71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4187 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4187  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  435  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.877149  normal  0.040626 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1934  hypothetical protein  47.37 
 
 
223 aa  203  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0135128  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0558  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  48.78 
 
 
208 aa  199  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192313  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0647  flavin-nucleotide-binding protein  51.17 
 
 
229 aa  194  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1567  flavin-nucleotide-binding protein-like protein  47.47 
 
 
292 aa  192  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.612765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7671  hypothetical protein  50.72 
 
 
214 aa  193  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42038  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1605  hypothetical protein  49.49 
 
 
217 aa  191  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.578023  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1926  hypothetical protein  43.75 
 
 
219 aa  176  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4532  hypothetical protein  45.69 
 
 
220 aa  169  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.427588  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1256  hypothetical protein  53.94 
 
 
179 aa  166  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4542  hypothetical protein  47.8 
 
 
219 aa  166  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3467  hypothetical protein  44.19 
 
 
228 aa  165  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0244411  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5990  hypothetical protein  43.72 
 
 
215 aa  164  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2201  flavin-nucleotide-binding protein  40.49 
 
 
216 aa  159  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.697368  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1909  hypothetical protein  42.13 
 
 
214 aa  159  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3120  hypothetical protein  46.67 
 
 
227 aa  159  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2785  hypothetical protein  45.7 
 
 
217 aa  158  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1692  hypothetical protein  44.79 
 
 
239 aa  157  9e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3638  flavin-nucleotide-binding protein  38.81 
 
 
216 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.220848  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1397  hypothetical protein  44.33 
 
 
239 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3004  hypothetical protein  43.19 
 
 
234 aa  157  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3889  flavin-nucleotide-binding protein  38.81 
 
 
216 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282164  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2303  Uvs039  44.33 
 
 
239 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0514  hypothetical protein  44.33 
 
 
261 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0134  hypothetical protein  44.33 
 
 
261 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1072  hypothetical protein  44.33 
 
 
261 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0989  hypothetical protein  44.33 
 
 
261 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.856623  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1479  hypothetical protein  44.33 
 
 
261 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3493  hypothetical protein  43.63 
 
 
220 aa  156  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693999  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6495  hypothetical protein  42.47 
 
 
240 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3402  hypothetical protein  45.86 
 
 
227 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.278918 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3056  hypothetical protein  45.86 
 
 
227 aa  153  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2299  hypothetical protein  40.82 
 
 
210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13866  normal  0.499993 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1387  hypothetical protein  39.23 
 
 
219 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.61444  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5541  hypothetical protein  39.71 
 
 
220 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.418646 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1192  hypothetical protein  36.68 
 
 
209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0972272  normal  0.237635 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49040  hypothetical protein  39.23 
 
 
223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3754  hypothetical protein  40.4 
 
 
214 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2142  hypothetical protein  43.96 
 
 
226 aa  142  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.595619  normal  0.0167174 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4477  flavin-nucleotide-binding protein  39.2 
 
 
189 aa  141  8e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2952  hypothetical protein  38.38 
 
 
199 aa  139  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0086  hypothetical protein  37.5 
 
 
216 aa  137  7.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000555  predicted flavin-nucleotide-binding protein  37.57 
 
 
218 aa  135  6.0000000000000005e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1550  hypothetical protein  42.52 
 
 
227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0342013 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05333  hypothetical protein  37.37 
 
 
218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6845  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  37.84 
 
 
241 aa  132  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2966  flavin-nucleotide-binding protein-like  40.14 
 
 
222 aa  119  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.840561 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1309  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN- binding  37.23 
 
 
216 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.306682  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4367  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  38.24 
 
 
220 aa  104  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0082  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  38.73 
 
 
210 aa  101  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01781  conserved hypothetical protein  31.53 
 
 
266 aa  94.4  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0345274 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5579  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  32.86 
 
 
211 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.272111  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5199  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  32.38 
 
 
211 aa  85.5  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5287  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  32.38 
 
 
211 aa  85.5  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119354  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1617  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  32.03 
 
 
176 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2615  putative nitroimidazole resistance protein  26.58 
 
 
152 aa  56.6  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0041  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  29.71 
 
 
152 aa  53.1  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295446  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2731  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  29.3 
 
 
205 aa  52.4  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.560885  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3858  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding protein  25.53 
 
 
184 aa  51.2  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.788225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1107  putative nitroimidazole resistance protein  26.9 
 
 
154 aa  49.7  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1948  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  24.48 
 
 
157 aa  48.5  0.00007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0449472  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1951  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  29.46 
 
 
182 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000305005  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3154  putative nitroimidazole resistance protein  27.34 
 
 
154 aa  47.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0166  flavin-nucleotide-binding protein  24.65 
 
 
157 aa  45.4  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0048  GCN5-related N-acetyltransferase  27.01 
 
 
359 aa  45.1  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1961  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  23.13 
 
 
157 aa  44.7  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988174  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2998  nitroimidazole resistance protein, putative  29.29 
 
 
180 aa  44.3  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1824  hypothetical protein  30.08 
 
 
176 aa  42.4  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3004  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding protein  28.36 
 
 
153 aa  42  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1549  antibiotic resistance protein  30.61 
 
 
177 aa  42  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0060  GCN5-related N-acetyltransferase  26.07 
 
 
361 aa  41.6  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.461775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>