87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1934 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1934  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  459  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0135128  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2785  hypothetical protein  58.22 
 
 
217 aa  261  4e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4532  hypothetical protein  57.43 
 
 
220 aa  243  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.427588  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7671  hypothetical protein  48.36 
 
 
214 aa  222  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42038  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1605  hypothetical protein  50.24 
 
 
217 aa  218  7e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.578023  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0558  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  50.73 
 
 
208 aa  213  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192313  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0647  flavin-nucleotide-binding protein  48.8 
 
 
229 aa  205  4e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5990  hypothetical protein  48.37 
 
 
215 aa  203  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1926  hypothetical protein  46.89 
 
 
219 aa  203  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4187  hypothetical protein  47.37 
 
 
212 aa  203  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.877149  normal  0.040626 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3120  hypothetical protein  52.29 
 
 
227 aa  202  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3493  hypothetical protein  45.24 
 
 
220 aa  197  7e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693999  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1479  hypothetical protein  47.62 
 
 
261 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0989  hypothetical protein  47.62 
 
 
261 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.856623  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1072  hypothetical protein  47.62 
 
 
261 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0134  hypothetical protein  47.62 
 
 
261 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0514  hypothetical protein  47.62 
 
 
261 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1397  hypothetical protein  47.62 
 
 
239 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2303  Uvs039  47.62 
 
 
239 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2201  flavin-nucleotide-binding protein  44.29 
 
 
216 aa  191  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.697368  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1692  hypothetical protein  47.39 
 
 
239 aa  192  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1909  hypothetical protein  50 
 
 
214 aa  191  6e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1387  hypothetical protein  44.19 
 
 
219 aa  191  9e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.61444  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3638  flavin-nucleotide-binding protein  45.41 
 
 
216 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.220848  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3889  flavin-nucleotide-binding protein  45.41 
 
 
216 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282164  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1567  flavin-nucleotide-binding protein-like protein  46.15 
 
 
292 aa  188  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.612765 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3754  hypothetical protein  45.81 
 
 
214 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1550  hypothetical protein  43.95 
 
 
227 aa  185  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0342013 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4542  hypothetical protein  47.12 
 
 
219 aa  185  6e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1256  hypothetical protein  51.74 
 
 
179 aa  185  6e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3056  hypothetical protein  50.54 
 
 
227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3402  hypothetical protein  50.54 
 
 
227 aa  182  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.278918 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2299  hypothetical protein  47.45 
 
 
210 aa  181  7e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13866  normal  0.499993 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49040  hypothetical protein  43.6 
 
 
223 aa  181  7e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6495  hypothetical protein  44.83 
 
 
240 aa  180  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5541  hypothetical protein  41.35 
 
 
220 aa  179  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.418646 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000555  predicted flavin-nucleotide-binding protein  43.33 
 
 
218 aa  177  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4477  flavin-nucleotide-binding protein  46.07 
 
 
189 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0086  hypothetical protein  43.98 
 
 
216 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05333  hypothetical protein  42.11 
 
 
218 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1192  hypothetical protein  40.82 
 
 
209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0972272  normal  0.237635 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2952  hypothetical protein  41.57 
 
 
199 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6845  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  42.27 
 
 
241 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2142  hypothetical protein  42.86 
 
 
226 aa  158  7e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.595619  normal  0.0167174 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3467  hypothetical protein  42.5 
 
 
228 aa  157  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0244411  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3004  hypothetical protein  42.03 
 
 
234 aa  156  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1309  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN- binding  40 
 
 
216 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.306682  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2966  flavin-nucleotide-binding protein-like  48.06 
 
 
222 aa  131  7.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.840561 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4367  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  39.36 
 
 
220 aa  121  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5579  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  35.82 
 
 
211 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.272111  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0082  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  35.57 
 
 
210 aa  112  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01781  conserved hypothetical protein  32.31 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0345274 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5199  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  34.83 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5287  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  34.83 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119354  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3154  putative nitroimidazole resistance protein  31.16 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1107  putative nitroimidazole resistance protein  30.43 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00340  hypothetical protein  29.57 
 
 
277 aa  62.4  0.000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1617  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  32 
 
 
176 aa  62  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0166  flavin-nucleotide-binding protein  26.55 
 
 
157 aa  59.3  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0041  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  29.13 
 
 
152 aa  58.9  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295446  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0219  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  24.59 
 
 
157 aa  57.4  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2615  putative nitroimidazole resistance protein  26.55 
 
 
152 aa  55.5  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1135  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  21.53 
 
 
152 aa  55.5  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.551955  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1951  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  25.64 
 
 
182 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000305005  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2339  hypothetical protein  26.56 
 
 
168 aa  52.4  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20760  predicted flavin-nucleotide-binding protein  27.92 
 
 
167 aa  51.6  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06490  predicted flavin-nucleotide-binding protein  26.23 
 
 
165 aa  51.2  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00239792  normal  0.449333 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1007  hypothetical protein  34.83 
 
 
154 aa  50.8  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.596538 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0471  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  27.18 
 
 
142 aa  50.4  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0514663  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1961  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  26.5 
 
 
157 aa  49.3  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988174  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1948  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  26.5 
 
 
157 aa  49.3  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0449472  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1296  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  25.81 
 
 
157 aa  49.3  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.474408  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1549  antibiotic resistance protein  28.21 
 
 
177 aa  48.9  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1739  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  23.77 
 
 
163 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000044515  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2417  nitroimidazole resistance protein, putative  25.22 
 
 
158 aa  46.6  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.608683  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1620  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  25.58 
 
 
156 aa  45.8  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0078  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  25.88 
 
 
158 aa  45.1  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3004  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding protein  27.21 
 
 
153 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1163  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  29.31 
 
 
157 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00783233  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2998  nitroimidazole resistance protein, putative  25.58 
 
 
180 aa  43.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2326  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  26.39 
 
 
156 aa  43.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2063  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  23.77 
 
 
155 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.20286 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0856  putative cytoplasmic protein  24.77 
 
 
167 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.141086  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0820  hypothetical protein  24.77 
 
 
167 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113166  normal  0.11136 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0759  putative 5-nitroimidazole antibiotic resistance  24.77 
 
 
161 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.279608  normal  0.302454 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0350  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  22.86 
 
 
170 aa  42  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.123938  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3858  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding protein  22.3 
 
 
184 aa  41.6  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.788225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>