76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2299 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2299  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  426  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13866  normal  0.499993 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3056  hypothetical protein  56.15 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3402  hypothetical protein  55.08 
 
 		 227 aa  203  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.278918 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3120  hypothetical protein  50.24 
 
 		 227 aa  197  7e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2303  Uvs039  51.28 
 
 		 239 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1397  hypothetical protein  51.28 
 
 		 239 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1692  hypothetical protein  52.97 
 
 		 239 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0134  hypothetical protein  51.28 
 
 		 261 aa  194  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0514  hypothetical protein  51.28 
 
 		 261 aa  194  6e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1072  hypothetical protein  51.28 
 
 		 261 aa  194  6e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0989  hypothetical protein  51.28 
 
 		 261 aa  194  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.856623  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1479  hypothetical protein  51.28 
 
 		 261 aa  194  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2785  hypothetical protein  50.8 
 
 		 217 aa  182  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1934  hypothetical protein  47.45 
 
 		 223 aa  181  6e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0135128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4532  hypothetical protein  50.51 
 
 		 220 aa  181  6e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.427588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000555  predicted flavin-nucleotide-binding protein  45.26 
 
 		 218 aa  171  5e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0558  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  43.41 
 
 		 208 aa  168  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6495  hypothetical protein  44.68 
 
 		 240 aa  168  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05333  hypothetical protein  44.21 
 
 		 218 aa  167  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1909  hypothetical protein  47 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1550  hypothetical protein  48.04 
 
 		 227 aa  162  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0342013 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1926  hypothetical protein  46.11 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3638  flavin-nucleotide-binding protein  40 
 
 		 216 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.220848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3889  flavin-nucleotide-binding protein  40 
 
 		 216 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3493  hypothetical protein  44.83 
 
 		 220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693999  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5990  hypothetical protein  43.23 
 
 		 215 aa  154  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6845  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  42.7 
 
 		 241 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4187  hypothetical protein  40.82 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.877149  normal  0.040626 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4542  hypothetical protein  47.12 
 
 		 219 aa  152  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49040  hypothetical protein  42.86 
 
 		 223 aa  151  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4477  flavin-nucleotide-binding protein  42.11 
 
 		 189 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2201  flavin-nucleotide-binding protein  41.05 
 
 		 216 aa  150  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.697368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7671  hypothetical protein  42.19 
 
 		 214 aa  149  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1387  hypothetical protein  42.78 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.61444  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1605  hypothetical protein  43.01 
 
 		 217 aa  147  9e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.578023  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3754  hypothetical protein  41 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0086  hypothetical protein  37.95 
 
 		 216 aa  143  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0647  flavin-nucleotide-binding protein  42.64 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1567  flavin-nucleotide-binding protein-like protein  41.58 
 
 		 292 aa  142  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.612765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5541  hypothetical protein  38.69 
 
 		 220 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.418646 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1192  hypothetical protein  35.9 
 
 		 209 aa  139  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0972272  normal  0.237635 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2952  hypothetical protein  37.57 
 
 		 199 aa  132  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3004  hypothetical protein  41.05 
 
 		 234 aa  131  6.999999999999999e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1309  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN- binding  39.53 
 
 		 216 aa  127  8.000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.306682  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1256  hypothetical protein  42.68 
 
 		 179 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3467  hypothetical protein  43.52 
 
 		 228 aa  123  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0244411  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0082  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  38.64 
 
 		 210 aa  119  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5199  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  37.31 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5287  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  37.31 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5579  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  37.31 
 
 		 211 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.272111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4367  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  36.73 
 
 		 220 aa  112  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01781  conserved hypothetical protein  31.78 
 
 		 266 aa  105  5e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0345274 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2142  hypothetical protein  37.95 
 
 		 226 aa  103  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.595619  normal  0.0167174 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2966  flavin-nucleotide-binding protein-like  42.97 
 
 		 222 aa  99  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.840561 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1617  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  35.96 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2615  putative nitroimidazole resistance protein  29.73 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0041  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  27.21 
 
 		 152 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295446  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00340  hypothetical protein  26.72 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3858  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding protein  27.98 
 
 		 184 aa  54.7  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.788225  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1549  antibiotic resistance protein  30.48 
 
 		 177 aa  53.9  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3154  putative nitroimidazole resistance protein  32.67 
 
 		 154 aa  53.1  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0856  putative cytoplasmic protein  27.78 
 
 		 167 aa  51.6  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.141086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0759  putative 5-nitroimidazole antibiotic resistance  27.78 
 
 		 161 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.279608  normal  0.302454 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0820  hypothetical protein  27.08 
 
 		 167 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113166  normal  0.11136 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0746  putative cytoplasmic protein  27.08 
 
 		 161 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000242866  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0807  hypothetical protein  26.39 
 
 		 167 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0262203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1107  putative nitroimidazole resistance protein  30.69 
 
 		 154 aa  49.3  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2051  hypothetical protein  33.62 
 
 		 146 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0320963  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1951  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  27.78 
 
 		 182 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000305005  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0166  flavin-nucleotide-binding protein  26.85 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0289  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  29.57 
 
 		 157 aa  46.6  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2063  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  31.71 
 
 		 155 aa  45.1  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.20286 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1806  nitroimidazole resistance protein, putative  25.77 
 
 		 171 aa  44.7  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000286648  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20760  predicted flavin-nucleotide-binding protein  22.44 
 
 		 167 aa  43.1  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1986  putative nitroimidazole resistance protein  25.95 
 
 		 171 aa  42.7  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1296  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  24.66 
 
 		 157 aa  42  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.474408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>