113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0166 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0166  flavin-nucleotide-binding protein  100 
 
 
157 aa  324  3e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0041  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  44.97 
 
 
152 aa  143  7.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295446  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0219  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  39.47 
 
 
157 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0289  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  38.41 
 
 
157 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0759  putative 5-nitroimidazole antibiotic resistance  37.01 
 
 
161 aa  114  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.279608  normal  0.302454 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2615  putative nitroimidazole resistance protein  34.23 
 
 
152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0856  putative cytoplasmic protein  37.01 
 
 
167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.141086  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0807  hypothetical protein  37.01 
 
 
167 aa  111  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0262203  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0820  hypothetical protein  36.36 
 
 
167 aa  110  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113166  normal  0.11136 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0746  putative cytoplasmic protein  36.36 
 
 
161 aa  110  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000242866  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3154  putative nitroimidazole resistance protein  37.5 
 
 
154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1617  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  33.78 
 
 
176 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1135  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  33.57 
 
 
152 aa  103  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.551955  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1107  putative nitroimidazole resistance protein  35.56 
 
 
154 aa  101  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1953  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  35.53 
 
 
163 aa  100  6e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.406915  normal  0.0305712 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2417  nitroimidazole resistance protein, putative  32.68 
 
 
158 aa  98.2  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.608683  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1385  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  33.77 
 
 
153 aa  90.1  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1951  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  35 
 
 
182 aa  90.1  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000305005  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2998  nitroimidazole resistance protein, putative  31.82 
 
 
180 aa  88.6  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2326  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  34.44 
 
 
156 aa  86.3  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2339  hypothetical protein  36.36 
 
 
168 aa  85.5  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3191  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  48.57 
 
 
77 aa  83.2  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1296  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  32.05 
 
 
157 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.474408  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1549  antibiotic resistance protein  29.37 
 
 
177 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1961  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  28.29 
 
 
157 aa  77.4  0.00000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988174  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1948  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  26.97 
 
 
157 aa  77  0.00000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0449472  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1104  nitroimidazole resistance protein, putative  26.14 
 
 
156 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1362  flavin-nucleotide-binding protein  29.81 
 
 
199 aa  77  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0078  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  30.94 
 
 
158 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  33.55 
 
 
158 aa  74.7  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1739  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  31.41 
 
 
163 aa  72.8  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000044515  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5179  putative flavin-nucleotide-binding protein  27.81 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3868  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  30.72 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0471  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  31.25 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0514663  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1163  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  29.08 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00783233  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1007  hypothetical protein  31.72 
 
 
154 aa  70.9  0.000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.596538 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0322  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  31.25 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346639  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1620  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  32.79 
 
 
156 aa  70.5  0.000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2063  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  25.97 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.20286 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1227  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  29.87 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0424349 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2785  hypothetical protein  28.87 
 
 
217 aa  65.5  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3004  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding protein  28.67 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0526  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  27.92 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1106  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  29.75 
 
 
216 aa  60.8  0.000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20760  predicted flavin-nucleotide-binding protein  30.26 
 
 
167 aa  60.8  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1934  hypothetical protein  26.55 
 
 
223 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0135128  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0350  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  27.95 
 
 
170 aa  59.3  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.123938  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0096  flavin-nucleotide-binding protein  30.08 
 
 
195 aa  58.9  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000283829  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6269  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  26.62 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.341844  normal  0.0782266 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0247  LexA DNA-binding domain protein  32.24 
 
 
233 aa  58.9  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3740  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  24.68 
 
 
150 aa  57.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0087  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  31.82 
 
 
154 aa  57.8  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1387  hypothetical protein  27.78 
 
 
219 aa  57.4  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.61444  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0720  flavin-nucleotide-binding protein-like protein  35.71 
 
 
124 aa  57.4  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.5612  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0657  hypothetical protein  30 
 
 
160 aa  57  0.00000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.52348  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4532  hypothetical protein  23.74 
 
 
220 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.427588  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4880  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  31.25 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.746169 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06490  predicted flavin-nucleotide-binding protein  28.57 
 
 
165 aa  55.8  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00239792  normal  0.449333 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2966  flavin-nucleotide-binding protein-like  25.17 
 
 
222 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.840561 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0097  hypothetical protein  28.81 
 
 
158 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.578349  hitchhiker  0.00635148 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3517  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  28.57 
 
 
154 aa  53.9  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0426327  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04380  predicted flavin-nucleotide-binding protein  28.99 
 
 
174 aa  52.4  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5990  hypothetical protein  20.61 
 
 
215 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4477  flavin-nucleotide-binding protein  24.75 
 
 
189 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3889  flavin-nucleotide-binding protein  24.75 
 
 
216 aa  52.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282164  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3638  flavin-nucleotide-binding protein  24.75 
 
 
216 aa  52.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.220848  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0412  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  41.27 
 
 
158 aa  50.8  0.000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0738895  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7671  hypothetical protein  22.13 
 
 
214 aa  50.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42038  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1137  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  39.68 
 
 
158 aa  50.4  0.000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.329696  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1794  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  39.68 
 
 
158 aa  50.4  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.109434  unclonable  0.00000000507783 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49040  hypothetical protein  27.93 
 
 
223 aa  50.8  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1820  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  23.65 
 
 
144 aa  50.4  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1372  hypothetical protein  25.68 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.823726  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1407  nitroimidazole resistance protein, putative  26.01 
 
 
178 aa  49.3  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.460048 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6845  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  24.37 
 
 
241 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05333  hypothetical protein  24.83 
 
 
218 aa  48.1  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0035  hypothetical protein  31.15 
 
 
159 aa  47.8  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0647  flavin-nucleotide-binding protein  19.67 
 
 
229 aa  47.8  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000555  predicted flavin-nucleotide-binding protein  25.23 
 
 
218 aa  47.8  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1328  hypothetical protein  25 
 
 
144 aa  47.4  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3858  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding protein  28 
 
 
184 aa  47.4  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.788225  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5541  hypothetical protein  21.8 
 
 
220 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.418646 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2299  hypothetical protein  26.85 
 
 
210 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13866  normal  0.499993 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2995  hypothetical protein  30.65 
 
 
165 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2284  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  32.22 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.145472  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0086  hypothetical protein  25.47 
 
 
216 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3909  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding protein  29.21 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.748529  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4187  hypothetical protein  24.65 
 
 
212 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.877149  normal  0.040626 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1926  hypothetical protein  25.17 
 
 
219 aa  45.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3467  hypothetical protein  25.66 
 
 
228 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0244411  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0066  hypothetical protein  26.67 
 
 
158 aa  45.1  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.905175  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2201  flavin-nucleotide-binding protein  20.69 
 
 
216 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.697368  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3754  hypothetical protein  22.7 
 
 
214 aa  44.3  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1397  hypothetical protein  21.19 
 
 
239 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2303  Uvs039  21.19 
 
 
239 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3402  hypothetical protein  23.53 
 
 
227 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.278918 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1072  hypothetical protein  21.19 
 
 
261 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0989  hypothetical protein  21.19 
 
 
261 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.856623  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1479  hypothetical protein  21.19 
 
 
261 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1605  hypothetical protein  21.05 
 
 
217 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.578023  normal  0.364276 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>