75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1192 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1192  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  434  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0972272  normal  0.237635 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0558  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  61 
 
 		 208 aa  261  4e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4532  hypothetical protein  43.01 
 
 		 220 aa  175  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.427588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1934  hypothetical protein  40.82 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0135128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3754  hypothetical protein  42.49 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5990  hypothetical protein  38.92 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1926  hypothetical protein  35.9 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1909  hypothetical protein  37.17 
 
 		 214 aa  155  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7671  hypothetical protein  36.5 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2785  hypothetical protein  39.01 
 
 		 217 aa  152  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2201  flavin-nucleotide-binding protein  37.5 
 
 		 216 aa  150  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.697368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3493  hypothetical protein  40.66 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693999  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3638  flavin-nucleotide-binding protein  37.91 
 
 		 216 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.220848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4477  flavin-nucleotide-binding protein  37.91 
 
 		 189 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3889  flavin-nucleotide-binding protein  37.91 
 
 		 216 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4187  hypothetical protein  36.68 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.877149  normal  0.040626 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0989  hypothetical protein  38.02 
 
 		 261 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.856623  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0514  hypothetical protein  38.02 
 
 		 261 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0134  hypothetical protein  38.02 
 
 		 261 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1072  hypothetical protein  38.02 
 
 		 261 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1479  hypothetical protein  38.02 
 
 		 261 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2303  Uvs039  38.02 
 
 		 239 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1397  hypothetical protein  38.02 
 
 		 239 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1605  hypothetical protein  37.3 
 
 		 217 aa  145  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.578023  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1692  hypothetical protein  38.02 
 
 		 239 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6495  hypothetical protein  36.72 
 
 		 240 aa  141  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2299  hypothetical protein  35.9 
 
 		 210 aa  139  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13866  normal  0.499993 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4542  hypothetical protein  36.68 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6845  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  36.81 
 
 		 241 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0647  flavin-nucleotide-binding protein  31.5 
 
 		 229 aa  134  7.000000000000001e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3056  hypothetical protein  40.7 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3120  hypothetical protein  37.5 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0086  hypothetical protein  36.04 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1387  hypothetical protein  33.16 
 
 		 219 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.61444  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3402  hypothetical protein  38.95 
 
 		 227 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.278918 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1256  hypothetical protein  36.36 
 
 		 179 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3004  hypothetical protein  35.96 
 
 		 234 aa  124  7e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49040  hypothetical protein  32.16 
 
 		 223 aa  124  8.000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5541  hypothetical protein  28.72 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.418646 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1567  flavin-nucleotide-binding protein-like protein  34.41 
 
 		 292 aa  119  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.612765 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000555  predicted flavin-nucleotide-binding protein  31.67 
 
 		 218 aa  118  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2952  hypothetical protein  32.37 
 
 		 199 aa  115  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3467  hypothetical protein  32.35 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0244411  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05333  hypothetical protein  29.44 
 
 		 218 aa  112  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1309  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN- binding  35.26 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.306682  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2142  hypothetical protein  32.67 
 
 		 226 aa  106  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.595619  normal  0.0167174 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0082  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  32.62 
 
 		 210 aa  106  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4367  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  33.83 
 
 		 220 aa  105  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1550  hypothetical protein  32.21 
 
 		 227 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0342013 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2966  flavin-nucleotide-binding protein-like  37.42 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.840561 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5287  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  29.03 
 
 		 211 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5579  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  29.03 
 
 		 211 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.272111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5199  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  29.03 
 
 		 211 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01781  conserved hypothetical protein  30.86 
 
 		 266 aa  92.8  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0345274 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1951  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  30.71 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000305005  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1296  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  29.03 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.474408  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1007  hypothetical protein  29.66 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.596538 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1549  antibiotic resistance protein  27.2 
 
 		 177 aa  52.4  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0041  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  25.36 
 
 		 152 aa  50.8  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1617  5-nitroimidazole antibiotic resistance protein  26.36 
 
 		 176 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2731  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  26.19 
 
 		 205 aa  48.1  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.560885  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2615  putative nitroimidazole resistance protein  26.27 
 
 		 152 aa  47.8  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0078  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  29.03 
 
 		 158 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1948  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  30.08 
 
 		 157 aa  47  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0449472  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2339  hypothetical protein  29.17 
 
 		 168 aa  46.2  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1739  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  30.91 
 
 		 163 aa  45.1  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000044515  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00340  hypothetical protein  27.92 
 
 		 277 aa  44.3  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2063  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  25 
 
 		 155 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.20286 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1961  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  26.36 
 
 		 157 aa  43.9  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988174  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1620  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  25 
 
 		 156 aa  43.5  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  29.51 
 
 		 158 aa  42  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3154  putative nitroimidazole resistance protein  20.86 
 
 		 154 aa  42  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20760  predicted flavin-nucleotide-binding protein  22.5 
 
 		 167 aa  42  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0350  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  26.88 
 
 		 170 aa  41.6  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.123938  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2326  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  23.81 
 
 		 156 aa  41.2  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>