More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0247 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0247  LexA DNA-binding domain protein  100 
 
 		 233 aa  482  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3517  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  54.3 
 
 		 154 aa  164  8e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0426327  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0087  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  50.99 
 
 		 154 aa  154  9e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1227  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  46.36 
 
 		 160 aa  144  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0424349 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  47.33 
 
 		 158 aa  132  6e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1620  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  39.35 
 
 		 156 aa  114  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0192  SOS-response transcriptional repressor, LexA  64.94 
 
 		 200 aa  105  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1739  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  34.46 
 
 		 163 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000044515  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2731  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  41.03 
 
 		 205 aa  98.6  8e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.560885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2141  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  35.48 
 
 		 171 aa  97.8  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0322  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  36.64 
 
 		 159 aa  94  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346639  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0350  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  35.33 
 
 		 170 aa  89.7  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.123938  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1407  nitroimidazole resistance protein, putative  32.56 
 
 		 178 aa  89.4  4e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.460048 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20760  predicted flavin-nucleotide-binding protein  32.65 
 
 		 167 aa  85.9  6e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1142  SOS-response transcriptional repressor, LexA  49.37 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00201645  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1572  SOS-response transcriptional repressor, LexA  48.15 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0078  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  32.47 
 
 		 158 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2998  nitroimidazole resistance protein, putative  35.48 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0041  LexA repressor  48.72 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1758  transcriptional repressor, LexA family  50.63 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000113097  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1439  SOS-response transcriptional repressor, LexA  48.72 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2490  SOS-response transcriptional repressor, LexA  50.63 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2446  transcriptional repressor, LexA family  45.35 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.575713 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1824  hypothetical protein  31.55 
 
 		 176 aa  74.7  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1617  LexA repressor  52.11 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1104  nitroimidazole resistance protein, putative  32.28 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2805  transcriptional repressor, LexA family  47.76 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000318976  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1986  putative nitroimidazole resistance protein  29.17 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1232  transcriptional repressor, LexA family  44.59 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1237  LexA family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06490  predicted flavin-nucleotide-binding protein  28.76 
 
 		 165 aa  67.8  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00239792  normal  0.449333 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1156  nitroimidazole resistance protein, putative  30.3 
 
 		 164 aa  67  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1611  SOS-response transcriptional repressor, LexA  51.52 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000160494  unclonable  3.1983e-16 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1184  SOS-response transcriptional repressor, LexA  47.83 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1304  LexA repressor  46.67 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1806  nitroimidazole resistance protein, putative  27.98 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000286648  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1211  LexA repressor  50 
 
 		 215 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272184  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2012  LexA repressor  50 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0805  LexA repressor  50 
 
 		 215 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1617  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  31.37 
 
 		 176 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2481  LexA repressor  50 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147016  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1845  LexA repressor  50 
 
 		 215 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1240  LexA repressor  47.22 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0593225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1699  LexA repressor  50 
 
 		 215 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.465061  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1859  LexA repressor  50 
 
 		 215 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349783  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0356  LexA repressor  50 
 
 		 215 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0456826  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2148  transcriptional repressor, LexA family  42.11 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1163  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  30.97 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00783233  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1107  putative nitroimidazole resistance protein  33.6 
 
 		 154 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1637  LexA repressor  46.75 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07410  SOS-response transcriptional repressor, LexA  44.74 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000224442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0151  LexA family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.464426  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3004  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding protein  31.54 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2104  SOS-response transcriptional repressor, LexA  45.07 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.788745  normal  0.0179142 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2238  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.11 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.778697  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1701  SOS-response transcriptional repressor, LexA  45.71 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1901  SOS-response transcriptional repressor, LexA  47.06 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4738  LexA repressor  48.53 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0483588  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1496  LexA repressor  48.53 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1516  LexA repressor  48.53 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.984097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1207  transcriptional repressor, LexA family  40 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000325213  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4471  transcriptional repressor, LexA family  32.52 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1120  LexA repressor  48.53 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1577  LexA repressor  48.53 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1600  LexA repressor  48.53 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0581  LexA repressor  46.55 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.640194  normal  0.502915 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1179  LexA repressor  45.83 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.865174  normal  0.239395 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0793  SOS-response transcriptional repressor, LexA  43.28 
 
 		 198 aa  62  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2008  LexA repressor  37.62 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196928  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3872  LexA repressor  46.97 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.315226  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2152  LexA repressor  46.97 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1587  LexA repressor  46.97 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.477026 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25160  LexA repressor  46.97 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2243  LexA repressor  38.96 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2440  transcriptional repressor, LexA family  44.12 
 
 		 70 aa  60.5  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000254374  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2167  LexA repressor  43.04 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3510  LexA repressor  46.97 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.9651  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3283  LexA repressor  46.97 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1483  SOS-response transcriptional repressor, LexA  43.42 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.639619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1735  LexA family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1296  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  29.49 
 
 		 157 aa  60.8  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.474408  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1662  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.31 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2143  LexA repressor  45.45 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0821224 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1683  LexA repressor  45.45 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.141699  normal  0.177644 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1659  LexA repressor  45.45 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1384  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.67 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0425171  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3599  LexA repressor  45.45 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0155169  normal  0.533875 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1630  LexA repressor  44.16 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1981  LexA repressor  45.59 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0274768 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1772  LexA repressor  45.71 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2117  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.86 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.357832  hitchhiker  0.000000326173 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2471  LexA repressor  45.71 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305758  normal  0.643159 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3398  LexA repressor  44.3 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1522  LexA repressor  39.02 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0737181  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0166  flavin-nucleotide-binding protein  32.24 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2070  SOS-response transcriptional repressor, LexA  46.27 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3524  LexA repressor  44.3 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1640  LexA repressor  39.02 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0943463  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4631  LexA repressor  43.59 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.381765 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1409  LexA family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0567372  decreased coverage  0.00000225039 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>