nucleotide-binding protein  31.98 
 
 		 199 aa  51.2  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3191  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  36.99 
 
 		 77 aa  50.8  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0087  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  27.5 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1824  hypothetical protein  25.19 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1296  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  22.73 
 
 		 157 aa  48.5  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.474408  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0322  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  21.3 
 
 		 159 aa  47.8  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346639  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0558  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  29.53 
 
 		 208 aa  47.8  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1926  hypothetical protein  25.88 
 
 		 219 aa  45.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3868  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  22.78 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1806  nitroimidazole resistance protein, putative  23.7 
 
 		 171 aa  45.4  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000286648  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1986  putative nitroimidazole resistance protein  18.98 
 
 		 171 aa  44.3  0.0006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6845  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  29.03 
 
 		 241 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1385  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  25.69 
 
 		 153 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3909  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding protein  31.15 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.748529  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1007  hypothetical protein  20.87 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.596538 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6495  hypothetical protein  24.85 
 
 		 240 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1156  nitroimidazole resistance protein, putative  24.24 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5541  hypothetical protein  22.64 
 
 		 220 aa  42.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.418646 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0078  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  21.26 
 
 		 158 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5990  hypothetical protein  22.78 
 
 		 215 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7671  hypothetical protein  24.39 
 
 		 214 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42038  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1605  hypothetical protein  27.15 
 
 		 217 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.578023  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1567  flavin-nucleotide-binding protein-like protein  24.14 
 
 		 292 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.612765 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3000  hypothetical protein  25.86 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.225555  decreased coverage  0.000458503 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>